130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1540 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1540  TonB-dependent receptor, putative  100 
 
 		 730 aa  1511    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1253  TonB-dependent receptor, putative  64.3 
 
 		 740 aa  1009    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0080071  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0440  TonB-dependent receptor, putative  70.86 
 
 		 734 aa  1096    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0676  TonB-dependent receptor  67.91 
 
 		 756 aa  1061    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.102109  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1997  TonB-dependent receptor, putative  69.92 
 
 		 741 aa  1067    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0160  outer membrane receptor protein  33.42 
 
 		 740 aa  420  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2061  TonB-dependent receptor  33.61 
 
 		 742 aa  405  1e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.302386  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  33.62 
 
 		 790 aa  373  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1483  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 754 aa  355  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1198  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 754 aa  355  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211844 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 786 aa  350  7e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0369  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 782 aa  337  5e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 729 aa  173  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 736 aa  163  8.000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1199  hypothetical protein  31.45 
 
 		 398 aa  147  8.000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052926 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1484  hypothetical protein  31.45 
 
 		 398 aa  147  8.000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 753 aa  105  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  22.01 
 
 		 765 aa  105  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3467  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 285 aa  104  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  22.61 
 
 		 746 aa  100  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  23.01 
 
 		 738 aa  100  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  23.01 
 
 		 738 aa  100  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  23.37 
 
 		 768 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  21.62 
 
 		 780 aa  90.5  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  20.84 
 
 		 747 aa  89.4  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  22.34 
 
 		 766 aa  85.5  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  28.63 
 
 		 766 aa  85.5  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  21.68 
 
 		 777 aa  77.4  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 747 aa  75.9  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 828 aa  75.1  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  22.06 
 
 		 815 aa  66.6  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 768 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2134  TonB-dependent receptor plug  23.68 
 
 		 781 aa  64.7  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.682313 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  24.91 
 
 		 760 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 786 aa  63.5  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 791 aa  63.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 768 aa  63.5  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  24.91 
 
 		 760 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 772 aa  61.6  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 796 aa  60.8  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1899  TonB-dependent receptor, putative  22.39 
 
 		 794 aa  58.5  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 799 aa  57.4  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  27.21 
 
 		 797 aa  57  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 777 aa  56.6  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 670 aa  55.5  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0231  TonB-dependent siderophore receptor  22.54 
 
 		 771 aa  55.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 792 aa  55.1  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  28.27 
 
 		 779 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 804 aa  54.3  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1486  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 693 aa  54.3  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  24.19 
 
 		 677 aa  54.3  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  23.99 
 
 		 729 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  23.79 
 
 		 714 aa  53.5  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  23.79 
 
 		 714 aa  53.9  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  26.17 
 
 		 829 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 775 aa  53.5  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  23.99 
 
 		 710 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 803 aa  52.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 798 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1702  TonB-dependent receptor  20.41 
 
 		 787 aa  51.6  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0960904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2040  TonB-dependent receptor  20.41 
 
 		 787 aa  51.6  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 835 aa  51.2  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  23.91 
 
 		 708 aa  51.6  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 705 aa  51.6  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5560  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 739 aa  50.8  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4755  TonB-dependent siderophore receptor  26.92 
 
 		 797 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.251254  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  22.43 
 
 		 738 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4624  TonB-dependent siderophore receptor  26.92 
 
 		 797 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185618  decreased coverage  0.0000000123032 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  23.28 
 
 		 752 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3784  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 772 aa  50.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.562566 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 828 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 789 aa  49.3  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 706 aa  49.3  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 712 aa  49.7  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  24.67 
 
 		 729 aa  49.7  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 778 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4761  TonB-dependent siderophore receptor  28 
 
 		 797 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4420  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 762 aa  48.5  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  20.67 
 
 		 680 aa  48.1  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  21.75 
 
 		 742 aa  48.1  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 820 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2634  TonB-dependent receptor plug  24.72 
 
 		 814 aa  48.1  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  24.55 
 
 		 701 aa  47.8  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  22.28 
 
 		 794 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 713 aa  47.4  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3585  ferrichrome receptor precursor protein  23.04 
 
 		 718 aa  47.4  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.885271  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  26.46 
 
 		 799 aa  47.4  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2519  TonB-dependent receptor  21.16 
 
 		 782 aa  47.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131105 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  24.55 
 
 		 701 aa  47.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  22.78 
 
 		 747 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  28.43 
 
 		 767 aa  47  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  24.42 
 
 		 701 aa  47  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  22.78 
 
 		 747 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  22.69 
 
 		 706 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 841 aa  46.6  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2585  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 790 aa  46.2  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0776775  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 782 aa  46.2  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0089  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 		 699 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.26085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 742 aa  46.2  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  26.43 
 
 		 817 aa  46.2  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>