61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3784 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3784  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 772 aa  1583    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.562566 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 		 835 aa  332  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 799 aa  218  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 777 aa  209  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 738 aa  199  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 738 aa  199  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 753 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 747 aa  177  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 792 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 766 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 765 aa  163  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 777 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  23.52 
 
 		 768 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 768 aa  154  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 772 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2634  TonB-dependent receptor plug  24.36 
 
 		 814 aa  140  7e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  22.67 
 
 		 815 aa  94.4  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  20.91 
 
 		 786 aa  77  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  21.69 
 
 		 780 aa  70.9  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  20.97 
 
 		 747 aa  69.3  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  22.1 
 
 		 768 aa  68.6  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  30 
 
 		 766 aa  65.1  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 828 aa  63.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 729 aa  58.9  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 746 aa  58.5  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  26.84 
 
 		 760 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  25 
 
 		 760 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 806 aa  52.8  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 		 747 aa  51.2  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 		 747 aa  50.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1651  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 648 aa  50.8  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613844 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 		 747 aa  50.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 		 748 aa  50.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1540  TonB-dependent receptor, putative  29.9 
 
 		 730 aa  50.4  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 		 747 aa  50.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  27.6 
 
 		 772 aa  49.7  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3410  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 781 aa  49.7  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  22.9 
 
 		 753 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6547  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 791 aa  48.5  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  21.15 
 
 		 753 aa  48.1  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4420  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 762 aa  47.8  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1253  TonB-dependent receptor, putative  24.48 
 
 		 740 aa  47.8  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0080071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  21.3 
 
 		 798 aa  47.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0794  TonB-dependent siderophore receptor  23.12 
 
 		 749 aa  47.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.038915  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  26.56 
 
 		 747 aa  47.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2608  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 824 aa  46.2  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2998  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 799 aa  46.2  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  23.92 
 
 		 645 aa  45.8  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0198  outer membrane ferric siderophore receptor  27.08 
 
 		 748 aa  45.8  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0160883  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 841 aa  45.8  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  25.93 
 
 		 747 aa  45.8  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 748 aa  45.8  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  27.08 
 
 		 748 aa  45.8  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 791 aa  45.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  22.18 
 
 		 796 aa  45.4  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1447  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 632 aa  45.1  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1495  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 792 aa  45.1  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879614 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 736 aa  44.7  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1899  TonB-dependent receptor, putative  29.59 
 
 		 794 aa  44.7  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.27 
 
 		 615 aa  44.3  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 712 aa  44.3  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>