More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0702 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 729 aa  1472    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  41.8 
 
 		 736 aa  531  1e-149  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 790 aa  265  3e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1483  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 754 aa  261  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1198  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 754 aa  261  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211844 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0160  outer membrane receptor protein  29.12 
 
 		 740 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 786 aa  231  4e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  26.34 
 
 		 760 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  26.92 
 
 		 760 aa  200  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 815 aa  196  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 747 aa  183  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0440  TonB-dependent receptor, putative  25.89 
 
 		 734 aa  181  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0369  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 782 aa  179  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 746 aa  178  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0676  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 756 aa  174  5e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.102109  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 738 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 738 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1540  TonB-dependent receptor, putative  26.33 
 
 		 730 aa  172  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1997  TonB-dependent receptor, putative  26.02 
 
 		 741 aa  167  9e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1253  TonB-dependent receptor, putative  23.17 
 
 		 740 aa  161  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0080071  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2061  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 742 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.302386  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 777 aa  146  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 798 aa  145  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 766 aa  144  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2519  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 782 aa  141  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131105 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 747 aa  138  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 799 aa  137  7.000000000000001e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  33.62 
 
 		 828 aa  133  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 772 aa  130  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 792 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  25.69 
 
 		 768 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  22.64 
 
 		 786 aa  129  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 765 aa  127  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.54 
 
 		 766 aa  122  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  21.98 
 
 		 768 aa  121  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 841 aa  120  9e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1484  hypothetical protein  35.34 
 
 		 398 aa  114  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1199  hypothetical protein  35.34 
 
 		 398 aa  114  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052926 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2634  TonB-dependent receptor plug  22.15 
 
 		 814 aa  113  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 780 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4420  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 762 aa  111  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  22.82 
 
 		 796 aa  105  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 753 aa  104  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2134  TonB-dependent receptor plug  24.19 
 
 		 781 aa  104  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.682313 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 791 aa  95.9  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1941  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 735 aa  95.1  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.299321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2298  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 735 aa  95.1  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.951085  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 835 aa  95.1  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3467  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 285 aa  89  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 777 aa  86.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  33.73 
 
 		 768 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02852  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 808 aa  82  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1492  TonB-dependent receptor  20.32 
 
 		 711 aa  80.1  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1495  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 792 aa  76.6  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879614 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  22.44 
 
 		 730 aa  76.6  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2147  TonB-dependent receptor  22.64 
 
 		 760 aa  75.9  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  28.09 
 
 		 796 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  28.69 
 
 		 809 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 706 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2585  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 790 aa  71.6  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0776775  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  30.38 
 
 		 855 aa  70.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  30.38 
 
 		 855 aa  70.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  24.83 
 
 		 810 aa  70.1  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  24.47 
 
 		 829 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  25.96 
 
 		 796 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  26.38 
 
 		 796 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  22.76 
 
 		 797 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  28.24 
 
 		 708 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  24.04 
 
 		 721 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  29.96 
 
 		 858 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  21.76 
 
 		 706 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  22.92 
 
 		 753 aa  68.6  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  26.38 
 
 		 796 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  26.53 
 
 		 726 aa  68.6  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  24.04 
 
 		 706 aa  68.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  27.08 
 
 		 703 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  24.04 
 
 		 706 aa  68.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  24.04 
 
 		 706 aa  68.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 		 797 aa  67.8  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  22.27 
 
 		 694 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  22.9 
 
 		 742 aa  67.8  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  28.81 
 
 		 863 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 795 aa  67  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  27.24 
 
 		 708 aa  65.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3410  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 781 aa  66.6  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  29.24 
 
 		 742 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  24.7 
 
 		 703 aa  65.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  24.7 
 
 		 703 aa  65.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  25.31 
 
 		 721 aa  65.1  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  25.94 
 
 		 714 aa  65.5  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4239  TonB-dependent siderophore receptor  30.77 
 
 		 781 aa  65.1  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.475083 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  25.94 
 
 		 714 aa  65.5  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  24.7 
 
 		 729 aa  65.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  25.52 
 
 		 677 aa  64.7  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 795 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  25.1 
 
 		 810 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  27.87 
 
 		 806 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  20.46 
 
 		 728 aa  64.3  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  25.1 
 
 		 710 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 706 aa  63.9  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>