More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3042 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 841 aa  1707    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  40.64 
 
 		 828 aa  567  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 815 aa  196  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  26.04 
 
 		 760 aa  193  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  26.25 
 
 		 760 aa  188  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 786 aa  185  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 747 aa  184  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 746 aa  164  7e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 798 aa  144  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 729 aa  120  9e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 		 736 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 766 aa  112  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 768 aa  110  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 777 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 		 792 aa  107  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  28.51 
 
 		 766 aa  103  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 747 aa  103  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 738 aa  101  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 738 aa  101  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 768 aa  100  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  26.2 
 
 		 768 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 765 aa  92.8  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 835 aa  92.8  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 777 aa  91.7  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 799 aa  91.3  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 786 aa  85.5  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1483  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 754 aa  82.8  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1198  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 754 aa  82.8  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 753 aa  81.3  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2134  TonB-dependent receptor plug  27.62 
 
 		 781 aa  80.9  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.682313 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 772 aa  80.5  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2519  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 782 aa  80.1  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 791 aa  77.4  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  28.62 
 
 		 796 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 790 aa  76.3  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0160  outer membrane receptor protein  28.47 
 
 		 740 aa  75.1  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3410  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 781 aa  74.7  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 796 aa  75.1  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 		 810 aa  74.3  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  26.49 
 
 		 702 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  26.49 
 
 		 702 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0369  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 782 aa  70.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 769 aa  70.1  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 780 aa  70.1  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1166  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 765 aa  69.3  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3462  hypothetical protein  32.32 
 
 		 797 aa  67.8  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.385249 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  26.53 
 
 		 796 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  26.53 
 
 		 796 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  26.87 
 
 		 713 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  26.19 
 
 		 796 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  27.24 
 
 		 713 aa  66.6  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 		 778 aa  65.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  25.25 
 
 		 809 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  25.1 
 
 		 724 aa  65.1  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4420  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 762 aa  64.7  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4239  TonB-dependent siderophore receptor  28.16 
 
 		 781 aa  64.7  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.475083 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1492  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 711 aa  64.7  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1301  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 634 aa  64.3  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  26.97 
 
 		 707 aa  63.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1253  TonB-dependent receptor, putative  23.76 
 
 		 740 aa  63.5  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0080071  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 732 aa  63.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2634  TonB-dependent receptor plug  32.64 
 
 		 814 aa  63.2  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.31 
 
 		 706 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  26.46 
 
 		 705 aa  62  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  24.35 
 
 		 743 aa  62.4  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3362  tonB-dependent receptor family protein  31.02 
 
 		 813 aa  62  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0573796  normal  0.429192 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1207  TonB-dependent receptor plug  24.68 
 
 		 239 aa  62  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000259901 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2585  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 790 aa  61.6  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0776775  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 751 aa  60.8  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  26.07 
 
 		 705 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 807 aa  60.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 680 aa  60.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  25.32 
 
 		 713 aa  59.7  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  25.56 
 
 		 701 aa  59.7  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0074  heme receptor HutR  27.86 
 
 		 713 aa  59.7  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0136209  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2832  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 768 aa  59.3  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3229  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 768 aa  59.3  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  26.91 
 
 		 708 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  25.37 
 
 		 724 aa  59.3  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0440  TonB-dependent receptor, putative  24.79 
 
 		 734 aa  59.3  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 795 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 795 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  28.45 
 
 		 742 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 757 aa  57.8  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  25.89 
 
 		 792 aa  57.8  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 723 aa  57.8  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29 
 
 		 703 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1430  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 738 aa  57.4  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 		 766 aa  57.4  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  24.23 
 
 		 755 aa  57.4  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 759 aa  57.4  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0901  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 735 aa  57.4  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3638  TonB-dependent receptor, putative  23.89 
 
 		 739 aa  57  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240989 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  26.59 
 
 		 709 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  28.64 
 
 		 692 aa  57  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1588  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 716 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  28.27 
 
 		 881 aa  56.6  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  28.27 
 
 		 881 aa  56.6  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 		 701 aa  57  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  28.27 
 
 		 882 aa  56.6  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>