139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2269 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  53.97 
 
 		 777 aa  810    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 772 aa  1585    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  51.13 
 
 		 765 aa  727    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  43.25 
 
 		 747 aa  564  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  41.69 
 
 		 768 aa  525  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  40.54 
 
 		 768 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  40.13 
 
 		 777 aa  480  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  36.97 
 
 		 738 aa  444  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  36.97 
 
 		 738 aa  444  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  34.89 
 
 		 753 aa  372  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  35.47 
 
 		 792 aa  368  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  33.16 
 
 		 766 aa  304  4.0000000000000003e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  33.07 
 
 		 799 aa  300  7e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2634  TonB-dependent receptor plug  29.94 
 
 		 814 aa  263  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 796 aa  229  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 780 aa  228  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 768 aa  211  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 835 aa  174  5.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4420  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 762 aa  171  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 747 aa  168  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 791 aa  167  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 828 aa  165  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 815 aa  155  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 746 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3784  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 772 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.562566 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2585  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 790 aa  142  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0776775  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  23.97 
 
 		 766 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 798 aa  134  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 729 aa  133  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  23.75 
 
 		 760 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3410  TonB-dependent receptor  22.77 
 
 		 781 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2519  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 782 aa  127  8.000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  24.71 
 
 		 760 aa  127  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2061  TonB-dependent receptor  21.98 
 
 		 742 aa  89.4  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.302386  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1495  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 792 aa  89  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879614 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 736 aa  88.2  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 786 aa  84.3  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 841 aa  78.2  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1166  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 765 aa  77.4  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02852  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 		 808 aa  74.7  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2134  TonB-dependent receptor plug  24.12 
 
 		 781 aa  72  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.682313 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 786 aa  70.5  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1253  TonB-dependent receptor, putative  25.99 
 
 		 740 aa  68.2  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0080071  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 790 aa  65.1  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3229  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 768 aa  62  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0952  TonB-dependent siderophore receptor  25.35 
 
 		 729 aa  62  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000770151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2832  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 768 aa  62  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0988  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 731 aa  61.2  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00021194  normal  0.772446 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1540  TonB-dependent receptor, putative  29.1 
 
 		 730 aa  61.2  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  24.3 
 
 		 696 aa  60.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0440  TonB-dependent receptor, putative  29.31 
 
 		 734 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3467  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 285 aa  59.7  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2298  TonB-dependent receptor  21.13 
 
 		 735 aa  58.9  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.951085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1941  TonB-dependent receptor  21.13 
 
 		 735 aa  58.9  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.299321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1937  TonB-dependent receptor  21.69 
 
 		 773 aa  58.9  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00253489  normal  0.908818 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2292  TonB-dependent receptor  21.69 
 
 		 773 aa  58.9  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1492  TonB-dependent receptor  20 
 
 		 711 aa  58.5  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 705 aa  56.2  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0676  TonB-dependent receptor  20.51 
 
 		 756 aa  56.6  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.102109  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1997  TonB-dependent receptor, putative  26.47 
 
 		 741 aa  56.2  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  26.2 
 
 		 640 aa  55.8  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0950  TonB-dependent siderophore receptor  25.26 
 
 		 723 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000152119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  25.9 
 
 		 675 aa  53.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4239  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 781 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.475083 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  22.67 
 
 		 793 aa  53.5  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2356  TonB-dependent siderophore receptor  25.88 
 
 		 700 aa  52  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.084285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  24.09 
 
 		 722 aa  52  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  24.22 
 
 		 1071 aa  51.6  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003321  ferrichrome-iron receptor  23.6 
 
 		 711 aa  52  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 		 828 aa  51.6  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 717 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  33.81 
 
 		 769 aa  51.2  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1472  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 683 aa  50.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.907424  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3326  TonB-dependent receptor, plug  29.45 
 
 		 737 aa  50.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.686308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0763  TonB-dependent receptor, putative  26.61 
 
 		 778 aa  50.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0908  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 778 aa  50.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 987 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0252  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 663 aa  50.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.945527  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  24.62 
 
 		 807 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  23.1 
 
 		 680 aa  50.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  22.08 
 
 		 729 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  21.02 
 
 		 809 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0705  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 799 aa  50.1  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000765865  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 700 aa  48.9  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 665 aa  48.5  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1588  TonB-dependent receptor  20.83 
 
 		 716 aa  48.9  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1978  colicin I receptor  24.61 
 
 		 351 aa  48.9  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1481  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 674 aa  48.5  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0173398  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  26.82 
 
 		 698 aa  48.1  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  25.64 
 
 		 717 aa  48.1  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2941  TonB-dependent receptor  22.19 
 
 		 701 aa  47.8  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.80569  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 681 aa  47.8  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.5 
 
 		 706 aa  47  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2294  TonB-dependent siderophore receptor  25.65 
 
 		 773 aa  47.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  28.95 
 
 		 723 aa  47  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3863  TonB-dependent siderophore receptor  22.7 
 
 		 733 aa  47.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000567085  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0295  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 799 aa  47  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  27.84 
 
 		 766 aa  47.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  25.71 
 
 		 778 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0907  TonB-dependent siderophore receptor  22.98 
 
 		 712 aa  47  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892024  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>