283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1495 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1495  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 792 aa  1611    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879614 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3410  TonB-dependent receptor  40.91 
 
 		 781 aa  587  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02852  TonB-dependent receptor  39.78 
 
 		 808 aa  560  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2585  TonB-dependent receptor  39.69 
 
 		 790 aa  553  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0776775  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4420  TonB-dependent receptor  38.17 
 
 		 762 aa  504  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 791 aa  184  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 747 aa  181  5.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 765 aa  176  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 792 aa  161  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 777 aa  160  8e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 738 aa  153  8.999999999999999e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 738 aa  153  8.999999999999999e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 753 aa  127  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 780 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 777 aa  123  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2634  TonB-dependent receptor plug  23.91 
 
 		 814 aa  120  9e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  32.96 
 
 		 768 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  32.58 
 
 		 768 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  24.04 
 
 		 760 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 766 aa  110  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  22.56 
 
 		 760 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  25.95 
 
 		 693 aa  91.7  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 772 aa  89.4  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 729 aa  81.6  0.00000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  34.21 
 
 		 835 aa  80.9  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 799 aa  79.7  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 796 aa  77  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  24.14 
 
 		 708 aa  76.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.96 
 
 		 766 aa  75.5  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 828 aa  71.6  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  32.08 
 
 		 701 aa  70.9  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 768 aa  68.9  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  28.05 
 
 		 705 aa  68.9  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 700 aa  68.2  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  31.14 
 
 		 736 aa  68.2  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  23.15 
 
 		 776 aa  68.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  29.51 
 
 		 717 aa  67.8  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2519  TonB-dependent receptor  31.01 
 
 		 782 aa  67.4  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131105 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  30.28 
 
 		 735 aa  66.6  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  24.07 
 
 		 797 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 747 aa  65.1  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  34.48 
 
 		 704 aa  65.1  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 736 aa  65.1  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  30.82 
 
 		 696 aa  65.1  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  32.72 
 
 		 703 aa  65.1  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  30.82 
 
 		 696 aa  64.7  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  30.82 
 
 		 698 aa  64.7  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  30.82 
 
 		 696 aa  64.7  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  30.82 
 
 		 696 aa  64.7  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2391  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 762 aa  64.3  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  24.57 
 
 		 680 aa  64.3  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  27.07 
 
 		 715 aa  63.9  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  30.49 
 
 		 705 aa  63.5  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  27.36 
 
 		 828 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 700 aa  63.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4121  TonB-dependent siderophore receptor  25.68 
 
 		 785 aa  63.5  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.922703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 798 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 815 aa  62.8  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4026  TonB-dependent siderophore receptor  24.52 
 
 		 755 aa  62.4  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.865466  normal  0.196913 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 828 aa  62.4  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  28.63 
 
 		 740 aa  62  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  25.4 
 
 		 713 aa  61.6  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  25.15 
 
 		 753 aa  61.6  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4489  TonB-dependent siderophore receptor  25.29 
 
 		 785 aa  61.6  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2678  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 704 aa  61.2  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00160385  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 705 aa  61.2  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  22.97 
 
 		 786 aa  61.2  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  25.24 
 
 		 711 aa  61.2  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  26.03 
 
 		 789 aa  60.8  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  26.63 
 
 		 828 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4395  TonB-dependent siderophore receptor  24.84 
 
 		 756 aa  59.3  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  26.95 
 
 		 728 aa  59.3  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  21.98 
 
 		 714 aa  59.3  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 841 aa  58.9  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0909  ferrioxamine B receptor  27.48 
 
 		 716 aa  58.9  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2941  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 701 aa  58.9  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.80569  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 782 aa  58.9  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  23.38 
 
 		 675 aa  58.5  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 746 aa  58.2  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4099  TonB-dependent siderophore receptor  24.08 
 
 		 743 aa  58.2  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0727583  decreased coverage  0.00321586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4602  TonB-dependent siderophore receptor  35.06 
 
 		 784 aa  58.2  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 820 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  26.16 
 
 		 799 aa  57.8  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  23.8 
 
 		 809 aa  57.8  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 721 aa  57.8  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 807 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2636  TonB-dependent siderophore receptor  25.84 
 
 		 776 aa  57  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 		 696 aa  57  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 721 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4755  TonB-dependent siderophore receptor  23.23 
 
 		 797 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.251254  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  24.83 
 
 		 745 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 794 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003321  ferrichrome-iron receptor  33.96 
 
 		 711 aa  56.6  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  22.19 
 
 		 784 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  24.37 
 
 		 828 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3191  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 720 aa  55.8  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126534  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4798  TonB-dependent siderophore receptor  24.32 
 
 		 724 aa  55.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  26.77 
 
 		 822 aa  55.5  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  30.09 
 
 		 778 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  28.5 
 
 		 808 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>