281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3363 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  51.13 
 
 		 772 aa  726    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  51.84 
 
 		 747 aa  713    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 765 aa  1574    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  43.28 
 
 		 777 aa  588  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  43.73 
 
 		 768 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  43.2 
 
 		 768 aa  549  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  42.47 
 
 		 738 aa  551  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  42.47 
 
 		 738 aa  551  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  40.03 
 
 		 777 aa  501  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  38.45 
 
 		 792 aa  447  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  36.84 
 
 		 753 aa  430  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  37.37 
 
 		 766 aa  406  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  33.86 
 
 		 799 aa  344  2.9999999999999997e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2634  TonB-dependent receptor plug  31.15 
 
 		 814 aa  290  9e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 796 aa  229  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4420  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 762 aa  222  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 768 aa  218  4e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 780 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 835 aa  209  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1495  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 792 aa  168  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879614 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02852  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 808 aa  168  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3784  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 772 aa  162  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.562566 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2519  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 782 aa  162  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 791 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 786 aa  133  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  22.96 
 
 		 747 aa  129  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 729 aa  127  6e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 746 aa  123  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1253  TonB-dependent receptor, putative  22.11 
 
 		 740 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0080071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 798 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 		 828 aa  116  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3410  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 781 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2585  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 790 aa  108  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0776775  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0440  TonB-dependent receptor, putative  21.85 
 
 		 734 aa  108  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1540  TonB-dependent receptor, putative  22.01 
 
 		 730 aa  105  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 815 aa  99  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2061  TonB-dependent receptor  21.7 
 
 		 742 aa  96.7  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.302386  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2134  TonB-dependent receptor plug  22.66 
 
 		 781 aa  95.5  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.682313 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 		 790 aa  95.1  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0160  outer membrane receptor protein  23.03 
 
 		 740 aa  90.5  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 841 aa  90.5  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1997  TonB-dependent receptor, putative  21 
 
 		 741 aa  89.4  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 721 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 721 aa  85.1  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  23.22 
 
 		 760 aa  84  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.86 
 
 		 766 aa  84  0.000000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 736 aa  82.4  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0676  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 756 aa  81.3  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.102109  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 		 786 aa  80.9  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  23.54 
 
 		 760 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  22.57 
 
 		 701 aa  73.9  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  27.86 
 
 		 831 aa  71.2  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1989  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 675 aa  70.9  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000419445  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  22.79 
 
 		 696 aa  69.7  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2040  TonB-dependent receptor  22.02 
 
 		 787 aa  67.4  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1702  TonB-dependent receptor  22.02 
 
 		 787 aa  67.4  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0960904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2832  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 768 aa  65.9  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3229  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 768 aa  65.9  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  26.18 
 
 		 809 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  26.1 
 
 		 809 aa  63.9  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1166  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 		 765 aa  64.3  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  24.15 
 
 		 728 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  23.71 
 
 		 809 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  23.37 
 
 		 723 aa  63.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  24.17 
 
 		 696 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  24.93 
 
 		 809 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  24.17 
 
 		 696 aa  62.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  22.07 
 
 		 693 aa  62.4  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  24.17 
 
 		 698 aa  62.4  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  23.7 
 
 		 793 aa  61.2  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  24.17 
 
 		 696 aa  60.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  25.38 
 
 		 720 aa  60.8  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  24.17 
 
 		 696 aa  60.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2266  TonB-dependent siderophore receptor  23.1 
 
 		 724 aa  60.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238084  normal  0.145177 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1937  TonB-dependent receptor  20.71 
 
 		 773 aa  60.1  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00253489  normal  0.908818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 		 799 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2292  TonB-dependent receptor  20.71 
 
 		 773 aa  60.1  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  23.52 
 
 		 703 aa  60.1  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  24.1 
 
 		 704 aa  59.3  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  29.03 
 
 		 797 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  23.18 
 
 		 729 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  24.5 
 
 		 728 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  22.78 
 
 		 749 aa  58.9  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  23.71 
 
 		 805 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  33.1 
 
 		 828 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  32.41 
 
 		 828 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  25.23 
 
 		 705 aa  57.8  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 764 aa  57.8  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  23.73 
 
 		 807 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  25.93 
 
 		 809 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  25.07 
 
 		 774 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 794 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0705  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 799 aa  55.8  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000765865  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  23.4 
 
 		 819 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3467  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 285 aa  55.8  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  32.17 
 
 		 828 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  23.33 
 
 		 746 aa  55.5  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1941  TonB-dependent receptor  21.95 
 
 		 735 aa  55.5  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.299321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  25.41 
 
 		 711 aa  55.5  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  25.07 
 
 		 774 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>