70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1253 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0676  TonB-dependent receptor  71.09 
 
 		 756 aa  1091    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.102109  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0440  TonB-dependent receptor, putative  70.04 
 
 		 734 aa  1091    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1997  TonB-dependent receptor, putative  72.8 
 
 		 741 aa  1105    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1540  TonB-dependent receptor, putative  64.76 
 
 		 730 aa  999    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1253  TonB-dependent receptor, putative  100 
 
 		 740 aa  1535    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0080071  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2061  TonB-dependent receptor  32.57 
 
 		 742 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.302386  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0160  outer membrane receptor protein  32.39 
 
 		 740 aa  396  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1198  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 754 aa  369  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211844 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1483  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 754 aa  369  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 790 aa  354  4e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0369  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 782 aa  347  5e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 786 aa  331  3e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 736 aa  176  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 729 aa  161  3e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1484  hypothetical protein  28.53 
 
 		 398 aa  137  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1199  hypothetical protein  28.53 
 
 		 398 aa  137  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052926 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  21.84 
 
 		 765 aa  108  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  21.33 
 
 		 747 aa  103  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3467  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 285 aa  103  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  21.78 
 
 		 766 aa  97.8  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  21.73 
 
 		 738 aa  97.4  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  21.73 
 
 		 738 aa  97.4  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  21.17 
 
 		 753 aa  94  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 747 aa  87  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  21.11 
 
 		 746 aa  85.5  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 828 aa  80.9  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  25.4 
 
 		 768 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  25 
 
 		 768 aa  74.3  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.14 
 
 		 766 aa  72.8  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 777 aa  72  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 815 aa  69.3  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 786 aa  68.6  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  23.19 
 
 		 760 aa  67.8  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2519  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 782 aa  67  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131105 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  22.97 
 
 		 760 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2134  TonB-dependent receptor plug  23.75 
 
 		 781 aa  65.9  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.682313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 798 aa  65.1  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 792 aa  63.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 799 aa  63.5  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 841 aa  63.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 772 aa  63.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 835 aa  60.5  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 777 aa  58.9  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  21.85 
 
 		 733 aa  57.8  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 796 aa  55.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  22.54 
 
 		 742 aa  55.1  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 780 aa  54.7  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2634  TonB-dependent receptor plug  23.21 
 
 		 814 aa  54.3  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 791 aa  53.5  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 768 aa  53.9  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  27.98 
 
 		 779 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  27.14 
 
 		 797 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2585  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 790 aa  50.8  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0776775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3410  TonB-dependent receptor  21.76 
 
 		 781 aa  50.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 		 778 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4420  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 762 aa  49.3  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1486  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 693 aa  48.9  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  21.64 
 
 		 775 aa  48.9  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  21.81 
 
 		 705 aa  47.8  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 794 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  21.26 
 
 		 829 aa  45.8  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5560  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 739 aa  45.8  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  26.53 
 
 		 828 aa  45.4  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  23.74 
 
 		 729 aa  45.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 712 aa  45.4  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1495  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 792 aa  44.7  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879614 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2405  TonB-dependent receptor, plug  22.37 
 
 		 786 aa  44.3  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0816065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  24.7 
 
 		 752 aa  44.3  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 783 aa  44.3  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  25.85 
 
 		 828 aa  43.9  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>