200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0763 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0763  TonB-dependent receptor, putative  100 
 
 
778 aa  1580    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0908  TonB-dependent receptor  100 
 
 
778 aa  1580    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3229  TonB-dependent receptor  33.64 
 
 
768 aa  355  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2832  TonB-dependent receptor  33.64 
 
 
768 aa  355  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2998  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 
799 aa  193  8e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2608  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 
824 aa  194  8e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1937  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 
773 aa  92.4  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00253489  normal  0.908818 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2292  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 
773 aa  92.4  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 
815 aa  79.3  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2551  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 
777 aa  73.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0190132  normal  0.953315 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1702  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 
787 aa  72.8  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0960904  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2935  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 
801 aa  72.8  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2040  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 
787 aa  72.8  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 
678 aa  67.4  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0705  TonB-dependent receptor  22.54 
 
 
799 aa  63.9  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000765865  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 
828 aa  63.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6779  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 
825 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248517  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2147  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 
760 aa  62.8  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0654  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 
826 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970775  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1166  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 
765 aa  62  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 
688 aa  60.5  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4800  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 
848 aa  60.1  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2552  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 
787 aa  56.2  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000691451  normal  0.635758 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  30.57 
 
 
760 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  30.57 
 
 
760 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2714  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 
856 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.360758  normal  0.210323 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 
799 aa  56.6  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 
777 aa  56.6  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2298  TonB-dependent receptor  22.3 
 
 
735 aa  55.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.951085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1941  TonB-dependent receptor  22.3 
 
 
735 aa  55.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.299321  normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3609  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 
819 aa  55.8  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.396824  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 
772 aa  55.1  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  25.77 
 
 
715 aa  55.1  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 
835 aa  55.1  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 
792 aa  54.7  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 
737 aa  54.3  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 
700 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4265  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 
868 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.585484 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 
702 aa  53.1  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  22.81 
 
 
718 aa  52.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 
766 aa  53.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 
787 aa  53.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 
700 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1198  TonB-dependent receptor  21.26 
 
 
754 aa  52.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00211844 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 
700 aa  52.8  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 
700 aa  52.8  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1483  TonB-dependent receptor  21.26 
 
 
754 aa  52.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  21.66 
 
 
705 aa  52.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 
700 aa  52.8  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 
634 aa  52.4  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 
784 aa  52.4  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2936  hypothetical protein  27.01 
 
 
550 aa  51.6  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0884836  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 
700 aa  51.2  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  24.25 
 
 
700 aa  51.2  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  23.5 
 
 
652 aa  51.2  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5682  TonB-dependent receptor plug  20.8 
 
 
672 aa  51.2  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252502  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  24.25 
 
 
700 aa  51.2  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  29.73 
 
 
730 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2288  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 
776 aa  51.2  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  29.73 
 
 
730 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1935  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 
779 aa  50.8  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000527842  normal  0.699989 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 
747 aa  50.8  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  22.68 
 
 
723 aa  50.8  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 
738 aa  50.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8022  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 
825 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 
741 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7523  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 
825 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322865  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 
738 aa  50.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0029  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 
716 aa  50.4  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241491  normal  0.0713753 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2585  TonB-dependent receptor  25 
 
 
790 aa  50.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0776775  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  21.19 
 
 
702 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  21.19 
 
 
702 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  24.61 
 
 
721 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0363  TonB-dependent receptor plug  27.37 
 
 
649 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7039  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 
821 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 
742 aa  50.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 
733 aa  50.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 
786 aa  50.8  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  21.9 
 
 
765 aa  50.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1262  TonB-dependent receptor  21.67 
 
 
651 aa  50.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612585  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 
841 aa  50.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 
747 aa  49.7  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 
791 aa  49.3  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  25.82 
 
 
749 aa  48.9  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 
757 aa  48.9  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3269  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 
688 aa  49.3  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.35442 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  22.31 
 
 
766 aa  49.3  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 
701 aa  48.9  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  25 
 
 
721 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3340  TonB-dependent receptor, putative  22.73 
 
 
683 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  22.36 
 
 
781 aa  48.5  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2410  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 
683 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0831  TonB-dependent receptor plug  24.81 
 
 
721 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.519524  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  25.13 
 
 
774 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 
698 aa  48.1  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  24.54 
 
 
807 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4063  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 
712 aa  48.1  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  25.13 
 
 
774 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 
698 aa  48.1  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  26.74 
 
 
803 aa  48.1  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>