More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0957 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  72.57 
 
 		 786 aa  1147    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 790 aa  1602    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0440  TonB-dependent receptor, putative  34.14 
 
 		 734 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1198  TonB-dependent receptor  33.69 
 
 		 754 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211844 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1483  TonB-dependent receptor  33.69 
 
 		 754 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1997  TonB-dependent receptor, putative  33.43 
 
 		 741 aa  385  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1540  TonB-dependent receptor, putative  33.62 
 
 		 730 aa  373  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0676  TonB-dependent receptor  32.13 
 
 		 756 aa  363  8e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.102109  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1253  TonB-dependent receptor, putative  30.98 
 
 		 740 aa  356  1e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0080071  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0160  outer membrane receptor protein  30.67 
 
 		 740 aa  343  5e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2061  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 742 aa  324  4e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.302386  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0369  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 782 aa  313  5.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 729 aa  265  3e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 736 aa  205  3e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1199  hypothetical protein  33.1 
 
 		 398 aa  139  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052926 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1484  hypothetical protein  33.1 
 
 		 398 aa  139  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 799 aa  124  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3467  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 285 aa  105  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  22.58 
 
 		 760 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 747 aa  98.2  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  23.14 
 
 		 768 aa  97.8  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  22.53 
 
 		 760 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 		 765 aa  94.7  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 798 aa  87.4  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 828 aa  85.9  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 786 aa  85.1  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2134  TonB-dependent receptor plug  22.42 
 
 		 781 aa  84.3  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.682313 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 766 aa  82.4  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 815 aa  79  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  29.78 
 
 		 828 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2585  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 790 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0776775  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 794 aa  78.2  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  31.34 
 
 		 729 aa  78.2  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  29.2 
 
 		 797 aa  77.8  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 841 aa  76.3  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 820 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 768 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 777 aa  73.9  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 828 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2412  TonB-dependent siderophore receptor  30.27 
 
 		 717 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 746 aa  73.9  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  28.44 
 
 		 828 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  29.2 
 
 		 701 aa  72.4  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3330  TonB-dependent siderophore receptor  30.27 
 
 		 728 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.417694  normal  0.580446 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3410  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 781 aa  72  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  28.83 
 
 		 696 aa  71.6  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2147  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 760 aa  71.2  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3002  TonB-dependent siderophore receptor  29.73 
 
 		 717 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  27.88 
 
 		 705 aa  68.9  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  32.95 
 
 		 738 aa  68.6  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  32.95 
 
 		 738 aa  68.6  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 		 797 aa  68.6  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  28.25 
 
 		 829 aa  68.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 835 aa  67.8  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  28.89 
 
 		 752 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  23.23 
 
 		 781 aa  67.4  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 		 779 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2853  TonB-dependent receptor, putative  30.95 
 
 		 784 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0123555  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 777 aa  66.6  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  26.83 
 
 		 829 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4489  TonB-dependent siderophore receptor  27.88 
 
 		 785 aa  65.5  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 792 aa  65.5  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4121  TonB-dependent siderophore receptor  27.88 
 
 		 785 aa  65.5  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.922703 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  30.67 
 
 		 747 aa  65.1  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  30.67 
 
 		 745 aa  65.1  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  27.03 
 
 		 747 aa  65.1  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 772 aa  65.1  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  30.67 
 
 		 747 aa  64.7  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4602  TonB-dependent siderophore receptor  26.99 
 
 		 784 aa  64.7  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  30.67 
 
 		 747 aa  64.7  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  30.67 
 
 		 747 aa  64.7  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 		 717 aa  64.7  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  30.81 
 
 		 730 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  30.67 
 
 		 747 aa  64.7  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  27.48 
 
 		 747 aa  64.7  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 796 aa  64.7  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  27.71 
 
 		 753 aa  64.3  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  30.61 
 
 		 810 aa  64.3  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  28.19 
 
 		 815 aa  63.9  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  28.57 
 
 		 729 aa  63.5  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 753 aa  63.5  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  28.57 
 
 		 729 aa  63.9  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  31.35 
 
 		 730 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1474  TonB-dependent siderophore receptor  27.98 
 
 		 715 aa  62.4  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.052337 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  27.38 
 
 		 698 aa  61.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.97 
 
 		 766 aa  61.2  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 747 aa  61.6  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  27.38 
 
 		 696 aa  61.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  27.38 
 
 		 696 aa  61.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  27.38 
 
 		 696 aa  61.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 795 aa  61.2  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  27.38 
 
 		 696 aa  61.2  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2636  TonB-dependent siderophore receptor  26.58 
 
 		 776 aa  60.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1025  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 791 aa  60.5  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 		 778 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  27.68 
 
 		 729 aa  60.1  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 766 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  27.68 
 
 		 703 aa  60.1  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  27.68 
 
 		 703 aa  60.1  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  24.64 
 
 		 720 aa  59.3  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>