98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0440 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0676  TonB-dependent receptor  75.04 
 
 		 756 aa  1133    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.102109  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0440  TonB-dependent receptor, putative  100 
 
 		 734 aa  1515    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1997  TonB-dependent receptor, putative  85.18 
 
 		 741 aa  1292    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1253  TonB-dependent receptor, putative  70.04 
 
 		 740 aa  1091    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0080071  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1540  TonB-dependent receptor, putative  72.18 
 
 		 730 aa  1091    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0160  outer membrane receptor protein  33.51 
 
 		 740 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2061  TonB-dependent receptor  32.41 
 
 		 742 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.302386  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  34.14 
 
 		 790 aa  396  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1198  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 754 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211844 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1483  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 754 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 786 aa  352  1e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0369  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 782 aa  324  4e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 736 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 729 aa  181  5.999999999999999e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1484  hypothetical protein  32.39 
 
 		 398 aa  144  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1199  hypothetical protein  32.39 
 
 		 398 aa  144  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052926 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 746 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  22.94 
 
 		 766 aa  115  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  24.61 
 
 		 768 aa  114  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 792 aa  113  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3467  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 285 aa  111  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 768 aa  108  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  22.63 
 
 		 760 aa  107  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  21.75 
 
 		 765 aa  106  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  20.67 
 
 		 747 aa  103  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  22.93 
 
 		 766 aa  95.5  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  22.01 
 
 		 753 aa  94.7  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  21.41 
 
 		 815 aa  93.2  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  22.41 
 
 		 796 aa  93.2  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  21.82 
 
 		 780 aa  89  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  21.51 
 
 		 799 aa  82.8  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 786 aa  82  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  23.01 
 
 		 777 aa  80.9  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 738 aa  80.1  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 738 aa  80.1  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 747 aa  79  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 828 aa  78.6  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 791 aa  76.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 777 aa  75.5  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2134  TonB-dependent receptor plug  21.99 
 
 		 781 aa  68.2  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.682313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 798 aa  67.8  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2519  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 782 aa  66.6  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131105 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  25.46 
 
 		 760 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 733 aa  63.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 764 aa  59.3  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 841 aa  58.9  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  23.01 
 
 		 835 aa  58.2  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  26.43 
 
 		 797 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 772 aa  56.2  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 768 aa  54.7  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2585  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 790 aa  53.5  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0776775  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  34.82 
 
 		 649 aa  53.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2634  TonB-dependent receptor plug  23.49 
 
 		 814 aa  52.8  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  20.2 
 
 		 714 aa  52  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4420  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 762 aa  52  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  20.24 
 
 		 677 aa  52  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  20.24 
 
 		 714 aa  52  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 		 775 aa  50.8  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1486  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 693 aa  50.8  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4121  TonB-dependent siderophore receptor  24.74 
 
 		 785 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.922703 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0705  TonB-dependent receptor  21.76 
 
 		 799 aa  49.7  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000765865  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  22.57 
 
 		 829 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 712 aa  49.7  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 706 aa  50.1  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  26.9 
 
 		 803 aa  49.7  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  22.28 
 
 		 794 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4087  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 694 aa  48.1  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  23.16 
 
 		 778 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  19.82 
 
 		 714 aa  48.1  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06761  hypothetical protein  21.24 
 
 		 690 aa  47.8  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.1 
 
 		 833 aa  47  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  25.65 
 
 		 799 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 711 aa  47.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4489  TonB-dependent siderophore receptor  24.04 
 
 		 785 aa  47  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3410  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 781 aa  47  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 742 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0444  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 667 aa  47  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3002  TonB-dependent siderophore receptor  25.95 
 
 		 717 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  25 
 
 		 729 aa  46.6  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3405  outer membrane protein  26.6 
 
 		 714 aa  46.2  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.411389  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  25.66 
 
 		 808 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  21.83 
 
 		 820 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  22.09 
 
 		 812 aa  45.8  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 804 aa  45.8  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0692  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 678 aa  45.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.218448  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2412  TonB-dependent siderophore receptor  25.32 
 
 		 717 aa  45.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2147  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 760 aa  45.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4624  TonB-dependent siderophore receptor  26.62 
 
 		 797 aa  45.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185618  decreased coverage  0.0000000123032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4761  TonB-dependent siderophore receptor  27.14 
 
 		 797 aa  45.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4755  TonB-dependent siderophore receptor  26.62 
 
 		 797 aa  45.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.251254  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 748 aa  44.7  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3541  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 692 aa  44.7  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 762 aa  44.3  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  22.22 
 
 		 817 aa  44.3  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2555  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 702 aa  44.3  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3330  TonB-dependent siderophore receptor  25.32 
 
 		 728 aa  44.3  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.417694  normal  0.580446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  22.73 
 
 		 729 aa  44.3  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  22.73 
 
 		 710 aa  43.9  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>