More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4698 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 828 aa  1690    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  40.46 
 
 		 841 aa  578  1.0000000000000001e-163  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  26.33 
 
 		 760 aa  251  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  26.69 
 
 		 760 aa  251  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 747 aa  238  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 815 aa  236  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 746 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 736 aa  179  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 738 aa  164  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 738 aa  164  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 772 aa  163  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 786 aa  155  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 798 aa  145  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 747 aa  143  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 729 aa  137  7.000000000000001e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  28.57 
 
 		 766 aa  131  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2519  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 782 aa  127  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131105 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 753 aa  125  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 796 aa  124  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  31.39 
 
 		 792 aa  123  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  31.88 
 
 		 768 aa  111  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  37.31 
 
 		 765 aa  110  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  31.88 
 
 		 768 aa  109  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 791 aa  99.8  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 786 aa  97.1  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 835 aa  95.9  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2634  TonB-dependent receptor plug  33.68 
 
 		 814 aa  93.2  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 777 aa  92  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1198  TonB-dependent receptor  22.6 
 
 		 754 aa  91.7  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211844 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1483  TonB-dependent receptor  22.6 
 
 		 754 aa  91.7  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 777 aa  90.9  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2134  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 		 781 aa  87.8  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.682313 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 766 aa  87  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 799 aa  86.3  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 790 aa  86.3  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 780 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1253  TonB-dependent receptor, putative  24.15 
 
 		 740 aa  83.6  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0080071  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0160  outer membrane receptor protein  24.1 
 
 		 740 aa  81.6  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0440  TonB-dependent receptor, putative  25.13 
 
 		 734 aa  81.6  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 768 aa  80.5  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1997  TonB-dependent receptor, putative  24.19 
 
 		 741 aa  80.1  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4420  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 762 aa  76.6  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  30.45 
 
 		 809 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1540  TonB-dependent receptor, putative  24.38 
 
 		 730 aa  75.5  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3410  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 781 aa  75.5  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  26.64 
 
 		 810 aa  74.7  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.45 
 
 		 706 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4239  TonB-dependent siderophore receptor  27 
 
 		 781 aa  73.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.475083 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  26.18 
 
 		 796 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  23.3 
 
 		 721 aa  72.4  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  27.08 
 
 		 797 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 742 aa  72.4  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  25.56 
 
 		 677 aa  71.2  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2061  TonB-dependent receptor  22.63 
 
 		 742 aa  71.2  0.00000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.302386  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  25.56 
 
 		 714 aa  70.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  25.08 
 
 		 858 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  26.61 
 
 		 796 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  25.56 
 
 		 714 aa  70.1  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0676  TonB-dependent receptor  21.59 
 
 		 756 aa  69.3  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.102109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  24.91 
 
 		 705 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2585  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 790 aa  68.9  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0776775  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  22.96 
 
 		 863 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  26.1 
 
 		 715 aa  68.9  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0369  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 782 aa  68.6  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  30.6 
 
 		 795 aa  68.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  25.93 
 
 		 828 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 882 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  24.91 
 
 		 713 aa  68.6  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 881 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  24.91 
 
 		 713 aa  68.6  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 747 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 881 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  25.75 
 
 		 796 aa  68.6  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  25.75 
 
 		 796 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  25.5 
 
 		 778 aa  68.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  27.98 
 
 		 742 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1495  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 792 aa  67.8  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879614 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 705 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  27.5 
 
 		 706 aa  67  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  27.57 
 
 		 921 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  23.75 
 
 		 855 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1199  hypothetical protein  27.47 
 
 		 398 aa  66.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052926 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  23.75 
 
 		 855 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  27.57 
 
 		 921 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1484  hypothetical protein  27.47 
 
 		 398 aa  66.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  26.61 
 
 		 797 aa  66.2  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  27.57 
 
 		 881 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1180  TonB-dependent siderophore receptor  27.16 
 
 		 679 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14569  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 795 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  25.42 
 
 		 707 aa  65.1  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  27.73 
 
 		 810 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  24.58 
 
 		 743 aa  65.1  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  29.47 
 
 		 748 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  26.26 
 
 		 749 aa  64.7  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  25.18 
 
 		 740 aa  64.7  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 795 aa  64.7  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0798  TonB-dependent siderophore receptor  27.54 
 
 		 773 aa  64.7  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  30.53 
 
 		 748 aa  64.3  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 748 aa  64.3  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4489  TonB-dependent siderophore receptor  25.64 
 
 		 785 aa  64.3  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>