More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1945 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  46.55 
 
 		 747 aa  642    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 738 aa  1516    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 738 aa  1516    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  42.47 
 
 		 765 aa  551  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  41.11 
 
 		 768 aa  548  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  40.85 
 
 		 768 aa  548  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  40.36 
 
 		 777 aa  536  1e-151  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  41.51 
 
 		 753 aa  531  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  42.78 
 
 		 766 aa  522  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  41.76 
 
 		 792 aa  516  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  37.55 
 
 		 772 aa  444  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  36.92 
 
 		 777 aa  446  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  35.88 
 
 		 799 aa  405  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2634  TonB-dependent receptor plug  34.36 
 
 		 814 aa  352  1e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 835 aa  266  8.999999999999999e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4420  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 762 aa  218  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 796 aa  214  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3784  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 772 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.562566 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 815 aa  198  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 768 aa  192  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 786 aa  184  7e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 780 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 791 aa  175  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 729 aa  172  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3410  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 781 aa  173  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2519  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 782 aa  172  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131105 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2585  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 790 aa  170  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0776775  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 828 aa  161  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  22.69 
 
 		 760 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1495  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 792 aa  147  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  23.53 
 
 		 760 aa  145  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 798 aa  142  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0160  outer membrane receptor protein  23.98 
 
 		 740 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0676  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 		 756 aa  124  6e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.102109  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  22.68 
 
 		 766 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2134  TonB-dependent receptor plug  23.37 
 
 		 781 aa  121  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.682313 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02852  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 808 aa  121  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1997  TonB-dependent receptor, putative  23.26 
 
 		 741 aa  107  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2061  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 742 aa  107  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.302386  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 841 aa  101  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1540  TonB-dependent receptor, putative  23.01 
 
 		 730 aa  100  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1941  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 735 aa  99.8  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.299321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2298  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 735 aa  99.8  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.951085  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1253  TonB-dependent receptor, putative  21.73 
 
 		 740 aa  97.4  8e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0080071  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1492  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 711 aa  92.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 736 aa  87.4  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 747 aa  85.9  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 746 aa  83.6  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0440  TonB-dependent receptor, putative  26.05 
 
 		 734 aa  80.1  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2832  TonB-dependent receptor  22.02 
 
 		 768 aa  79.7  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3229  TonB-dependent receptor  22.02 
 
 		 768 aa  79.7  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  25.93 
 
 		 755 aa  75.9  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1166  TonB-dependent receptor  22.18 
 
 		 765 aa  73.9  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  25.45 
 
 		 708 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  25.44 
 
 		 743 aa  68.9  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  30.37 
 
 		 675 aa  68.6  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  32.95 
 
 		 790 aa  68.6  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1483  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 754 aa  67.4  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 786 aa  67.8  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1198  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 754 aa  67.4  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211844 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  28.04 
 
 		 693 aa  67.4  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  25.77 
 
 		 709 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0369  TonB-dependent receptor  22.51 
 
 		 782 aa  67  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  26.39 
 
 		 718 aa  66.2  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  26.91 
 
 		 713 aa  65.5  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  26.55 
 
 		 713 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1210  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 506 aa  64.7  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000130069 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 		 706 aa  64.3  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 		 706 aa  64.3  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 782 aa  63.9  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2292  TonB-dependent receptor  21.46 
 
 		 773 aa  63.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1937  TonB-dependent receptor  21.46 
 
 		 773 aa  63.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00253489  normal  0.908818 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2859  TonB-dependent siderophore receptor  23.93 
 
 		 733 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.335633 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  24.78 
 
 		 710 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  23.67 
 
 		 731 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  25.47 
 
 		 746 aa  62  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 700 aa  62  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 780 aa  61.6  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2996  TonB-dependent siderophore receptor  24.24 
 
 		 733 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18602  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  22.26 
 
 		 694 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3521  TonB-dependent siderophore receptor  22.41 
 
 		 699 aa  60.8  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  23.56 
 
 		 708 aa  60.8  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  25.63 
 
 		 710 aa  60.8  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 749 aa  60.8  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  23.32 
 
 		 730 aa  60.8  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3424  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 815 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.053865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  21.29 
 
 		 701 aa  60.5  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2040  TonB-dependent receptor  22.46 
 
 		 787 aa  59.7  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 700 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  28.47 
 
 		 706 aa  59.7  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  23.82 
 
 		 711 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5130  TonB-dependent siderophore receptor  27.24 
 
 		 725 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1702  TonB-dependent receptor  22.46 
 
 		 787 aa  59.7  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0960904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  26.71 
 
 		 709 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  25.97 
 
 		 810 aa  58.9  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  25.63 
 
 		 729 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  26.45 
 
 		 713 aa  58.5  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2608  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 824 aa  58.5  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 708 aa  58.9  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2998  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 799 aa  58.5  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>