118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0676 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1540  TonB-dependent receptor, putative  68.2 
 
 		 730 aa  1053    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1253  TonB-dependent receptor, putative  70.03 
 
 		 740 aa  1099    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0080071  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0440  TonB-dependent receptor, putative  73.31 
 
 		 734 aa  1140    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0676  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 756 aa  1570    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.102109  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1997  TonB-dependent receptor, putative  73.66 
 
 		 741 aa  1130    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2061  TonB-dependent receptor  33.65 
 
 		 742 aa  437  1e-121  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.302386  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0160  outer membrane receptor protein  34.06 
 
 		 740 aa  427  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  32.13 
 
 		 790 aa  363  6e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1483  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 754 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1198  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 754 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211844 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 786 aa  348  3e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0369  TonB-dependent receptor  30.98 
 
 		 782 aa  341  2.9999999999999998e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 736 aa  194  5e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 729 aa  176  1.9999999999999998e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1484  hypothetical protein  29.45 
 
 		 398 aa  127  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1199  hypothetical protein  29.45 
 
 		 398 aa  127  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052926 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 738 aa  125  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 738 aa  125  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3467  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 285 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  21.9 
 
 		 760 aa  103  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  21.45 
 
 		 747 aa  98.2  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  22.35 
 
 		 799 aa  90.9  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  20.68 
 
 		 792 aa  84.7  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 		 791 aa  82.4  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 765 aa  81.3  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 753 aa  80.1  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 747 aa  78.2  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  25.81 
 
 		 768 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  20.58 
 
 		 815 aa  73.6  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.27 
 
 		 766 aa  72.8  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  22.69 
 
 		 766 aa  70.1  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  21.59 
 
 		 828 aa  69.7  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 746 aa  69.3  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 768 aa  68.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 796 aa  67.4  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 786 aa  66.2  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 777 aa  65.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  23.72 
 
 		 760 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2134  TonB-dependent receptor plug  24.26 
 
 		 781 aa  62.4  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.682313 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2519  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 782 aa  61.6  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131105 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 798 aa  61.6  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  25.77 
 
 		 797 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2585  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 790 aa  60.1  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0776775  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 835 aa  60.5  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  20.51 
 
 		 772 aa  57  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 780 aa  56.2  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 777 aa  55.1  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2634  TonB-dependent receptor plug  22.83 
 
 		 814 aa  54.7  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4755  TonB-dependent siderophore receptor  26.21 
 
 		 797 aa  54.3  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.251254  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 820 aa  54.3  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4624  TonB-dependent siderophore receptor  26.21 
 
 		 797 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185618  decreased coverage  0.0000000123032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 794 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  24.71 
 
 		 828 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 841 aa  52.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 742 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4761  TonB-dependent siderophore receptor  28.19 
 
 		 797 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  21.3 
 
 		 742 aa  53.1  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 768 aa  52.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 737 aa  51.6  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3410  TonB-dependent receptor  21.65 
 
 		 781 aa  51.2  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0444  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 667 aa  51.2  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  23.93 
 
 		 707 aa  50.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  27.93 
 
 		 779 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 733 aa  50.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 649 aa  50.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  20.82 
 
 		 817 aa  49.3  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1518  TonB-dependent receptor plug  23.39 
 
 		 727 aa  49.3  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  23.78 
 
 		 642 aa  48.1  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0692  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 678 aa  48.5  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.218448  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 705 aa  48.5  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03378  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 798 aa  48.5  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0156374  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2555  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 702 aa  48.1  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  23.55 
 
 		 828 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  32.67 
 
 		 689 aa  47.8  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3417  TonB dependent outer membrane ferrichrome-iron receptor  26.58 
 
 		 715 aa  47.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 680 aa  47.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 706 aa  47.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1486  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 693 aa  47.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3062  TonB-dependent siderophore receptor  26.58 
 
 		 715 aa  47.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.173013 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 736 aa  47  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  23.28 
 
 		 799 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1495  TonB-dependent receptor  22.07 
 
 		 792 aa  47  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879614 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4420  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 762 aa  46.6  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2751  TonB-dependent receptor plug  27.7 
 
 		 722 aa  46.2  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.930878  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  20.95 
 
 		 705 aa  46.2  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  26.04 
 
 		 678 aa  46.6  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2405  TonB-dependent receptor, plug  21.7 
 
 		 786 aa  46.6  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0816065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3541  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 692 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 713 aa  46.6  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 797 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  21.57 
 
 		 828 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  22.87 
 
 		 778 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  24.86 
 
 		 829 aa  46.6  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  21.85 
 
 		 729 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  24.05 
 
 		 737 aa  45.8  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  26.7 
 
 		 623 aa  45.8  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  25.2 
 
 		 651 aa  45.4  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  23.39 
 
 		 677 aa  45.4  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  25.95 
 
 		 708 aa  45.4  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  20.33 
 
 		 729 aa  44.7  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>