More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1472 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0151  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  49.78 
 
 		 675 aa  652    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3699  TonB-dependent receptor  51.71 
 
 		 685 aa  656    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1472  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 683 aa  1406    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.907424  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1481  TonB-dependent receptor  66.18 
 
 		 674 aa  923    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0173398  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5341  TonB-dependent receptor  41.68 
 
 		 657 aa  514  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3220  TonB-dependent receptor  41.53 
 
 		 654 aa  490  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52120  TonB-dependent receptor  42.92 
 
 		 668 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.618776  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1989  TonB-dependent receptor  40.82 
 
 		 675 aa  475  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000419445  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0444  TonB-dependent receptor  41.97 
 
 		 667 aa  467  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0604  TonB-dependent outer membrane receptor  37.97 
 
 		 682 aa  442  1e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3366  TonB-dependent receptor  34.98 
 
 		 708 aa  423  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5501  TonB-dependent receptor  36.14 
 
 		 731 aa  415  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3697  TonB-dependent receptor  36.14 
 
 		 731 aa  415  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0941  TonB-dependent receptor  33.98 
 
 		 716 aa  410  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4645  TonB-dependent receptor  34.07 
 
 		 693 aa  398  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318415 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1191  TonB-dependent receptor  34.88 
 
 		 744 aa  396  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.601925 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0252  TonB-dependent receptor  33.71 
 
 		 663 aa  372  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.945527  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1549  TonB-dependent receptor  37.06 
 
 		 656 aa  366  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751142  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2970  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 		 718 aa  365  1e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222916  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2482  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 728 aa  356  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1171  TonB-dependent receptor  32.91 
 
 		 697 aa  352  1e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1983  TonB-dependent receptor  31.29 
 
 		 727 aa  350  5e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1952  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 656 aa  330  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446334  normal  0.0364758 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  26.42 
 
 		 653 aa  240  6.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1516  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 690 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.18651  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 651 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 665 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  23.03 
 
 		 678 aa  161  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 762 aa  127  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 669 aa  124  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 742 aa  124  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4088  TonB-dependent receptor  22.31 
 
 		 650 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  24.25 
 
 		 646 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 737 aa  112  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0094  TonB-dependent receptor  22.21 
 
 		 649 aa  110  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 709 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  23.26 
 
 		 655 aa  102  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  24.31 
 
 		 695 aa  102  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 692 aa  100  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 698 aa  97.4  8e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  23.96 
 
 		 807 aa  96.3  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 634 aa  95.1  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 668 aa  91.3  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 836 aa  90.1  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 828 aa  88.2  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  21.13 
 
 		 666 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  21.22 
 
 		 666 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  21.01 
 
 		 666 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3500  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 699 aa  84.3  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4382  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 635 aa  84  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.429499  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  20.87 
 
 		 666 aa  84  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  28.16 
 
 		 634 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1019  TonB-dependent receptor  21.93 
 
 		 572 aa  82.8  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.463707  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1278  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 571 aa  80.9  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.354768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  22.51 
 
 		 746 aa  80.9  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 		 845 aa  80.5  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  21.82 
 
 		 715 aa  79.7  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  20.83 
 
 		 666 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 815 aa  79.7  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  20.83 
 
 		 615 aa  78.6  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  21.31 
 
 		 698 aa  78.2  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  21.31 
 
 		 698 aa  78.2  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  21.31 
 
 		 698 aa  78.2  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  28.33 
 
 		 618 aa  77.4  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  20.56 
 
 		 639 aa  77.4  0.0000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  22.8 
 
 		 757 aa  77  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1339  TonB-dependent receptor  21.54 
 
 		 714 aa  76.6  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.368228 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  20.45 
 
 		 731 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  22.26 
 
 		 681 aa  76.6  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  32.11 
 
 		 677 aa  76.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  26.81 
 
 		 673 aa  75.5  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  21.12 
 
 		 663 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 647 aa  74.7  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  21.93 
 
 		 679 aa  73.9  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 		 764 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3676  TonB-dependent receptor, plug  23.51 
 
 		 735 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1260  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 581 aa  72.8  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  28.51 
 
 		 647 aa  72  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  26.17 
 
 		 662 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  20.91 
 
 		 656 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  28.65 
 
 		 640 aa  71.6  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  19.46 
 
 		 617 aa  71.6  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 742 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 1128 aa  71.2  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1978  TonB-dependent receptor plug  19.33 
 
 		 663 aa  71.2  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.500779  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  21.82 
 
 		 700 aa  70.9  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  22.69 
 
 		 715 aa  70.9  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  21.63 
 
 		 828 aa  70.5  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  22.08 
 
 		 656 aa  70.1  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 690 aa  69.3  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  22.46 
 
 		 776 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6077  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 656 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  25.58 
 
 		 671 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  23.53 
 
 		 634 aa  69.7  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  21.76 
 
 		 712 aa  68.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3867  TonB-dependent receptor, plug  27.8 
 
 		 729 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3960  TonB-dependent receptor, plug  26.87 
 
 		 741 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.62 
 
 		 631 aa  68.9  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  20.9 
 
 		 746 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4248  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 		 772 aa  68.9  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>