More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0936 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 715 aa  1476    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  40.56 
 
 		 676 aa  491  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  37.37 
 
 		 662 aa  395  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  34.38 
 
 		 680 aa  349  9e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  32.44 
 
 		 678 aa  335  1e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  33.63 
 
 		 615 aa  332  1e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0777  TonB-dependent receptor plug  32.74 
 
 		 645 aa  310  5e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 710 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  30.5 
 
 		 642 aa  284  4.0000000000000003e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0769  TonB-dependent receptor, plug  27.61 
 
 		 687 aa  228  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3833  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  28.12 
 
 		 667 aa  194  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  26.07 
 
 		 718 aa  181  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 643 aa  124  7e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  25.53 
 
 		 670 aa  122  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3742  TonB-dependent receptor plug  24.83 
 
 		 715 aa  119  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1697  TonB-dependent receptor, plug  24.29 
 
 		 704 aa  118  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3494  TonB-dependent receptor plug  25.37 
 
 		 715 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  22.95 
 
 		 666 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  22.95 
 
 		 666 aa  108  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  22.95 
 
 		 666 aa  107  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  23.1 
 
 		 666 aa  107  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 699 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 671 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4171  hypothetical protein  30.07 
 
 		 704 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0123  TonB-dependent receptor plug  23.75 
 
 		 670 aa  105  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0182279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2900  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  24.3 
 
 		 686 aa  105  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  24.72 
 
 		 652 aa  103  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3157  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 714 aa  103  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  31.75 
 
 		 705 aa  103  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4209  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 707 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3661  hypothetical protein  40.14 
 
 		 702 aa  102  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 710 aa  102  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  22.16 
 
 		 704 aa  101  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43650  hypothetical protein  39.44 
 
 		 705 aa  102  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00638923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1383  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 702 aa  101  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00790883  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1266  TonB-dependent iron complex outermembrane receptor protein  40 
 
 		 673 aa  100  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  23.11 
 
 		 666 aa  100  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 697 aa  99.8  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 613 aa  95.9  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  23.9 
 
 		 656 aa  95.9  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3416  TonB-dependent receptor plug  40.3 
 
 		 684 aa  94.7  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.717717  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  35.5 
 
 		 688 aa  94.4  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0552  TonB-dependent receptor, plug  25.1 
 
 		 653 aa  94.7  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  24.53 
 
 		 680 aa  94.7  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 680 aa  94  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 635 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  29.65 
 
 		 663 aa  92  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  29.65 
 
 		 663 aa  92  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  29.65 
 
 		 663 aa  92  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  29.65 
 
 		 663 aa  92  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  29.65 
 
 		 663 aa  92  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  29.65 
 
 		 663 aa  92  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  29.65 
 
 		 659 aa  92  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 653 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 698 aa  92.4  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  22.82 
 
 		 663 aa  92.4  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  30.96 
 
 		 641 aa  92  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 681 aa  91.3  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3634  TonB-dependent receptor, plug  32.45 
 
 		 668 aa  90.9  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  31.94 
 
 		 614 aa  90.5  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  22.53 
 
 		 646 aa  90.5  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  33.33 
 
 		 618 aa  89.4  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  23.3 
 
 		 650 aa  89.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  23.3 
 
 		 650 aa  89.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  23.18 
 
 		 695 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  23.3 
 
 		 650 aa  89.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1928  TonB-dependent receptor  38.1 
 
 		 676 aa  89  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00435524  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  22.86 
 
 		 650 aa  89  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  36.76 
 
 		 616 aa  89  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2952  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 645 aa  88.6  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.771516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  30.36 
 
 		 641 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  33.76 
 
 		 751 aa  88.2  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  22.12 
 
 		 799 aa  87.8  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  22.34 
 
 		 663 aa  87  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  22.75 
 
 		 656 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  38.46 
 
 		 682 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  24.27 
 
 		 653 aa  87  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 		 799 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  33.16 
 
 		 634 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1362  TonB-dependent receptor, plug  31.22 
 
 		 737 aa  86.3  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0352862  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  24.15 
 
 		 639 aa  86.3  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  30.59 
 
 		 617 aa  86.3  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  37.04 
 
 		 1023 aa  85.9  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  23.13 
 
 		 650 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  25.21 
 
 		 700 aa  85.9  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 		 799 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  34.56 
 
 		 713 aa  85.5  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  22.43 
 
 		 661 aa  85.5  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  24 
 
 		 652 aa  85.5  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2576  TonB-dependent receptor  36.11 
 
 		 783 aa  84.3  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138902 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3002  TonB-dependent receptor plug  20.95 
 
 		 668 aa  83.6  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.957092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1992  TonB-dependent receptor, plug  31.55 
 
 		 671 aa  83.2  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.643758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  32.24 
 
 		 678 aa  83.2  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 		 656 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2625  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 657 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.980205  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  24.81 
 
 		 668 aa  83.2  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 649 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  23.28 
 
 		 656 aa  82.4  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.77 
 
 		 630 aa  82.4  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.77 
 
 		 630 aa  82.4  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>