More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0777 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0777  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 645 aa  1301    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  38.58 
 
 		 676 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  38.63 
 
 		 662 aa  382  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  32.74 
 
 		 715 aa  324  3e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  33.22 
 
 		 615 aa  301  3e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  30.63 
 
 		 678 aa  288  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  30.72 
 
 		 680 aa  288  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  32.84 
 
 		 642 aa  283  6.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 710 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0769  TonB-dependent receptor, plug  25.04 
 
 		 687 aa  171  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  24.91 
 
 		 718 aa  159  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3833  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  27.42 
 
 		 667 aa  155  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  34.47 
 
 		 670 aa  106  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 643 aa  100  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3157  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 714 aa  92  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3634  TonB-dependent receptor, plug  32.58 
 
 		 668 aa  89.7  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3661  hypothetical protein  35.07 
 
 		 702 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43650  hypothetical protein  35.21 
 
 		 705 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00638923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3494  TonB-dependent receptor plug  35.81 
 
 		 715 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0552  TonB-dependent receptor, plug  24.91 
 
 		 653 aa  87  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3416  TonB-dependent receptor plug  26.12 
 
 		 684 aa  86.7  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.717717  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4171  hypothetical protein  35.82 
 
 		 704 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0132  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 679 aa  86.7  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.691558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 680 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3742  TonB-dependent receptor plug  35.82 
 
 		 715 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1697  TonB-dependent receptor, plug  35.82 
 
 		 704 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 893 aa  84.7  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  25.05 
 
 		 641 aa  83.6  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5117  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 801 aa  83.2  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  23.95 
 
 		 680 aa  83.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  23.37 
 
 		 666 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  23.37 
 
 		 666 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  23.5 
 
 		 666 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  23.37 
 
 		 666 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4209  TonB-dependent receptor  34.33 
 
 		 707 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2036  TonB-dependent receptor  34.24 
 
 		 687 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  24.36 
 
 		 652 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  23.16 
 
 		 666 aa  77  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 		 611 aa  75.9  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  23.31 
 
 		 663 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  23.46 
 
 		 663 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 705 aa  75.1  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0104  TonB-dependent receptor  33.54 
 
 		 678 aa  75.1  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479806  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0123  TonB-dependent receptor plug  30.57 
 
 		 670 aa  74.7  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0182279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.15 
 
 		 653 aa  74.3  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  33.33 
 
 		 633 aa  72  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  36 
 
 		 699 aa  72  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 720 aa  72  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 681 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1229  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 662 aa  72.4  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  30.9 
 
 		 640 aa  71.2  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  31.28 
 
 		 656 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 736 aa  70.5  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  22.6 
 
 		 769 aa  70.1  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2789  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 675 aa  70.1  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  26.78 
 
 		 597 aa  69.3  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  23.21 
 
 		 656 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  23.01 
 
 		 623 aa  69.3  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 692 aa  69.7  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 682 aa  69.3  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 742 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  32.64 
 
 		 655 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  24.78 
 
 		 706 aa  69.3  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 713 aa  69.3  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 662 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1383  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 702 aa  68.6  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00790883  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  23.02 
 
 		 652 aa  68.9  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 688 aa  68.6  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 697 aa  68.2  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3845  TonB-dependent receptor plug  23.66 
 
 		 696 aa  68.2  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 698 aa  68.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  28.67 
 
 		 634 aa  68.6  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 737 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 828 aa  68.2  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  30.95 
 
 		 1023 aa  68.2  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  25.71 
 
 		 646 aa  67.8  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 670 aa  67.4  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2952  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 645 aa  67.4  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.771516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  23.33 
 
 		 713 aa  67.4  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 828 aa  67  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  34.13 
 
 		 639 aa  67  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1128 aa  66.6  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  30.37 
 
 		 673 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  35.77 
 
 		 659 aa  66.6  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 804 aa  66.2  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  29.52 
 
 		 704 aa  66.2  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1362  TonB-dependent receptor, plug  32.06 
 
 		 737 aa  66.2  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0352862  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2900  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  29.52 
 
 		 686 aa  65.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  26.49 
 
 		 668 aa  66.2  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 698 aa  65.9  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 701 aa  66.2  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  33.1 
 
 		 653 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 649 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 680 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  31.4 
 
 		 611 aa  65.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  29.55 
 
 		 638 aa  65.5  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 624 aa  65.5  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 649 aa  65.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 634 aa  65.1  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  33.56 
 
 		 616 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>