More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2785 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 710 aa  1451    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  34.55 
 
 		 676 aa  347  5e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 715 aa  294  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  29.53 
 
 		 678 aa  277  4e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  31.24 
 
 		 680 aa  273  9e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  31.99 
 
 		 642 aa  269  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  30.23 
 
 		 662 aa  259  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  28.03 
 
 		 615 aa  248  3e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0777  TonB-dependent receptor plug  26.3 
 
 		 645 aa  197  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0769  TonB-dependent receptor, plug  26.52 
 
 		 687 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3833  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.78 
 
 		 667 aa  163  8.000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  25.12 
 
 		 718 aa  157  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0552  TonB-dependent receptor, plug  27.89 
 
 		 653 aa  137  8e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  31.85 
 
 		 670 aa  126  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 643 aa  123  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0132  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 679 aa  122  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.691558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3661  hypothetical protein  37.8 
 
 		 702 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4171  hypothetical protein  30.27 
 
 		 704 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3742  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 715 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3157  TonB-dependent receptor  37.62 
 
 		 714 aa  115  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1697  TonB-dependent receptor, plug  30.27 
 
 		 704 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43650  hypothetical protein  39.18 
 
 		 705 aa  115  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00638923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4209  TonB-dependent receptor  36.42 
 
 		 707 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3494  TonB-dependent receptor plug  35.91 
 
 		 715 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2036  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 687 aa  109  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  38.25 
 
 		 618 aa  107  9e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3416  TonB-dependent receptor plug  33.73 
 
 		 684 aa  107  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.717717  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1362  TonB-dependent receptor, plug  32.31 
 
 		 737 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0352862  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1266  TonB-dependent iron complex outermembrane receptor protein  26.55 
 
 		 673 aa  103  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  33.96 
 
 		 641 aa  97.1  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3634  TonB-dependent receptor, plug  26.46 
 
 		 668 aa  97.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1992  TonB-dependent receptor, plug  33.73 
 
 		 671 aa  95.9  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.643758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0123  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 		 670 aa  94  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0182279  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  35.12 
 
 		 652 aa  91.3  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3845  TonB-dependent receptor plug  25.35 
 
 		 696 aa  91.3  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  37.57 
 
 		 617 aa  90.1  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  32.67 
 
 		 663 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  32.67 
 
 		 663 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  32.26 
 
 		 641 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  32.67 
 
 		 663 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 726 aa  89.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  32.67 
 
 		 663 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  32.67 
 
 		 663 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 634 aa  89.7  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  32.67 
 
 		 659 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  32.67 
 
 		 663 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3850  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 671 aa  88.2  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.302325  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  40.79 
 
 		 713 aa  87.8  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1229  TonB-dependent receptor plug  39.26 
 
 		 662 aa  87.8  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  34.13 
 
 		 682 aa  87.8  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2789  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 675 aa  87.4  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2631  TonB-dependent receptor domain-containing protein  35.5 
 
 		 646 aa  87  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  36.24 
 
 		 637 aa  85.9  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  31.73 
 
 		 611 aa  86.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  31.44 
 
 		 614 aa  85.9  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  32.45 
 
 		 688 aa  85.5  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  23.85 
 
 		 680 aa  85.5  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 705 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 706 aa  85.5  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.83 
 
 		 615 aa  85.1  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  35.76 
 
 		 680 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.94 
 
 		 631 aa  84.7  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 763 aa  84.7  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  26.68 
 
 		 639 aa  84.7  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  34.25 
 
 		 665 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0576  TonB-dependent receptor plug  35.75 
 
 		 621 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  32.87 
 
 		 650 aa  84.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  32.87 
 
 		 650 aa  84.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  32.87 
 
 		 650 aa  84.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  32.87 
 
 		 650 aa  84.3  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  34.35 
 
 		 650 aa  84.3  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  33.85 
 
 		 656 aa  84  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  32.66 
 
 		 681 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0104  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 678 aa  83.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479806  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3790  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  37.31 
 
 		 716 aa  83.6  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  36.75 
 
 		 659 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  32.42 
 
 		 671 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  28.9 
 
 		 664 aa  82.8  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  41.67 
 
 		 656 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  32.99 
 
 		 659 aa  83.2  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  32.42 
 
 		 699 aa  82  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  34.29 
 
 		 1023 aa  82  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  32.07 
 
 		 617 aa  82  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 611 aa  80.9  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.15 
 
 		 615 aa  80.9  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  34.36 
 
 		 653 aa  80.9  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2900  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  32.45 
 
 		 686 aa  80.5  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.58 
 
 		 631 aa  80.1  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  34.36 
 
 		 653 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  34.36 
 
 		 653 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3002  TonB-dependent receptor plug  30.46 
 
 		 668 aa  79.3  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.957092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  33.15 
 
 		 806 aa  79.7  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  34.36 
 
 		 653 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.91 
 
 		 631 aa  79.3  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  31.69 
 
 		 626 aa  79.3  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  34.36 
 
 		 653 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.65 
 
 		 630 aa  79.7  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.65 
 
 		 630 aa  79.7  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  33.15 
 
 		 668 aa  79.7  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  31.69 
 
 		 626 aa  79.3  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>