More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3790 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3790  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  100 
 
 
716 aa  1471    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11789  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 
710 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 
705 aa  203  7e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2900  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  24.56 
 
 
686 aa  137  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  24.58 
 
 
666 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  36.26 
 
 
655 aa  100  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  34.5 
 
 
642 aa  99.8  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  33.73 
 
 
678 aa  97.4  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  35.26 
 
 
710 aa  95.5  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  38.71 
 
 
704 aa  95.1  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 
681 aa  94.4  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  37.91 
 
 
697 aa  92.8  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  36.65 
 
 
676 aa  92.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  34.15 
 
 
680 aa  93.2  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  34.66 
 
 
742 aa  92  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  37.04 
 
 
658 aa  90.9  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  36.76 
 
 
676 aa  90.1  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  38.13 
 
 
665 aa  89.7  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  22.34 
 
 
688 aa  89  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  36.62 
 
 
696 aa  88.2  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  33.33 
 
 
666 aa  88.2  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  33.53 
 
 
666 aa  88.2  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  36.62 
 
 
696 aa  88.6  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  33.33 
 
 
666 aa  88.6  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  33.33 
 
 
666 aa  88.2  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  26.28 
 
 
641 aa  88.2  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 
671 aa  87.4  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 
699 aa  87  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  36.03 
 
 
663 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2919  outer membrane receptor FepA  23.21 
 
 
724 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91274  normal  0.0854265 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  37.24 
 
 
737 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  23.21 
 
 
724 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  23.21 
 
 
724 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  38.16 
 
 
680 aa  86.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  34.44 
 
 
656 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  33.52 
 
 
698 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  31.74 
 
 
663 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  31.71 
 
 
663 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  31.71 
 
 
663 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  31.71 
 
 
659 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  31.71 
 
 
663 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  31.71 
 
 
663 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  37.32 
 
 
641 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  31.71 
 
 
663 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  31.71 
 
 
663 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  38.64 
 
 
650 aa  84.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  38.64 
 
 
650 aa  84.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  38.64 
 
 
650 aa  84.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2789  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 
675 aa  84.7  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  38.64 
 
 
650 aa  84.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  38.64 
 
 
650 aa  84.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  29.59 
 
 
718 aa  84.7  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.91 
 
 
631 aa  85.1  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 
679 aa  84.7  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  35.56 
 
 
665 aa  84.3  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  35.56 
 
 
665 aa  84.3  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  35.56 
 
 
665 aa  84.3  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  37.88 
 
 
656 aa  84.3  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  33.54 
 
 
618 aa  84  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0993  TonB-dependent receptor plug  36.17 
 
 
826 aa  83.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3636  TonB-dependent receptor  32.75 
 
 
804 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000134979  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  22.81 
 
 
724 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  34.92 
 
 
713 aa  83.2  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  31.61 
 
 
615 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 
640 aa  82  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  32.37 
 
 
652 aa  82  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1977  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA 2 (Sulfate-transporting ATPase 2)  32.57 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.33 
 
 
631 aa  81.6  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  35.81 
 
 
709 aa  82  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  36.69 
 
 
740 aa  82  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.74 
 
 
614 aa  81.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  33.33 
 
 
695 aa  81.3  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 
614 aa  81.3  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 
643 aa  80.9  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  23.78 
 
 
740 aa  80.9  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  22.81 
 
 
724 aa  80.9  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  34.81 
 
 
714 aa  80.5  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.74 
 
 
614 aa  80.5  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  33.33 
 
 
715 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.52 
 
 
615 aa  80.5  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.74 
 
 
614 aa  80.5  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.74 
 
 
614 aa  80.5  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.74 
 
 
614 aa  80.5  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  33.15 
 
 
702 aa  79.7  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 
648 aa  79.7  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  24.29 
 
 
651 aa  79.7  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0510  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  30.43 
 
 
680 aa  79.7  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.382474  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  32.04 
 
 
742 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  37.98 
 
 
637 aa  79.7  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  34.1 
 
 
698 aa  79  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.57 
 
 
623 aa  79  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4209  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 
707 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  36.43 
 
 
726 aa  79.3  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  34.75 
 
 
653 aa  79  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  36.76 
 
 
700 aa  79  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 
688 aa  79  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  32.76 
 
 
652 aa  78.6  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  35.56 
 
 
665 aa  78.6  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 
657 aa  78.6  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  36.22 
 
 
681 aa  78.2  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>