More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0993 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0993  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 826 aa  1674    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 705 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  38.2 
 
 		 652 aa  108  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  36.96 
 
 		 699 aa  94  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  36.96 
 
 		 671 aa  94  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  36.13 
 
 		 680 aa  92.8  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  31.79 
 
 		 678 aa  92.4  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2789  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 675 aa  92  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  34.85 
 
 		 624 aa  91.3  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  33.72 
 
 		 646 aa  89.7  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 710 aa  89.4  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1266  TonB-dependent iron complex outermembrane receptor protein  32.73 
 
 		 673 aa  87.4  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 680 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3636  TonB-dependent receptor  37.78 
 
 		 804 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000134979  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  32.6 
 
 		 614 aa  85.5  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1229  TonB-dependent receptor plug  33.7 
 
 		 662 aa  84.3  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  36.57 
 
 		 663 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  36.57 
 
 		 663 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  36.57 
 
 		 659 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  36.57 
 
 		 663 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  36.57 
 
 		 641 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  36.57 
 
 		 663 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  36.57 
 
 		 663 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  36.57 
 
 		 663 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  36.62 
 
 		 665 aa  83.2  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  35.07 
 
 		 650 aa  81.6  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  35.33 
 
 		 655 aa  82  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  35.07 
 
 		 650 aa  81.6  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  35.07 
 
 		 650 aa  81.6  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  35.07 
 
 		 650 aa  81.6  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  35.07 
 
 		 650 aa  81.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 613 aa  80.5  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  31.71 
 
 		 641 aa  79.7  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  33.73 
 
 		 715 aa  79.7  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  34.21 
 
 		 715 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  30 
 
 		 676 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  37.31 
 
 		 665 aa  78.6  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  37.31 
 
 		 665 aa  78.6  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  30.67 
 
 		 718 aa  78.6  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  37.31 
 
 		 665 aa  78.6  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  35.46 
 
 		 653 aa  78.6  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  27.65 
 
 		 615 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  37.06 
 
 		 666 aa  78.2  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2952  TonB-dependent receptor  32.18 
 
 		 645 aa  77  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.771516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  36.22 
 
 		 747 aa  76.6  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  36.96 
 
 		 666 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  39.64 
 
 		 659 aa  76.3  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  36.96 
 
 		 666 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3790  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  34.59 
 
 		 716 aa  76.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  32.35 
 
 		 626 aa  76.3  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  32.09 
 
 		 737 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  36.96 
 
 		 666 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  36.96 
 
 		 666 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.52 
 
 		 631 aa  76.6  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  34.33 
 
 		 656 aa  75.9  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 710 aa  75.9  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  37.96 
 
 		 806 aa  75.9  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  32.35 
 
 		 626 aa  75.9  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  37.12 
 
 		 663 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  32.59 
 
 		 635 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  31.46 
 
 		 698 aa  75.5  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  37.88 
 
 		 663 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  31.85 
 
 		 653 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  30.43 
 
 		 642 aa  74.7  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  37.4 
 
 		 652 aa  74.3  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  39.39 
 
 		 617 aa  73.9  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  33.53 
 
 		 638 aa  73.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  31.29 
 
 		 698 aa  73.6  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3850  TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 671 aa  73.9  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.302325  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 681 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2751  TonB-dependent receptor plug  34.12 
 
 		 722 aa  73.6  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.930878  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1518  TonB-dependent receptor plug  34.19 
 
 		 727 aa  73.9  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  34.42 
 
 		 647 aa  73.2  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  33.13 
 
 		 1023 aa  73.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  31.18 
 
 		 618 aa  73.2  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  35.11 
 
 		 652 aa  72.8  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1383  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 702 aa  73.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00790883  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 742 aa  73.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.51 
 
 		 614 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  30.61 
 
 		 662 aa  72.8  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  31.69 
 
 		 613 aa  72.4  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  32.84 
 
 		 742 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3845  TonB-dependent receptor plug  28.8 
 
 		 696 aa  72  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 948 aa  72  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0769  TonB-dependent receptor, plug  27.7 
 
 		 687 aa  72  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  32.03 
 
 		 743 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  30.23 
 
 		 623 aa  71.6  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2900  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  33.84 
 
 		 686 aa  71.6  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  28.8 
 
 		 614 aa  71.2  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3416  TonB-dependent receptor plug  33.59 
 
 		 684 aa  71.2  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.717717  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 679 aa  71.2  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0132  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 679 aa  70.5  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.691558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  29.79 
 
 		 670 aa  70.9  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3097  TonB-dependent receptor, plug  34.11 
 
 		 671 aa  70.1  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  34.15 
 
 		 676 aa  70.1  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  34.35 
 
 		 732 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  29.95 
 
 		 686 aa  70.5  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0385  TonB-dependent receptor, plug  33.77 
 
 		 713 aa  70.9  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4382  TonB-dependent receptor  36.79 
 
 		 635 aa  70.1  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.429499  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  33.1 
 
 		 726 aa  69.7  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>