More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3850 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2952  TonB-dependent receptor  58.36 
 
 		 645 aa  740    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.771516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3850  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 671 aa  1350    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.302325  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  38.68 
 
 		 652 aa  363  7.0000000000000005e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  36.8 
 
 		 680 aa  352  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  35.87 
 
 		 671 aa  349  8e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  35.87 
 
 		 699 aa  349  9e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1266  TonB-dependent iron complex outermembrane receptor protein  32.88 
 
 		 673 aa  298  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  32.15 
 
 		 681 aa  269  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3845  TonB-dependent receptor plug  32.37 
 
 		 696 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2789  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 675 aa  226  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1229  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 662 aa  202  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1383  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 702 aa  192  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00790883  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 710 aa  93.2  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3157  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 714 aa  91.3  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 643 aa  82.4  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 649 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 705 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  23 
 
 		 666 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  22.42 
 
 		 704 aa  79  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0132  TonB-dependent receptor  34.04 
 
 		 679 aa  77  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.691558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  23.69 
 
 		 662 aa  76.6  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  22.59 
 
 		 663 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  22.59 
 
 		 663 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0104  TonB-dependent receptor  36.25 
 
 		 678 aa  76.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479806  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  22.08 
 
 		 697 aa  76.3  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  22.59 
 
 		 663 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  21.71 
 
 		 666 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  23.85 
 
 		 714 aa  76.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  22.59 
 
 		 663 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  22.66 
 
 		 641 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  22.59 
 
 		 663 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  27.81 
 
 		 718 aa  76.6  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  27.27 
 
 		 641 aa  75.9  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  22.59 
 
 		 659 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  30.3 
 
 		 676 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  21.71 
 
 		 700 aa  75.5  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  22.59 
 
 		 663 aa  75.9  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  24 
 
 		 634 aa  75.1  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  27.68 
 
 		 678 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  23.7 
 
 		 677 aa  74.3  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  25.18 
 
 		 611 aa  74.3  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  23.7 
 
 		 714 aa  74.3  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  21.36 
 
 		 709 aa  73.9  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 698 aa  73.9  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.46 
 
 		 623 aa  73.9  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0993  TonB-dependent receptor plug  32.93 
 
 		 826 aa  73.9  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1928  TonB-dependent receptor  34.39 
 
 		 676 aa  73.6  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00435524  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 714 aa  72.8  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 715 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  24.4 
 
 		 739 aa  72  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 665 aa  72  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  30.51 
 
 		 670 aa  71.6  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  22.4 
 
 		 658 aa  71.6  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  20.8 
 
 		 647 aa  70.9  0.00000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  21.62 
 
 		 618 aa  70.5  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  23.38 
 
 		 636 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  26.01 
 
 		 680 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1964  TonB-dependent receptor, plug  32.73 
 
 		 618 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  21.92 
 
 		 647 aa  68.9  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  23.14 
 
 		 686 aa  68.9  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 747 aa  68.9  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 688 aa  68.9  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 710 aa  68.6  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2036  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 687 aa  68.6  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0552  TonB-dependent receptor, plug  30.26 
 
 		 653 aa  68.2  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  22.61 
 
 		 661 aa  68.2  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  25.89 
 
 		 615 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 611 aa  67  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.5 
 
 		 656 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  24.56 
 
 		 712 aa  66.2  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0576  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 621 aa  65.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.67 
 
 		 615 aa  65.9  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  22.98 
 
 		 732 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  23.18 
 
 		 746 aa  65.1  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  27.42 
 
 		 665 aa  64.3  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2576  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 783 aa  64.3  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138902 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  27.42 
 
 		 665 aa  64.3  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  27.42 
 
 		 665 aa  64.3  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  26.21 
 
 		 738 aa  64.3  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  27.12 
 
 		 665 aa  64.3  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1760  TonB-dependent heme receptor  20.95 
 
 		 664 aa  63.5  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 635 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3634  TonB-dependent receptor, plug  28.86 
 
 		 668 aa  62.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2900  TonB-dependent receptor plug  35.11 
 
 		 609 aa  62.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 678 aa  62.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3661  hypothetical protein  28.73 
 
 		 702 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  24.83 
 
 		 676 aa  62.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2580  iron(III) compound receptor  22.66 
 
 		 718 aa  62.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000113666  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 751 aa  62.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  26.74 
 
 		 880 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43650  hypothetical protein  29.61 
 
 		 705 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00638923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 664 aa  62.4  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  23.68 
 
 		 628 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2900  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.5 
 
 		 686 aa  62  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  22.79 
 
 		 617 aa  62  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  20.61 
 
 		 681 aa  62  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2744  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 701 aa  61.6  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 669 aa  62  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3742  TonB-dependent receptor plug  27.7 
 
 		 715 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4209  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 707 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>