More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1229 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1229  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 662 aa  1325    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  37.66 
 
 		 652 aa  371  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  35.38 
 
 		 699 aa  353  5e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  35.78 
 
 		 671 aa  353  7e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  34.1 
 
 		 680 aa  301  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2789  TonB-dependent receptor  32.26 
 
 		 675 aa  273  8.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1266  TonB-dependent iron complex outermembrane receptor protein  33.94 
 
 		 673 aa  271  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  32.55 
 
 		 681 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3845  TonB-dependent receptor plug  33.54 
 
 		 696 aa  265  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1383  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 702 aa  226  8e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00790883  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2952  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 645 aa  217  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.771516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3850  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 671 aa  203  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.302325  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 705 aa  106  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 613 aa  105  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0552  TonB-dependent receptor, plug  26.91 
 
 		 653 aa  103  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 653 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  26.35 
 
 		 642 aa  103  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 635 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3634  TonB-dependent receptor, plug  25.13 
 
 		 668 aa  99  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  25.22 
 
 		 639 aa  94.7  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 710 aa  90.9  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 643 aa  90.9  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  31.63 
 
 		 718 aa  90.9  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  27.84 
 
 		 739 aa  89.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  34.08 
 
 		 676 aa  89.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3157  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 714 aa  88.6  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 652 aa  88.6  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  27.47 
 
 		 668 aa  88.6  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  36.41 
 
 		 710 aa  88.6  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  36.65 
 
 		 656 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 634 aa  86.3  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  25 
 
 		 661 aa  85.5  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  27.54 
 
 		 689 aa  84.7  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0993  TonB-dependent receptor plug  33.7 
 
 		 826 aa  84.3  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 		 701 aa  84  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  25.49 
 
 		 650 aa  84  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  33.14 
 
 		 704 aa  83.2  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  33.14 
 
 		 697 aa  83.2  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  26.31 
 
 		 732 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0132  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 679 aa  83.2  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.691558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  31.21 
 
 		 615 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 709 aa  81.6  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2900  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  38.33 
 
 		 686 aa  81.3  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  34.94 
 
 		 680 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  32.43 
 
 		 641 aa  80.9  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  33.7 
 
 		 662 aa  80.5  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  34.8 
 
 		 688 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5364  TonB-dependent receptor plug  31.34 
 
 		 729 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  32.09 
 
 		 678 aa  79  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  32.82 
 
 		 713 aa  79  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  32.8 
 
 		 715 aa  78.6  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  33.93 
 
 		 665 aa  78.6  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  34.38 
 
 		 647 aa  78.2  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 806 aa  78.2  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  39.01 
 
 		 670 aa  77.8  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 		 649 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2666  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 638 aa  77.8  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  25.48 
 
 		 722 aa  77  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  30.65 
 
 		 665 aa  76.6  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3636  TonB-dependent receptor  33.52 
 
 		 804 aa  77  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000134979  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0576  TonB-dependent receptor plug  33.48 
 
 		 621 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  31.39 
 
 		 634 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  30.65 
 
 		 665 aa  76.6  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  30.65 
 
 		 665 aa  76.6  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  29.72 
 
 		 653 aa  75.9  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  24.64 
 
 		 686 aa  75.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  29.49 
 
 		 618 aa  76.3  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  32.89 
 
 		 908 aa  75.5  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  26.22 
 
 		 689 aa  75.5  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  30.2 
 
 		 617 aa  75.1  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  23 
 
 		 647 aa  75.1  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3315  TonB-dependent receptor plug  23.35 
 
 		 650 aa  74.7  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  31.9 
 
 		 712 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3833  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.34 
 
 		 667 aa  74.3  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  24.5 
 
 		 700 aa  74.3  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  31.9 
 
 		 749 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2576  TonB-dependent receptor  33.81 
 
 		 783 aa  73.9  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138902 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  34.88 
 
 		 696 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  34.29 
 
 		 658 aa  73.6  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  25.28 
 
 		 673 aa  73.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  34.5 
 
 		 695 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  31.25 
 
 		 655 aa  72.4  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.17 
 
 		 623 aa  72.8  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  23.89 
 
 		 633 aa  73.2  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  25.55 
 
 		 722 aa  73.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3416  TonB-dependent receptor plug  36 
 
 		 684 aa  72.8  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.717717  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 681 aa  72  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 657 aa  72  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  37.8 
 
 		 1128 aa  72.4  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  34.3 
 
 		 696 aa  72  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0028  TonB-dependent receptor  31.66 
 
 		 641 aa  71.6  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  23.8 
 
 		 659 aa  71.6  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 		 663 aa  71.2  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  30.22 
 
 		 663 aa  71.2  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1928  TonB-dependent receptor  36.53 
 
 		 676 aa  71.2  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00435524  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  30.22 
 
 		 663 aa  71.2  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  30.22 
 
 		 659 aa  71.2  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  30.22 
 
 		 663 aa  71.2  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  30.22 
 
 		 663 aa  71.2  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  30.22 
 
 		 663 aa  71.2  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>