More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0028 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0028  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 641 aa  1314    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2744  TonB-dependent receptor  33.89 
 
 		 701 aa  298  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 679 aa  228  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 678 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 649 aa  211  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1142  TonB-dependent receptor-related protein  30.33 
 
 		 650 aa  206  8e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.22175  normal  0.0805488 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  28.81 
 
 		 647 aa  201  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1262  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 651 aa  196  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612585  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1519  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 657 aa  195  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.148558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1064  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 661 aa  182  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00188221  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5752  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 746 aa  176  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0523831  hitchhiker  0.0000000000276247 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  26.74 
 
 		 861 aa  153  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  26.41 
 
 		 769 aa  151  4e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1321  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 724 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5364  TonB-dependent receptor plug  23.02 
 
 		 729 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  24.89 
 
 		 639 aa  125  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 698 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 652 aa  121  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  24.11 
 
 		 633 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  26.81 
 
 		 668 aa  117  8.999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0483  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  35.69 
 
 		 271 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00522803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0448  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  35.69 
 
 		 271 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.46 
 
 		 619 aa  114  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  24.46 
 
 		 655 aa  113  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  26.92 
 
 		 617 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 648 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  25.48 
 
 		 676 aa  111  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1651  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 648 aa  111  5e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613844 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  26.24 
 
 		 597 aa  110  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 624 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 627 aa  109  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 624 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 626 aa  108  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 626 aa  107  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  24.82 
 
 		 665 aa  107  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  24.82 
 
 		 665 aa  107  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  25.26 
 
 		 652 aa  106  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  23.29 
 
 		 663 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  23.29 
 
 		 663 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  24.68 
 
 		 665 aa  106  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  26.18 
 
 		 647 aa  106  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.61 
 
 		 1023 aa  106  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  23.23 
 
 		 663 aa  105  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  23.23 
 
 		 663 aa  105  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  23.23 
 
 		 663 aa  105  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  24.16 
 
 		 653 aa  105  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  23.23 
 
 		 663 aa  105  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  25.97 
 
 		 645 aa  104  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  23.22 
 
 		 659 aa  103  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  23.6 
 
 		 656 aa  103  7e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  24.86 
 
 		 665 aa  103  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  25.15 
 
 		 612 aa  103  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0347  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  23.76 
 
 		 759 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1781  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.76 
 
 		 769 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0440  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  23.76 
 
 		 764 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 593 aa  103  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  24.6 
 
 		 634 aa  103  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1826  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.76 
 
 		 718 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0529347  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0824  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  23.76 
 
 		 767 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.359227  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  23.53 
 
 		 641 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0995  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 629 aa  102  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.864049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1115  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  23.76 
 
 		 767 aa  102  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2089  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  23.76 
 
 		 767 aa  102  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329074  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  23.65 
 
 		 656 aa  101  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 616 aa  101  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2139  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.61 
 
 		 766 aa  101  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  23.55 
 
 		 628 aa  101  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  35.36 
 
 		 634 aa  100  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3502  putative outer membrane cobalamin receptor, TonB dependent  26.76 
 
 		 623 aa  100  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.86203  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1447  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 632 aa  100  8e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 602 aa  100  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  23.77 
 
 		 676 aa  100  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 638 aa  99.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 683 aa  99  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  41.42 
 
 		 613 aa  98.6  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.75 
 
 		 631 aa  99  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  23.59 
 
 		 650 aa  98.2  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 649 aa  97.8  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  26.2 
 
 		 614 aa  97.8  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  25.04 
 
 		 646 aa  97.4  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  23.45 
 
 		 712 aa  97.4  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2400  outer membrane receptor protein  26.07 
 
 		 621 aa  97.1  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.901841 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  24.17 
 
 		 623 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 740 aa  96.7  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  23.44 
 
 		 650 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 615 aa  95.9  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 627 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  23.55 
 
 		 693 aa  95.9  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  23.3 
 
 		 650 aa  95.5  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.18 
 
 		 653 aa  95.1  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  23.44 
 
 		 650 aa  95.1  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  23.44 
 
 		 650 aa  95.1  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5070  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.49 
 
 		 762 aa  94.7  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.565094  normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  24.66 
 
 		 628 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  23.74 
 
 		 640 aa  94.7  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  24.09 
 
 		 634 aa  94  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1001  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 628 aa  93.2  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.11298  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 619 aa  93.6  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 661 aa  93.2  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 624 aa  92.8  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>