More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3833 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3833  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  100 
 
 		 667 aa  1368    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  27.74 
 
 		 676 aa  207  7e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  27.25 
 
 		 680 aa  206  9e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  26.76 
 
 		 678 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 715 aa  194  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  29.7 
 
 		 642 aa  184  6e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  27.01 
 
 		 615 aa  160  7e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0769  TonB-dependent receptor, plug  26.95 
 
 		 687 aa  152  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 710 aa  151  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0777  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 645 aa  151  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  27.8 
 
 		 662 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  27.8 
 
 		 718 aa  143  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  37.82 
 
 		 670 aa  120  9e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3661  hypothetical protein  34.34 
 
 		 702 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43650  hypothetical protein  33.84 
 
 		 705 aa  110  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00638923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1697  TonB-dependent receptor, plug  28.99 
 
 		 704 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0123  TonB-dependent receptor plug  34.5 
 
 		 670 aa  100  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0182279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  32.51 
 
 		 643 aa  100  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3742  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 715 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3494  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 715 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4171  hypothetical protein  28.44 
 
 		 704 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4209  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 707 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3416  TonB-dependent receptor plug  32.8 
 
 		 684 aa  90.5  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.717717  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1992  TonB-dependent receptor, plug  32.16 
 
 		 671 aa  87.4  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.643758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3002  TonB-dependent receptor plug  22.14 
 
 		 668 aa  87.4  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.957092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1362  TonB-dependent receptor, plug  33.8 
 
 		 737 aa  86.7  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0352862  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0552  TonB-dependent receptor, plug  26.15 
 
 		 653 aa  86.3  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0132  TonB-dependent receptor  32.89 
 
 		 679 aa  85.5  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.691558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3157  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 714 aa  85.1  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1266  TonB-dependent iron complex outermembrane receptor protein  25.62 
 
 		 673 aa  80.5  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  31.82 
 
 		 646 aa  80.1  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 		 681 aa  80.1  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  34.03 
 
 		 705 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  31.15 
 
 		 618 aa  79  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  22.6 
 
 		 649 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  24.94 
 
 		 659 aa  78.6  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 635 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2036  TonB-dependent receptor  36.3 
 
 		 687 aa  77.8  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  25.27 
 
 		 757 aa  77  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 762 aa  75.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  33.12 
 
 		 641 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  34.22 
 
 		 697 aa  75.1  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  34.93 
 
 		 663 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  34.93 
 
 		 663 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  34.93 
 
 		 663 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  34.93 
 
 		 663 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  34.93 
 
 		 663 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  34.93 
 
 		 659 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  24.26 
 
 		 680 aa  74.7  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  34.93 
 
 		 663 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 614 aa  74.3  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  34.72 
 
 		 656 aa  74.3  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  32.86 
 
 		 641 aa  73.9  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  33.33 
 
 		 655 aa  73.9  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  21.68 
 
 		 652 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 893 aa  73.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  24.68 
 
 		 652 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 634 aa  72.8  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1006  TonB-dependent receptor  23.23 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.711145  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 681 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  33.69 
 
 		 704 aa  72  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0104  TonB-dependent receptor  34.9 
 
 		 678 aa  72.4  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479806  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  33.57 
 
 		 650 aa  72.4  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  33.57 
 
 		 650 aa  72  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  33.57 
 
 		 650 aa  72.4  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  33.57 
 
 		 650 aa  72  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  33.57 
 
 		 650 aa  72  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 657 aa  71.6  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 680 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 682 aa  71.2  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  35.04 
 
 		 631 aa  71.2  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 709 aa  71.2  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3636  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 804 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000134979  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1594  TonB-dependent receptor, plug  33.89 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  32.07 
 
 		 746 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  32.35 
 
 		 653 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  21.57 
 
 		 640 aa  70.9  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3097  TonB-dependent receptor, plug  30.21 
 
 		 671 aa  70.5  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2900  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  30.06 
 
 		 686 aa  70.5  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  31.3 
 
 		 746 aa  70.5  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  26.7 
 
 		 638 aa  70.1  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  31.98 
 
 		 663 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  22.67 
 
 		 699 aa  70.5  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  22.44 
 
 		 671 aa  70.5  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  22.91 
 
 		 656 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 652 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  30.46 
 
 		 617 aa  69.7  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  31.88 
 
 		 668 aa  69.3  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  24.68 
 
 		 653 aa  68.9  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  31.03 
 
 		 640 aa  68.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  33.97 
 
 		 613 aa  68.6  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  21.92 
 
 		 732 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  37.4 
 
 		 710 aa  67.8  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  34.44 
 
 		 700 aa  67.4  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  30.46 
 
 		 597 aa  67.4  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5364  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 		 729 aa  67.4  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  32.46 
 
 		 639 aa  67.8  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  34.86 
 
 		 634 aa  67.4  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  34.06 
 
 		 665 aa  67.4  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  24.44 
 
 		 750 aa  67.4  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>