More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3002 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3002  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 668 aa  1379    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.957092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4209  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 707 aa  273  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4171  hypothetical protein  30.67 
 
 		 704 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3742  TonB-dependent receptor plug  29.18 
 
 		 715 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1697  TonB-dependent receptor, plug  30.45 
 
 		 704 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3494  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 		 715 aa  260  6e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3661  hypothetical protein  28.05 
 
 		 702 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1362  TonB-dependent receptor, plug  26.79 
 
 		 737 aa  211  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0352862  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  29.96 
 
 		 670 aa  203  8e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 643 aa  191  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0132  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 679 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.691558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3416  TonB-dependent receptor plug  25.82 
 
 		 684 aa  165  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.717717  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0552  TonB-dependent receptor, plug  23.52 
 
 		 653 aa  152  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2036  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 687 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43650  hypothetical protein  40.28 
 
 		 705 aa  146  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00638923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0104  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 678 aa  145  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479806  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3157  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 714 aa  141  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  23.43 
 
 		 676 aa  93.2  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3833  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  22.14 
 
 		 667 aa  87.4  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1445  TonB-dependent receptor, putative  23.95 
 
 		 593 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  25.9 
 
 		 680 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  24.09 
 
 		 662 aa  85.1  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  20.95 
 
 		 715 aa  83.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  28.78 
 
 		 642 aa  83.6  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  23.96 
 
 		 678 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 648 aa  80.5  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 710 aa  79.3  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0123  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 670 aa  79  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0182279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 681 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 		 680 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  31.25 
 
 		 615 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  26.57 
 
 		 617 aa  74.3  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  21.69 
 
 		 661 aa  74.3  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4821  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 621 aa  74.3  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  22.05 
 
 		 641 aa  73.9  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 657 aa  73.9  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  28.67 
 
 		 718 aa  73.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  20.16 
 
 		 710 aa  72.8  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  29.47 
 
 		 615 aa  72  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  20.8 
 
 		 705 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1383  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 702 aa  71.6  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00790883  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1162  tonB-dependent vitamin B12 receptor  30.34 
 
 		 622 aa  71.2  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  27.5 
 
 		 636 aa  70.9  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2426  TonB-dependent receptor, plug  28.32 
 
 		 652 aa  70.5  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000164352  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0769  TonB-dependent receptor, plug  30.65 
 
 		 687 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1992  TonB-dependent receptor, plug  30.16 
 
 		 671 aa  70.1  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.643758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2789  TonB-dependent receptor  22.41 
 
 		 675 aa  68.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 624 aa  69.3  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  22.65 
 
 		 686 aa  68.9  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 602 aa  68.2  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  31.94 
 
 		 1023 aa  67.8  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  19.96 
 
 		 709 aa  67.8  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.11 
 
 		 630 aa  67.8  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.11 
 
 		 630 aa  67.8  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 893 aa  66.6  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 700 aa  66.2  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  32.82 
 
 		 762 aa  66.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  22.16 
 
 		 613 aa  65.5  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 679 aa  65.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0777  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 645 aa  65.1  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5752  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 746 aa  64.3  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0523831  hitchhiker  0.0000000000276247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  33.85 
 
 		 637 aa  63.9  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  27.94 
 
 		 628 aa  63.9  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  23.13 
 
 		 713 aa  63.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  26.53 
 
 		 638 aa  63.5  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 617 aa  63.5  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  28.99 
 
 		 619 aa  62.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  30.34 
 
 		 618 aa  63.2  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 619 aa  62  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  30.87 
 
 		 809 aa  62.4  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  20.12 
 
 		 652 aa  62  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 682 aa  62  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  33.81 
 
 		 668 aa  61.6  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1321  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 724 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  23.86 
 
 		 628 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 695 aa  60.8  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  25.13 
 
 		 613 aa  60.1  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 		 627 aa  60.1  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  30.07 
 
 		 633 aa  60.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 773 aa  60.1  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 593 aa  60.5  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 649 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  21.38 
 
 		 646 aa  59.7  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  21.82 
 
 		 699 aa  59.3  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  27.36 
 
 		 751 aa  59.7  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  21.51 
 
 		 663 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.93 
 
 		 614 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.92 
 
 		 631 aa  58.9  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  21.51 
 
 		 663 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.93 
 
 		 614 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.93 
 
 		 614 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 688 aa  58.9  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.93 
 
 		 614 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 697 aa  58.9  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  30.23 
 
 		 616 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  21.51 
 
 		 659 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  22.86 
 
 		 666 aa  58.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  28.1 
 
 		 630 aa  58.9  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  19.11 
 
 		 662 aa  58.5  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  21.51 
 
 		 663 aa  58.5  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>