More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1321 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5752  TonB-dependent receptor  55.78 
 
 		 746 aa  757    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0523831  hitchhiker  0.0000000000276247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1321  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 724 aa  1458    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 679 aa  226  9e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1519  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 657 aa  185  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.148558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  28.11 
 
 		 647 aa  178  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2744  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 701 aa  178  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1142  TonB-dependent receptor-related protein  30.11 
 
 		 650 aa  173  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.22175  normal  0.0805488 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1262  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 651 aa  169  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612585  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1064  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 661 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00188221  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 649 aa  163  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 678 aa  160  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0028  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 641 aa  134  9e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  27.57 
 
 		 769 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  25.69 
 
 		 656 aa  111  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 653 aa  109  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.77 
 
 		 1023 aa  104  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 642 aa  103  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  26.01 
 
 		 646 aa  101  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 648 aa  101  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 626 aa  100  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 626 aa  100  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  36.9 
 
 		 659 aa  100  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 657 aa  97.1  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5364  TonB-dependent receptor plug  33.17 
 
 		 729 aa  95.5  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 861 aa  95.1  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  30.6 
 
 		 614 aa  94  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  25.29 
 
 		 681 aa  92.8  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  24.96 
 
 		 659 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  24.96 
 
 		 663 aa  92.4  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  24.96 
 
 		 663 aa  92  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  24.96 
 
 		 663 aa  92.4  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  24.96 
 
 		 663 aa  92.4  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  38.58 
 
 		 619 aa  92.4  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  26.07 
 
 		 686 aa  92  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  25.94 
 
 		 653 aa  92.4  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  26.36 
 
 		 680 aa  92  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  24.6 
 
 		 663 aa  91.3  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 649 aa  91.3  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  24.6 
 
 		 663 aa  91.3  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  25.14 
 
 		 645 aa  90.9  7e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 661 aa  90.9  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  32.13 
 
 		 593 aa  90.9  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  24.58 
 
 		 641 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 698 aa  89.4  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  33.2 
 
 		 615 aa  89.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 715 aa  89  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 616 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  23.49 
 
 		 640 aa  88.2  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  26.15 
 
 		 616 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2751  TonB-dependent receptor plug  26.16 
 
 		 722 aa  87.8  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.930878  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  24.72 
 
 		 650 aa  87.8  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 613 aa  87.4  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  24.54 
 
 		 650 aa  87  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  24.7 
 
 		 650 aa  87  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 697 aa  87  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  26.83 
 
 		 655 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  24.54 
 
 		 650 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  29.43 
 
 		 634 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  24.54 
 
 		 650 aa  86.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  27.19 
 
 		 660 aa  85.5  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  30.58 
 
 		 634 aa  84.3  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  22.41 
 
 		 699 aa  84  0.000000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0104  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 678 aa  82.8  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479806  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  24.56 
 
 		 628 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  31.66 
 
 		 670 aa  82.4  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 621 aa  82.4  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  23.72 
 
 		 696 aa  82.4  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43650  hypothetical protein  29.22 
 
 		 705 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00638923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3661  hypothetical protein  30.59 
 
 		 702 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  36.99 
 
 		 631 aa  81.6  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  38.32 
 
 		 614 aa  81.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  38.32 
 
 		 614 aa  81.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  25.77 
 
 		 665 aa  81.3  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  38.32 
 
 		 614 aa  80.9  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1518  TonB-dependent receptor plug  35.35 
 
 		 727 aa  80.9  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  38.32 
 
 		 614 aa  81.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  25.68 
 
 		 665 aa  80.9  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  25.97 
 
 		 665 aa  80.9  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  25.97 
 
 		 665 aa  80.9  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 618 aa  80.5  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  37.04 
 
 		 614 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  37.72 
 
 		 614 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  37.04 
 
 		 614 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  37.04 
 
 		 614 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  37.65 
 
 		 614 aa  80.1  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  29.88 
 
 		 671 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  37.04 
 
 		 614 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  36.81 
 
 		 614 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 652 aa  79  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 709 aa  79  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 740 aa  78.6  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 704 aa  79  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  35.81 
 
 		 634 aa  78.6  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6077  TonB-dependent receptor plug  24.14 
 
 		 656 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 624 aa  78.2  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 643 aa  77  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  32.51 
 
 		 670 aa  77  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0123  TonB-dependent receptor plug  24.42 
 
 		 670 aa  76.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0182279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  34.29 
 
 		 908 aa  77  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  25.98 
 
 		 710 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>