More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3661 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3661  hypothetical protein  100 
 
 		 702 aa  1425    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4171  hypothetical protein  61.14 
 
 		 704 aa  852    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4209  TonB-dependent receptor  62.77 
 
 		 707 aa  897    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3494  TonB-dependent receptor plug  62.74 
 
 		 715 aa  878    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3742  TonB-dependent receptor plug  61.25 
 
 		 715 aa  870    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1697  TonB-dependent receptor, plug  61.14 
 
 		 704 aa  858    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43650  hypothetical protein  93.05 
 
 		 705 aa  1328    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00638923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1362  TonB-dependent receptor, plug  32.27 
 
 		 737 aa  325  3e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0352862  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3002  TonB-dependent receptor plug  28.05 
 
 		 668 aa  245  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.957092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  32.53 
 
 		 643 aa  243  7.999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0552  TonB-dependent receptor, plug  28.75 
 
 		 653 aa  219  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3416  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 684 aa  212  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.717717  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2036  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 687 aa  203  7e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0132  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 679 aa  202  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.691558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0104  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 678 aa  193  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479806  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  46.41 
 
 		 670 aa  177  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3157  TonB-dependent receptor  42.01 
 
 		 714 aa  157  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  37 
 
 		 642 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  37.8 
 
 		 710 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3833  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  34.34 
 
 		 667 aa  110  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  32.49 
 
 		 676 aa  108  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0769  TonB-dependent receptor, plug  39.58 
 
 		 687 aa  108  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  33.52 
 
 		 615 aa  105  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  38.73 
 
 		 678 aa  103  9e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  40.14 
 
 		 715 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  35.03 
 
 		 680 aa  102  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  37.78 
 
 		 718 aa  100  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0123  TonB-dependent receptor plug  33.48 
 
 		 670 aa  100  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0182279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 602 aa  92.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  36 
 
 		 662 aa  92  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  34.66 
 
 		 688 aa  91.3  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  39.77 
 
 		 616 aa  90.9  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 626 aa  90.5  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 626 aa  90.5  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 649 aa  89.4  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  34.52 
 
 		 893 aa  87.8  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0777  TonB-dependent receptor plug  34.04 
 
 		 645 aa  86.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  29.81 
 
 		 615 aa  87  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  38.46 
 
 		 762 aa  85.9  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 649 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 653 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  27.71 
 
 		 618 aa  84.7  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  34.45 
 
 		 1023 aa  84  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  30.8 
 
 		 638 aa  83.6  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.63 
 
 		 631 aa  83.6  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 710 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  23.2 
 
 		 650 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  23.2 
 
 		 650 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  22.3 
 
 		 663 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  23.2 
 
 		 650 aa  82  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  22.3 
 
 		 663 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  33.12 
 
 		 633 aa  82  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  23.2 
 
 		 650 aa  81.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  28.43 
 
 		 906 aa  81.6  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 		 659 aa  81.6  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  31.44 
 
 		 767 aa  81.6  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  33.18 
 
 		 593 aa  81.6  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1321  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 724 aa  81.6  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  23.2 
 
 		 650 aa  81.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 661 aa  80.5  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.78 
 
 		 631 aa  79.7  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  32.41 
 
 		 646 aa  80.5  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 		 1128 aa  80.5  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 680 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 662 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 611 aa  79.7  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43940  TonB-dependent receptor family  24.19 
 
 		 715 aa  79.3  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.204907  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 634 aa  79.3  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 648 aa  79.3  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  37.5 
 
 		 747 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5752  TonB-dependent receptor  35.14 
 
 		 746 aa  79.7  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0523831  hitchhiker  0.0000000000276247 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2576  TonB-dependent receptor  34 
 
 		 783 aa  79.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138902 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  32.28 
 
 		 617 aa  79  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  25.38 
 
 		 611 aa  79  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  28.18 
 
 		 628 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3634  TonB-dependent receptor, plug  31.37 
 
 		 668 aa  78.6  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  36 
 
 		 668 aa  78.6  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  30.16 
 
 		 732 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 656 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03368  putative TonB-dependent receptor  32.04 
 
 		 754 aa  78.6  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00133491  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 613 aa  78.6  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1992  TonB-dependent receptor, plug  37.5 
 
 		 671 aa  78.6  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.643758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.39 
 
 		 631 aa  78.2  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 778 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 597 aa  77.8  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  32.3 
 
 		 713 aa  77.4  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0635  TonB-dependent receptor, plug  27.54 
 
 		 706 aa  77.4  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 637 aa  77.4  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  35.92 
 
 		 679 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  34.35 
 
 		 686 aa  76.6  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 662 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 649 aa  76.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 662 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 778 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  27.41 
 
 		 613 aa  76.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2789  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 675 aa  75.5  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 786 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  30.07 
 
 		 652 aa  75.9  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  33.15 
 
 		 619 aa  75.5  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  40.94 
 
 		 616 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>