More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0104 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0104  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 678 aa  1362    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479806  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  32.91 
 
 		 670 aa  229  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3157  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 714 aa  225  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0132  TonB-dependent receptor  33.6 
 
 		 679 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.691558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2036  TonB-dependent receptor  31.32 
 
 		 687 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 643 aa  202  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3661  hypothetical protein  27.86 
 
 		 702 aa  201  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0552  TonB-dependent receptor, plug  28.7 
 
 		 653 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1697  TonB-dependent receptor, plug  27.03 
 
 		 704 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3742  TonB-dependent receptor plug  27.13 
 
 		 715 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43650  hypothetical protein  28.12 
 
 		 705 aa  194  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00638923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4171  hypothetical protein  27.03 
 
 		 704 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3494  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 		 715 aa  191  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4209  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 707 aa  186  9e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3416  TonB-dependent receptor plug  26.84 
 
 		 684 aa  158  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.717717  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3002  TonB-dependent receptor plug  23.73 
 
 		 668 aa  145  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.957092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1362  TonB-dependent receptor, plug  42.86 
 
 		 737 aa  103  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0352862  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  26.27 
 
 		 653 aa  97.8  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 726 aa  97.8  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  24.75 
 
 		 655 aa  93.2  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  35.09 
 
 		 678 aa  92  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 699 aa  91.3  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 671 aa  91.3  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  26.89 
 
 		 652 aa  90.5  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  26.87 
 
 		 615 aa  89.4  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 		 893 aa  87  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 709 aa  87.4  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  24.89 
 
 		 662 aa  87  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  25 
 
 		 663 aa  87  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  24.95 
 
 		 680 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 652 aa  86.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  24.67 
 
 		 663 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  23.73 
 
 		 666 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  23.29 
 
 		 652 aa  84.3  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  23.42 
 
 		 666 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  23.42 
 
 		 666 aa  84  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  26.58 
 
 		 665 aa  83.2  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 710 aa  83.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  23.42 
 
 		 666 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  35.92 
 
 		 676 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1321  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 724 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  24.95 
 
 		 661 aa  81.3  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 613 aa  80.5  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  34.04 
 
 		 747 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  23.22 
 
 		 666 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 602 aa  80.5  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2900  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  22.82 
 
 		 686 aa  79.7  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  23.46 
 
 		 641 aa  79  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  32.91 
 
 		 718 aa  78.2  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  34.51 
 
 		 642 aa  78.2  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  33.9 
 
 		 705 aa  77.8  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 698 aa  77.4  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 698 aa  77.4  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 698 aa  77.4  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  28.35 
 
 		 628 aa  77.4  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  20.66 
 
 		 647 aa  77  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  35.2 
 
 		 680 aa  77  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 681 aa  76.6  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 715 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 637 aa  77  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  22.86 
 
 		 649 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  24.49 
 
 		 663 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3850  TonB-dependent receptor  36.25 
 
 		 671 aa  76.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.302325  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  24.49 
 
 		 663 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  24.49 
 
 		 663 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3097  TonB-dependent receptor, plug  33.17 
 
 		 671 aa  75.9  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  24.49 
 
 		 663 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  24.49 
 
 		 663 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  30.77 
 
 		 646 aa  75.5  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2735  TonB-dependent receptor, plug  34.36 
 
 		 650 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  24.49 
 
 		 656 aa  75.9  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  35.76 
 
 		 743 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  23.36 
 
 		 639 aa  75.1  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  24.49 
 
 		 663 aa  75.1  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  21.78 
 
 		 696 aa  74.7  0.000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0777  TonB-dependent receptor plug  33.54 
 
 		 645 aa  74.7  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  29.15 
 
 		 668 aa  74.7  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 618 aa  74.3  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 638 aa  73.9  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  24.85 
 
 		 659 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  26.29 
 
 		 739 aa  72.8  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3833  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  34.9 
 
 		 667 aa  72.8  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  27.65 
 
 		 613 aa  72  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  23.02 
 
 		 665 aa  72  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  28.38 
 
 		 615 aa  72  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  23.02 
 
 		 665 aa  72  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.33 
 
 		 656 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0769  TonB-dependent receptor, plug  28.9 
 
 		 687 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2952  TonB-dependent receptor  33.1 
 
 		 645 aa  71.2  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.771516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  35.16 
 
 		 707 aa  71.2  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  27.05 
 
 		 618 aa  71.2  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1383  TonB-dependent receptor  35.07 
 
 		 702 aa  71.2  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00790883  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0273  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 602 aa  70.9  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0292443  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5752  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 746 aa  70.9  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0523831  hitchhiker  0.0000000000276247 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 614 aa  70.5  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1001  TonB-dependent receptor  22.56 
 
 		 628 aa  69.7  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.11298  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  33.1 
 
 		 681 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  23.35 
 
 		 656 aa  69.7  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  23.78 
 
 		 732 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1099  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 664 aa  69.3  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>