More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0132 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0132  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 679 aa  1383    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.691558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3157  TonB-dependent receptor  36.94 
 
 		 714 aa  423  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2036  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 687 aa  290  8e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  31.61 
 
 		 670 aa  270  8.999999999999999e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0552  TonB-dependent receptor, plug  34.03 
 
 		 653 aa  263  8.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  35.23 
 
 		 643 aa  250  5e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3416  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 684 aa  229  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.717717  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0104  TonB-dependent receptor  33.4 
 
 		 678 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479806  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1697  TonB-dependent receptor, plug  29.05 
 
 		 704 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1362  TonB-dependent receptor, plug  28.69 
 
 		 737 aa  205  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0352862  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3661  hypothetical protein  30.73 
 
 		 702 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3002  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 		 668 aa  174  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.957092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4209  TonB-dependent receptor  43.83 
 
 		 707 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3742  TonB-dependent receptor plug  41.27 
 
 		 715 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3494  TonB-dependent receptor plug  42.55 
 
 		 715 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4171  hypothetical protein  36.55 
 
 		 704 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43650  hypothetical protein  39.58 
 
 		 705 aa  160  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00638923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  35.32 
 
 		 710 aa  120  7.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  36.76 
 
 		 642 aa  118  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  31.18 
 
 		 676 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  28.12 
 
 		 680 aa  109  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  26.16 
 
 		 662 aa  108  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  34.94 
 
 		 718 aa  105  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  34.1 
 
 		 678 aa  103  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  30 
 
 		 615 aa  100  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0769  TonB-dependent receptor, plug  35.76 
 
 		 687 aa  99.4  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  30.94 
 
 		 641 aa  93.2  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  35 
 
 		 686 aa  90.1  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.41 
 
 		 656 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  24.45 
 
 		 650 aa  89.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 709 aa  89.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 652 aa  89.7  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  24.25 
 
 		 650 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  25.78 
 
 		 700 aa  88.2  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  24.25 
 
 		 650 aa  88.2  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  24.25 
 
 		 650 aa  87.8  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0123  TonB-dependent receptor plug  35.12 
 
 		 670 aa  87.8  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0182279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  24.25 
 
 		 650 aa  87.4  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  22.1 
 
 		 647 aa  87  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 671 aa  87  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0777  TonB-dependent receptor plug  24.79 
 
 		 645 aa  86.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 699 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1992  TonB-dependent receptor, plug  31.31 
 
 		 671 aa  86.3  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.643758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3833  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  32.89 
 
 		 667 aa  85.5  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0883  ferric enterobactin receptor, putative  29.61 
 
 		 627 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.277897  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  32.35 
 
 		 652 aa  84.7  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 681 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1266  TonB-dependent iron complex outermembrane receptor protein  23.66 
 
 		 673 aa  82.8  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.92 
 
 		 623 aa  82.8  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  25.64 
 
 		 646 aa  82.4  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  29.61 
 
 		 618 aa  82  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3634  TonB-dependent receptor, plug  27.38 
 
 		 668 aa  82.4  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 705 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  22.65 
 
 		 659 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1229  TonB-dependent receptor plug  30.59 
 
 		 662 aa  81.6  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2952  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 645 aa  80.9  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.771516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 715 aa  80.9  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 634 aa  80.9  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 893 aa  80.9  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2789  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 675 aa  79.3  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.15 
 
 		 614 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1447  TonB-dependent receptor  22.13 
 
 		 632 aa  79.3  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  22.32 
 
 		 663 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  22.33 
 
 		 663 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.15 
 
 		 614 aa  79  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.15 
 
 		 614 aa  79  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  22.33 
 
 		 663 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  22.32 
 
 		 663 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  22.33 
 
 		 663 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  22.33 
 
 		 663 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 613 aa  77.8  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  34.65 
 
 		 680 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  36.24 
 
 		 617 aa  77.4  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.95 
 
 		 614 aa  77.4  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  32.24 
 
 		 593 aa  77.4  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.95 
 
 		 614 aa  77.4  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  26.12 
 
 		 614 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.12 
 
 		 614 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.12 
 
 		 614 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.12 
 
 		 614 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3850  TonB-dependent receptor  34.04 
 
 		 671 aa  77  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.302325  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  29.86 
 
 		 611 aa  76.6  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 626 aa  76.3  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  37.06 
 
 		 655 aa  76.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  23.35 
 
 		 680 aa  76.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 626 aa  76.3  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  31.15 
 
 		 665 aa  75.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1262  TonB-dependent receptor  22.33 
 
 		 651 aa  76.6  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612585  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.33 
 
 		 614 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1383  TonB-dependent receptor  33.53 
 
 		 702 aa  76.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00790883  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 611 aa  75.1  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  34 
 
 		 762 aa  75.1  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  36.11 
 
 		 658 aa  75.1  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  39.1 
 
 		 641 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3790  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  30.23 
 
 		 716 aa  74.7  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 		 664 aa  74.3  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.57 
 
 		 614 aa  73.9  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25 
 
 		 647 aa  73.9  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  23.68 
 
 		 656 aa  73.6  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2735  TonB-dependent receptor, plug  30.8 
 
 		 650 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>