More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05847 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  100 
 
 		 718 aa  1494    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 715 aa  185  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  25.78 
 
 		 680 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  25.83 
 
 		 678 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  25.04 
 
 		 642 aa  174  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  27.72 
 
 		 676 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  26.08 
 
 		 615 aa  167  9e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  26.54 
 
 		 662 aa  159  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0769  TonB-dependent receptor, plug  26.87 
 
 		 687 aa  159  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0777  TonB-dependent receptor plug  24.36 
 
 		 645 aa  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 710 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3833  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  27.8 
 
 		 667 aa  143  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  33.62 
 
 		 643 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3157  TonB-dependent receptor  38.35 
 
 		 714 aa  114  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  36.31 
 
 		 670 aa  109  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0132  TonB-dependent receptor  34.94 
 
 		 679 aa  105  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.691558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4209  TonB-dependent receptor  39.39 
 
 		 707 aa  104  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  35.37 
 
 		 634 aa  102  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3661  hypothetical protein  37.78 
 
 		 702 aa  101  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3416  TonB-dependent receptor plug  33.54 
 
 		 684 aa  100  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.717717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43650  hypothetical protein  36.3 
 
 		 705 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00638923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  30.25 
 
 		 641 aa  98.6  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  35.96 
 
 		 680 aa  98.2  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3494  TonB-dependent receptor plug  32.47 
 
 		 715 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4171  hypothetical protein  35.94 
 
 		 704 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1697  TonB-dependent receptor, plug  36.22 
 
 		 704 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3742  TonB-dependent receptor plug  36.22 
 
 		 715 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  36.09 
 
 		 652 aa  95.5  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 		 705 aa  93.6  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2036  TonB-dependent receptor  32.99 
 
 		 687 aa  93.6  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  23.31 
 
 		 633 aa  92.8  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  33.74 
 
 		 624 aa  91.3  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  34.38 
 
 		 762 aa  91.7  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1362  TonB-dependent receptor, plug  32.43 
 
 		 737 aa  90.9  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0352862  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  31.65 
 
 		 638 aa  90.9  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3845  TonB-dependent receptor plug  34.16 
 
 		 696 aa  89.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5117  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 801 aa  89.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  31.58 
 
 		 617 aa  88.6  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1928  TonB-dependent receptor  33.93 
 
 		 676 aa  89  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00435524  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  21.61 
 
 		 649 aa  88.6  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 681 aa  87.4  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 720 aa  87  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  31.31 
 
 		 653 aa  86.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 699 aa  86.7  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  33.83 
 
 		 641 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  33.83 
 
 		 663 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  33.83 
 
 		 663 aa  86.7  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0123  TonB-dependent receptor plug  33.56 
 
 		 670 aa  85.9  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0182279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  33.83 
 
 		 659 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  33.83 
 
 		 663 aa  86.7  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  32.87 
 
 		 656 aa  86.7  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  33.83 
 
 		 663 aa  86.7  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  29.9 
 
 		 614 aa  85.9  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  33.83 
 
 		 663 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  33.83 
 
 		 663 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 635 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1229  TonB-dependent receptor plug  31.63 
 
 		 662 aa  86.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  32.26 
 
 		 679 aa  86.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  29.19 
 
 		 646 aa  85.9  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2576  TonB-dependent receptor  38.78 
 
 		 783 aa  85.1  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138902 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  36.73 
 
 		 653 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  33.08 
 
 		 650 aa  84.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  33.08 
 
 		 650 aa  84.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  33.08 
 
 		 650 aa  84.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  33.08 
 
 		 650 aa  84.7  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 710 aa  84.7  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  33.08 
 
 		 650 aa  84.7  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  33.17 
 
 		 671 aa  84.3  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 695 aa  84.3  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  33.17 
 
 		 699 aa  84.3  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  22.48 
 
 		 707 aa  84  0.000000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  35.37 
 
 		 1023 aa  83.6  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  29.34 
 
 		 715 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  34.59 
 
 		 647 aa  82.8  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 694 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  32.63 
 
 		 615 aa  83.2  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 709 aa  82  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  24.24 
 
 		 639 aa  82.4  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1445  TonB-dependent receptor, putative  35.5 
 
 		 593 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  33.93 
 
 		 742 aa  81.6  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  34.21 
 
 		 637 aa  81.6  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 593 aa  81.6  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  34.34 
 
 		 616 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  34.9 
 
 		 636 aa  81.3  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  34.23 
 
 		 673 aa  80.9  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0552  TonB-dependent receptor, plug  31.11 
 
 		 653 aa  80.9  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  35.54 
 
 		 678 aa  80.5  0.00000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 688 aa  80.5  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  31.11 
 
 		 713 aa  80.5  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  24.43 
 
 		 611 aa  80.1  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  22.89 
 
 		 680 aa  80.5  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  31.25 
 
 		 618 aa  80.5  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 		 657 aa  79.3  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0483  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  27.96 
 
 		 271 aa  79.3  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00522803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 642 aa  79.7  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  33.54 
 
 		 634 aa  79.7  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  32.4 
 
 		 671 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1992  TonB-dependent receptor, plug  29.38 
 
 		 671 aa  79.7  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.643758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0448  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  27.96 
 
 		 271 aa  79.3  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  34.33 
 
 		 682 aa  79  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>