More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3634 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008607  Ppro_3634  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 668 aa  1377    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 705 aa  147  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  24.26 
 
 		 641 aa  99.8  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  24.74 
 
 		 652 aa  99.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1229  TonB-dependent receptor plug  25.13 
 
 		 662 aa  99  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2789  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 675 aa  97.8  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3845  TonB-dependent receptor plug  26.51 
 
 		 696 aa  94.4  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  25.58 
 
 		 650 aa  93.2  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 649 aa  92.8  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  30.09 
 
 		 615 aa  92  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 669 aa  92  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 710 aa  91.7  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 		 715 aa  92  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  26 
 
 		 641 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  34.81 
 
 		 670 aa  91.3  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  24.64 
 
 		 656 aa  91.3  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  35.88 
 
 		 642 aa  91.3  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  38.78 
 
 		 643 aa  90.5  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  25.2 
 
 		 663 aa  90.5  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  25.2 
 
 		 659 aa  90.5  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  25.2 
 
 		 663 aa  90.5  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  25.2 
 
 		 663 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 		 663 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  25.2 
 
 		 663 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  25.2 
 
 		 663 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  31.49 
 
 		 676 aa  88.6  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1266  TonB-dependent iron complex outermembrane receptor protein  36.71 
 
 		 673 aa  86.7  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 710 aa  87  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 680 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  28.57 
 
 		 678 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  27.29 
 
 		 650 aa  85.1  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  26.72 
 
 		 650 aa  84.3  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  26.72 
 
 		 650 aa  84.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  26.72 
 
 		 650 aa  84.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  26.72 
 
 		 650 aa  84.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  22.71 
 
 		 662 aa  83.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1524  TonB-dependent receptor plug  24.51 
 
 		 605 aa  83.2  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  24.03 
 
 		 639 aa  82.8  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  24.13 
 
 		 655 aa  82.8  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1594  TonB-dependent receptor, plug  30.67 
 
 		 348 aa  82.8  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0132  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 679 aa  82.4  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.691558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0028  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 641 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3416  TonB-dependent receptor plug  37.59 
 
 		 684 aa  81.6  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.717717  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  23.98 
 
 		 646 aa  80.1  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  23.03 
 
 		 704 aa  79.7  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0795  thiamine monophosphate synthase  30.62 
 
 		 793 aa  80.1  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.277241 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0777  TonB-dependent receptor plug  32.48 
 
 		 645 aa  79.3  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  24.47 
 
 		 686 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 653 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3661  hypothetical protein  31.37 
 
 		 702 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0499  hypothetical protein  42.27 
 
 		 183 aa  79  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 611 aa  78.6  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43650  hypothetical protein  30.72 
 
 		 705 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00638923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 799 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 799 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 681 aa  77.8  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  34.88 
 
 		 634 aa  77.8  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  34.02 
 
 		 638 aa  77  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 671 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0552  TonB-dependent receptor, plug  34.19 
 
 		 653 aa  77  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  38.81 
 
 		 664 aa  76.6  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  29.41 
 
 		 680 aa  77  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  32.04 
 
 		 699 aa  76.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 635 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2036  TonB-dependent receptor  32.24 
 
 		 687 aa  75.9  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  25.15 
 
 		 700 aa  76.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  22.83 
 
 		 697 aa  75.5  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2952  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 645 aa  75.1  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.771516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  28.98 
 
 		 668 aa  74.3  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  38.17 
 
 		 634 aa  73.9  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3157  TonB-dependent receptor  35.44 
 
 		 714 aa  73.6  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4209  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 707 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  24.27 
 
 		 633 aa  73.6  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1383  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 702 aa  73.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00790883  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  31.58 
 
 		 702 aa  72.8  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  32.45 
 
 		 696 aa  72.4  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  32.5 
 
 		 698 aa  72.4  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1110  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 625 aa  72.8  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000459108  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 775 aa  72.8  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 799 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0769  TonB-dependent receptor, plug  26.64 
 
 		 687 aa  72  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2744  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 701 aa  72  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  22.61 
 
 		 665 aa  71.6  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3494  TonB-dependent receptor plug  24.67 
 
 		 715 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  22.61 
 
 		 665 aa  71.6  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  25.42 
 
 		 611 aa  71.2  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  22.61 
 
 		 665 aa  71.2  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2900  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  35.53 
 
 		 686 aa  70.9  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  23.73 
 
 		 665 aa  70.1  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4171  hypothetical protein  28.08 
 
 		 704 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7219  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 698 aa  70.1  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  21.73 
 
 		 640 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  37.4 
 
 		 616 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0883  ferric enterobactin receptor, putative  29 
 
 		 627 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.277897  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  22.58 
 
 		 702 aa  69.3  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 640 aa  69.3  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 698 aa  69.3  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1697  TonB-dependent receptor, plug  28.08 
 
 		 704 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3742  TonB-dependent receptor plug  28.08 
 
 		 715 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 713 aa  69.3  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>