More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3845 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3845  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 696 aa  1420    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1266  TonB-dependent iron complex outermembrane receptor protein  46.22 
 
 		 673 aa  571  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  36.66 
 
 		 699 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  36.54 
 
 		 652 aa  378  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  36.66 
 
 		 671 aa  379  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  34.45 
 
 		 680 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  34.04 
 
 		 681 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2789  TonB-dependent receptor  33.89 
 
 		 675 aa  303  9e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2952  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 645 aa  278  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.771516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1383  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 702 aa  278  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00790883  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3850  TonB-dependent receptor  32.37 
 
 		 671 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.302325  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1229  TonB-dependent receptor plug  33.54 
 
 		 662 aa  264  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 710 aa  146  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 705 aa  140  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  25.98 
 
 		 641 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 702 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  23.26 
 
 		 639 aa  114  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  25.59 
 
 		 653 aa  114  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2900  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  26.17 
 
 		 686 aa  113  9e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 698 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 698 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  22.83 
 
 		 704 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 698 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  26.2 
 
 		 695 aa  110  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  28.04 
 
 		 696 aa  109  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  28.04 
 
 		 696 aa  110  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  25.54 
 
 		 698 aa  104  6e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  22.73 
 
 		 666 aa  104  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  21.84 
 
 		 652 aa  103  9e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  22.34 
 
 		 655 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 726 aa  102  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  24.21 
 
 		 686 aa  102  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  22.36 
 
 		 736 aa  100  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  26.05 
 
 		 650 aa  100  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  34.24 
 
 		 718 aa  99.8  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.33 
 
 		 656 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  27.35 
 
 		 662 aa  98.2  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 698 aa  98.2  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 613 aa  96.3  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  23.68 
 
 		 641 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.75 
 
 		 614 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.75 
 
 		 614 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 740 aa  95.5  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  26.11 
 
 		 676 aa  95.1  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.95 
 
 		 614 aa  94.7  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.55 
 
 		 614 aa  94.4  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  22.29 
 
 		 617 aa  94.4  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3634  TonB-dependent receptor, plug  26.79 
 
 		 668 aa  94.4  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.55 
 
 		 614 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3157  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 714 aa  92.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 634 aa  92.8  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1110  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 625 aa  92.8  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000459108  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 657 aa  92.4  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  26.19 
 
 		 646 aa  91.7  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 713 aa  91.3  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.23 
 
 		 614 aa  91.3  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 643 aa  89.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  24.62 
 
 		 680 aa  88.6  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  23.85 
 
 		 696 aa  87.8  6e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  27.37 
 
 		 744 aa  87.8  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 799 aa  87.8  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  22.48 
 
 		 634 aa  87.8  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 658 aa  86.7  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 641 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  27.38 
 
 		 744 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 710 aa  85.9  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  26.79 
 
 		 628 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  33.71 
 
 		 678 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  23.06 
 
 		 702 aa  85.5  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  37.14 
 
 		 670 aa  84.7  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  22.38 
 
 		 799 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  34.94 
 
 		 680 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  32.1 
 
 		 642 aa  84.7  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  26.28 
 
 		 744 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.65 
 
 		 614 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.65 
 
 		 614 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  24.43 
 
 		 623 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2036  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 687 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 715 aa  83.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  23.66 
 
 		 627 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.65 
 
 		 614 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  31.52 
 
 		 616 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.71 
 
 		 615 aa  83.2  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  36.96 
 
 		 615 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.93 
 
 		 614 aa  83.2  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 799 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  22.97 
 
 		 647 aa  82  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 653 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.46 
 
 		 614 aa  82  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  39.1 
 
 		 614 aa  81.6  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 688 aa  80.9  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0769  TonB-dependent receptor, plug  24.94 
 
 		 687 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3416  TonB-dependent receptor plug  25.86 
 
 		 684 aa  80.9  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.717717  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 737 aa  80.5  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  23.23 
 
 		 572 aa  80.5  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  26.08 
 
 		 739 aa  80.5  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 635 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.52 
 
 		 653 aa  79.3  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  35.77 
 
 		 697 aa  79.3  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  25.88 
 
 		 746 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>