More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3157 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3157  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 714 aa  1475    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0132  TonB-dependent receptor  36.94 
 
 		 679 aa  423  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.691558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2036  TonB-dependent receptor  33.62 
 
 		 687 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  38.48 
 
 		 643 aa  287  5e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0552  TonB-dependent receptor, plug  29.31 
 
 		 653 aa  259  9e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3416  TonB-dependent receptor plug  30.11 
 
 		 684 aa  258  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.717717  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  30.13 
 
 		 670 aa  243  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0104  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 678 aa  223  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479806  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1697  TonB-dependent receptor, plug  26.37 
 
 		 704 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3742  TonB-dependent receptor plug  26.12 
 
 		 715 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4171  hypothetical protein  25.98 
 
 		 704 aa  181  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3661  hypothetical protein  42.01 
 
 		 702 aa  157  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4209  TonB-dependent receptor  40.26 
 
 		 707 aa  152  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43650  hypothetical protein  44.62 
 
 		 705 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00638923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3494  TonB-dependent receptor plug  43.37 
 
 		 715 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1362  TonB-dependent receptor, plug  28.5 
 
 		 737 aa  148  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0352862  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3002  TonB-dependent receptor plug  25.29 
 
 		 668 aa  141  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.957092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  29.98 
 
 		 662 aa  121  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  27.72 
 
 		 678 aa  117  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  37.62 
 
 		 710 aa  115  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  27.4 
 
 		 676 aa  114  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  38.35 
 
 		 718 aa  114  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  27.99 
 
 		 680 aa  112  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0769  TonB-dependent receptor, plug  24.41 
 
 		 687 aa  109  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  39.6 
 
 		 642 aa  109  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  26.34 
 
 		 615 aa  107  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 715 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 681 aa  102  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  33.33 
 
 		 641 aa  94.4  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0777  TonB-dependent receptor plug  23.61 
 
 		 645 aa  92.4  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 649 aa  91.3  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3845  TonB-dependent receptor plug  24.67 
 
 		 696 aa  90.1  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2789  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 675 aa  88.6  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  32.11 
 
 		 652 aa  88.2  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  32.63 
 
 		 671 aa  87.8  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  33.17 
 
 		 618 aa  87.4  8e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 		 699 aa  87.4  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 652 aa  85.1  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 705 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3833  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.99 
 
 		 667 aa  85.1  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  33.16 
 
 		 713 aa  84.7  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0123  TonB-dependent receptor plug  24.29 
 
 		 670 aa  84  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0182279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3850  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 671 aa  84  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.302325  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1229  TonB-dependent receptor plug  30.07 
 
 		 662 aa  83.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  32.16 
 
 		 663 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  32.16 
 
 		 663 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  32.16 
 
 		 663 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  32.16 
 
 		 663 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  32.16 
 
 		 663 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  32.16 
 
 		 663 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  32.16 
 
 		 659 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  25.42 
 
 		 732 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  25.27 
 
 		 652 aa  82.8  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 704 aa  82.4  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0883  ferric enterobactin receptor, putative  29.73 
 
 		 627 aa  82  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.277897  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  33.93 
 
 		 656 aa  81.6  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  34.36 
 
 		 665 aa  81.6  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 675 aa  80.9  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  24.95 
 
 		 655 aa  80.5  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  28.32 
 
 		 647 aa  80.1  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4967  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 698 aa  80.1  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.655024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  34.91 
 
 		 653 aa  79.7  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  30.56 
 
 		 613 aa  79.7  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 680 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  36.57 
 
 		 747 aa  79  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  32.93 
 
 		 639 aa  77.8  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  36.25 
 
 		 617 aa  77.4  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2952  TonB-dependent receptor  32.45 
 
 		 645 aa  77  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.771516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  31.21 
 
 		 650 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  34.07 
 
 		 641 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  31.21 
 
 		 650 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 680 aa  76.6  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  31.21 
 
 		 650 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  31.21 
 
 		 650 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  31.21 
 
 		 650 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1383  TonB-dependent receptor  32.62 
 
 		 702 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00790883  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  26.04 
 
 		 695 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1992  TonB-dependent receptor, plug  30.91 
 
 		 671 aa  75.9  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.643758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 665 aa  75.5  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  40.15 
 
 		 637 aa  75.1  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0635  TonB-dependent receptor, plug  30.09 
 
 		 706 aa  75.5  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  34.48 
 
 		 714 aa  74.7  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  32.04 
 
 		 686 aa  74.3  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1964  TonB-dependent receptor, plug  32.18 
 
 		 618 aa  74.3  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 893 aa  73.9  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  34.91 
 
 		 668 aa  73.9  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.11 
 
 		 656 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1266  TonB-dependent iron complex outermembrane receptor protein  29.69 
 
 		 673 aa  73.2  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  25.53 
 
 		 700 aa  73.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 700 aa  73.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 720 aa  73.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 695 aa  73.6  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3634  TonB-dependent receptor, plug  35.44 
 
 		 668 aa  73.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 679 aa  73.9  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 681 aa  73.2  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1977  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA 2 (Sulfate-transporting ATPase 2)  33.51 
 
 		 326 aa  72.4  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0273  TonB-dependent receptor  34 
 
 		 602 aa  73.2  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0292443  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  28.57 
 
 		 646 aa  72.4  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  28.34 
 
 		 695 aa  72  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 634 aa  72  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>