More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1594 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1594  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 
348 aa  714    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 
705 aa  93.6  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 
710 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2900  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  30.1 
 
 
686 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  33.74 
 
 
742 aa  76.6  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3634  TonB-dependent receptor, plug  30.41 
 
 
668 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  33.73 
 
 
638 aa  75.1  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 
715 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  32.3 
 
 
646 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3833  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  33.89 
 
 
667 aa  71.2  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  32.92 
 
 
641 aa  70.1  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  29.03 
 
 
645 aa  70.1  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 
742 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3500  TonB-dependent receptor  36.45 
 
 
699 aa  69.7  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  37.27 
 
 
669 aa  68.9  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  35.07 
 
 
650 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  30.59 
 
 
833 aa  68.2  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 
710 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  34.55 
 
 
651 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2576  TonB-dependent receptor  33.11 
 
 
783 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138902 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  31.35 
 
 
747 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 
665 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  32.3 
 
 
763 aa  68.6  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  34.13 
 
 
653 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 
634 aa  67.4  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  34.13 
 
 
652 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  34.13 
 
 
653 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  34.88 
 
 
694 aa  66.2  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  30.82 
 
 
656 aa  66.2  0.0000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  30.37 
 
 
680 aa  66.2  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  32.73 
 
 
634 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  33.53 
 
 
653 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  31.13 
 
 
848 aa  65.9  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1362  TonB-dependent receptor, plug  30.29 
 
 
737 aa  65.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0352862  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 
634 aa  65.5  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1368  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 
627 aa  65.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.249969  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  29.51 
 
 
697 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 
665 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.33 
 
 
728 aa  63.5  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 
737 aa  63.5  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  29.8 
 
 
676 aa  63.5  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  35.83 
 
 
739 aa  63.2  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.43 
 
 
614 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  26.8 
 
 
759 aa  62.8  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  27.92 
 
 
614 aa  62  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2789  TonB-dependent receptor  34.01 
 
 
675 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3790  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  30.53 
 
 
716 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11789  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.92 
 
 
614 aa  62  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.92 
 
 
614 aa  62  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  33.83 
 
 
686 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  33.57 
 
 
653 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.92 
 
 
614 aa  62  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  28.93 
 
 
704 aa  62  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.58 
 
 
631 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 
944 aa  62  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  33.73 
 
 
614 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  30 
 
 
671 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  33.57 
 
 
653 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 
706 aa  61.2  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  33.57 
 
 
653 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  27.15 
 
 
751 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  27.15 
 
 
751 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 
709 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  28.02 
 
 
751 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  29.31 
 
 
653 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25 
 
 
614 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  32.19 
 
 
762 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  28.02 
 
 
751 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  30.99 
 
 
661 aa  60.8  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 
597 aa  60.5  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  32.26 
 
 
633 aa  60.5  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  32.79 
 
 
647 aa  60.5  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  31.25 
 
 
659 aa  60.5  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  28.9 
 
 
653 aa  60.1  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.9 
 
 
614 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1383  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 
702 aa  60.1  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00790883  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  31.54 
 
 
706 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1928  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 
676 aa  59.7  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00435524  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.9 
 
 
614 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4209  TonB-dependent receptor  31.69 
 
 
707 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  31.79 
 
 
639 aa  59.7  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 
682 aa  59.7  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.9 
 
 
614 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1964  TonB-dependent receptor, plug  33.61 
 
 
618 aa  59.7  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.9 
 
 
614 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.9 
 
 
614 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0132  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 
679 aa  59.7  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.691558  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0638  outer membrane receptor FepA  28.02 
 
 
751 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  33.64 
 
 
659 aa  59.7  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  30.95 
 
 
615 aa  59.3  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  28.43 
 
 
718 aa  59.7  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  31.75 
 
 
714 aa  59.3  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 
614 aa  59.3  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  31.54 
 
 
706 aa  59.3  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3743  outer membrane receptor FepA  28.8 
 
 
766 aa  59.3  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.325826  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.82 
 
 
631 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 
624 aa  58.9  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  30.16 
 
 
656 aa  58.5  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  27.94 
 
 
700 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 
700 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>