More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3500 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3500  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 699 aa  1419    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  31.64 
 
 		 665 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 651 aa  298  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 669 aa  237  7e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0131  TonB-dependent receptor, plug  29.82 
 
 		 677 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4088  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 650 aa  213  7e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0094  TonB-dependent receptor  30.02 
 
 		 649 aa  207  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4450  TonB-dependent receptor plug  33.64 
 
 		 767 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4310  TonB-dependent receptor plug  33.64 
 
 		 737 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4255  TonB-dependent receptor plug  33.74 
 
 		 749 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0089  TonB-dependent receptor, plug  33.33 
 
 		 707 aa  153  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3960  TonB-dependent receptor, plug  33.44 
 
 		 741 aa  148  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3867  TonB-dependent receptor, plug  33.12 
 
 		 729 aa  146  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3676  TonB-dependent receptor, plug  36 
 
 		 735 aa  140  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0131  TonB-dependent receptor  34.07 
 
 		 695 aa  134  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0151  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.84 
 
 		 675 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3220  TonB-dependent receptor  22.34 
 
 		 654 aa  109  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3697  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 731 aa  106  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5501  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 731 aa  106  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3366  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 708 aa  104  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 670 aa  104  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1191  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 744 aa  104  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.601925 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1171  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 697 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 		 678 aa  102  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2482  TonB-dependent receptor  22.31 
 
 		 728 aa  100  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4645  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 693 aa  97.8  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318415 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  31.99 
 
 		 653 aa  97.4  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0941  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 716 aa  95.5  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 634 aa  93.6  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  34.15 
 
 		 639 aa  89  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1368  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 627 aa  88.6  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.249969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  33.12 
 
 		 613 aa  87  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  31.08 
 
 		 634 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1472  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 683 aa  85.1  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.907424  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 647 aa  85.1  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  35.33 
 
 		 659 aa  84.7  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  28.9 
 
 		 612 aa  84.3  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  33.95 
 
 		 626 aa  84  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1481  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 674 aa  84  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0173398  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  26.84 
 
 		 638 aa  83.6  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 643 aa  83.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  33.95 
 
 		 626 aa  83.6  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  31.38 
 
 		 646 aa  83.2  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 678 aa  83.2  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0444  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 667 aa  82.4  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0363  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 		 649 aa  81.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  27.73 
 
 		 712 aa  80.9  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  27.83 
 
 		 759 aa  80.9  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  31.41 
 
 		 706 aa  80.5  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0448  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  30.08 
 
 		 271 aa  80.1  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  29.28 
 
 		 615 aa  80.5  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  37.59 
 
 		 699 aa  80.1  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  29.65 
 
 		 617 aa  80.1  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  30.84 
 
 		 690 aa  80.5  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0483  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  30.08 
 
 		 271 aa  80.1  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00522803  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0883  ferric enterobactin receptor, putative  27.81 
 
 		 627 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.277897  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4483  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 737 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.00000231942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  31.46 
 
 		 665 aa  79.3  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  31.46 
 
 		 665 aa  79.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2514  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 632 aa  79.7  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  31.46 
 
 		 665 aa  79.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  32 
 
 		 681 aa  79  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  30.2 
 
 		 597 aa  78.6  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  23.17 
 
 		 650 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 		 711 aa  79  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  23.17 
 
 		 650 aa  78.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  23.17 
 
 		 650 aa  78.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 751 aa  78.2  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  23 
 
 		 650 aa  77.4  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  33.97 
 
 		 662 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.92 
 
 		 713 aa  76.6  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  31.65 
 
 		 751 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  31.65 
 
 		 751 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0604  TonB-dependent outer membrane receptor  28.67 
 
 		 682 aa  76.6  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 642 aa  77  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  33.56 
 
 		 746 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1549  TonB-dependent receptor  21.08 
 
 		 656 aa  77  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751142  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  31.65 
 
 		 751 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  31.65 
 
 		 751 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  33.12 
 
 		 628 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  33.56 
 
 		 746 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0633  outer membrane receptor FepA  33.56 
 
 		 746 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  33.56 
 
 		 746 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  33.56 
 
 		 746 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 		 695 aa  76.3  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0485  outer membrane receptor FepA  33.56 
 
 		 746 aa  76.3  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6077  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 656 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  29.9 
 
 		 651 aa  76.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  33.56 
 
 		 746 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1989  TonB-dependent receptor  22.91 
 
 		 675 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000419445  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  35.17 
 
 		 653 aa  76.6  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  35.04 
 
 		 650 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  33.56 
 
 		 746 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52120  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 668 aa  75.9  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.618776  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0350  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 651 aa  75.5  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513607  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0638  outer membrane receptor FepA  31.01 
 
 		 751 aa  75.1  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  29.52 
 
 		 636 aa  75.5  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 614 aa  75.1  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 682 aa  75.1  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3097  TonB-dependent receptor, plug  33.33 
 
 		 671 aa  75.1  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>