More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1541 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 665 aa  1372    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  41.47 
 
 		 651 aa  478  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  36.5 
 
 		 669 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0131  TonB-dependent receptor, plug  32.18 
 
 		 677 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3500  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 699 aa  314  3.9999999999999997e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4088  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 650 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0094  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 649 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  29.26 
 
 		 653 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3960  TonB-dependent receptor, plug  40.18 
 
 		 741 aa  232  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3867  TonB-dependent receptor, plug  39.88 
 
 		 729 aa  229  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4450  TonB-dependent receptor plug  39.02 
 
 		 767 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4255  TonB-dependent receptor plug  38.73 
 
 		 749 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4310  TonB-dependent receptor plug  38.73 
 
 		 737 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0089  TonB-dependent receptor, plug  38.46 
 
 		 707 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0131  TonB-dependent receptor  38.25 
 
 		 695 aa  209  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3676  TonB-dependent receptor, plug  36.9 
 
 		 735 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3220  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 654 aa  191  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  26.62 
 
 		 678 aa  178  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0151  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  26.52 
 
 		 675 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1171  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 697 aa  175  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1472  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 683 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.907424  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52120  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 668 aa  159  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.618776  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1989  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 675 aa  160  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000419445  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0604  TonB-dependent outer membrane receptor  24.26 
 
 		 682 aa  157  7e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1481  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 674 aa  157  8e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0173398  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0444  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 667 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5341  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 657 aa  150  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2482  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 728 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3366  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 708 aa  147  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1983  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 727 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3697  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 731 aa  143  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5501  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 731 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1191  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 744 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.601925 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3699  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 685 aa  142  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  24.49 
 
 		 634 aa  140  7.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  26.35 
 
 		 646 aa  137  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0941  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 716 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2970  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 718 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222916  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1228  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 623 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0002097  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1549  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 656 aa  130  6e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751142  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  24.74 
 
 		 623 aa  130  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 736 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4645  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 693 aa  128  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318415 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  22.8 
 
 		 636 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4382  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 635 aa  124  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.429499  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0252  TonB-dependent receptor  21.97 
 
 		 663 aa  124  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.945527  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 618 aa  123  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1952  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 656 aa  122  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446334  normal  0.0364758 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  23.85 
 
 		 686 aa  120  6e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  25.75 
 
 		 659 aa  118  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 621 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  24.35 
 
 		 620 aa  114  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  23.28 
 
 		 639 aa  114  7.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 648 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  23.99 
 
 		 641 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 697 aa  111  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  36.65 
 
 		 634 aa  110  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.25 
 
 		 631 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 682 aa  108  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3667  TonB-dependent receptor plug  24.05 
 
 		 624 aa  108  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 709 aa  108  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 641 aa  108  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 642 aa  108  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.11 
 
 		 623 aa  106  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 		 657 aa  103  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  31.03 
 
 		 638 aa  102  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1978  TonB-dependent receptor plug  22.22 
 
 		 663 aa  100  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.500779  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6077  TonB-dependent receptor plug  22.73 
 
 		 656 aa  100  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  22.4 
 
 		 705 aa  99.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  21.01 
 
 		 613 aa  99.8  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 649 aa  99.4  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.4 
 
 		 631 aa  97.4  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1445  TonB-dependent receptor, putative  24.95 
 
 		 593 aa  96.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 698 aa  96.3  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 698 aa  96.3  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 698 aa  96.3  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.96 
 
 		 631 aa  95.1  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  23.11 
 
 		 713 aa  94.7  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  22.7 
 
 		 696 aa  93.6  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  22.7 
 
 		 696 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  22.86 
 
 		 695 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1516  TonB-dependent receptor  21.49 
 
 		 690 aa  92.8  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.18651  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  22.41 
 
 		 699 aa  92.8  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  23.04 
 
 		 656 aa  92.8  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 616 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  23.69 
 
 		 663 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  23.68 
 
 		 659 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1524  TonB-dependent receptor plug  39.07 
 
 		 605 aa  92.8  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  23.53 
 
 		 663 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0883  ferric enterobactin receptor, putative  23.65 
 
 		 627 aa  91.7  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.277897  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  23.53 
 
 		 663 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  23.82 
 
 		 663 aa  91.7  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2389  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 615 aa  91.3  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000607441  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  23.53 
 
 		 663 aa  91.3  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  23.53 
 
 		 663 aa  91.3  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  23.53 
 
 		 663 aa  91.3  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 649 aa  90.9  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 634 aa  90.5  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1368  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 627 aa  90.5  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.249969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  22.22 
 
 		 704 aa  90.5  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>