More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7219 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7219  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 698 aa  1436    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4648  TonB-dependent receptor  50.6 
 
 		 653 aa  650    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0653  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 675 aa  183  9.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  25.88 
 
 		 646 aa  118  5e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.87 
 
 		 653 aa  114  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1001  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 628 aa  107  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.11298  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 634 aa  105  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1301  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 634 aa  104  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 1128 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 642 aa  99.4  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  23.8 
 
 		 633 aa  97.8  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  23.07 
 
 		 661 aa  96.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  36.11 
 
 		 624 aa  95.1  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 757 aa  94.4  7e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 694 aa  94.4  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 707 aa  93.6  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 697 aa  93.2  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 713 aa  92.4  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  23.91 
 
 		 732 aa  91.7  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 649 aa  90.5  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 648 aa  90.9  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  24.95 
 
 		 620 aa  90.1  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 647 aa  89.4  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  22.35 
 
 		 657 aa  89.4  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  36.36 
 
 		 760 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 698 aa  88.6  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  22.78 
 
 		 640 aa  85.9  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  23.65 
 
 		 665 aa  86.3  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  26.27 
 
 		 833 aa  86.3  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  23.65 
 
 		 665 aa  86.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 661 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7217  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 707 aa  85.1  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  32.57 
 
 		 651 aa  85.1  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  23.51 
 
 		 665 aa  85.1  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0028  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 641 aa  84.7  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  21.96 
 
 		 617 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1142  TonB-dependent receptor-related protein  26.23 
 
 		 650 aa  84.3  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.22175  normal  0.0805488 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1651  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 648 aa  84  0.000000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613844 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  24.61 
 
 		 700 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  35 
 
 		 688 aa  83.6  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  31.84 
 
 		 663 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  31.84 
 
 		 663 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  31.84 
 
 		 663 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  31.84 
 
 		 663 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  31.84 
 
 		 663 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  31.84 
 
 		 659 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  31.84 
 
 		 663 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.2 
 
 		 619 aa  82  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1447  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 632 aa  81.6  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 649 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  23.03 
 
 		 655 aa  81.3  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  31.07 
 
 		 678 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  36.64 
 
 		 750 aa  80.9  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  35.37 
 
 		 650 aa  80.9  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  35.37 
 
 		 650 aa  80.9  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  35.37 
 
 		 650 aa  80.9  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  35.37 
 
 		 650 aa  80.9  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  35.37 
 
 		 650 aa  80.9  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  21.49 
 
 		 681 aa  80.5  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  22.57 
 
 		 662 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 751 aa  80.5  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 679 aa  80.1  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  36.72 
 
 		 748 aa  80.5  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  22.57 
 
 		 680 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  22.57 
 
 		 662 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  36.55 
 
 		 641 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 662 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0680  outer membrane receptor FepA  23.4 
 
 		 783 aa  79  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0125648  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.86 
 
 		 631 aa  79  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 649 aa  79  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  21.75 
 
 		 693 aa  78.2  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  22.54 
 
 		 649 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  33.54 
 
 		 842 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.26 
 
 		 656 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 621 aa  77.4  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 616 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.55 
 
 		 615 aa  77.8  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0621  TonB-dependent receptor plug  31.41 
 
 		 713 aa  77.8  0.0000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1206  putative TonB-dependent receptor  33.57 
 
 		 688 aa  77.4  0.0000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  31.32 
 
 		 597 aa  77.4  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  23.72 
 
 		 652 aa  77  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  37.8 
 
 		 753 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 841 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.89 
 
 		 631 aa  76.3  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  22.34 
 
 		 653 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  34.53 
 
 		 656 aa  75.9  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  29.55 
 
 		 614 aa  75.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  24.61 
 
 		 680 aa  76.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1928  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 676 aa  76.3  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00435524  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  34.09 
 
 		 1023 aa  75.9  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 763 aa  75.5  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  31.48 
 
 		 686 aa  74.7  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 699 aa  74.7  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  35.43 
 
 		 631 aa  74.3  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  33.09 
 
 		 626 aa  74.3  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0688  TonB-dependent receptor plug  32.03 
 
 		 1117 aa  74.3  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  23.29 
 
 		 665 aa  74.3  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.98 
 
 		 631 aa  74.3  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  33.09 
 
 		 626 aa  74.3  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  32.1 
 
 		 645 aa  73.9  0.000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>