More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1001 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1001  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 628 aa  1294    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.11298  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1301  TonB-dependent receptor  66.09 
 
 		 634 aa  875    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  40.18 
 
 		 651 aa  451  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 709 aa  133  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 638 aa  127  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  26.57 
 
 		 653 aa  122  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 698 aa  118  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 679 aa  118  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 649 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.77 
 
 		 619 aa  118  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  26.65 
 
 		 656 aa  115  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  24.43 
 
 		 646 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 621 aa  115  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  24.92 
 
 		 613 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  26.46 
 
 		 620 aa  114  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  23.01 
 
 		 634 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 697 aa  110  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 649 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.4 
 
 		 631 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7219  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 698 aa  108  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0521  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 617 aa  108  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 647 aa  107  5e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 648 aa  107  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.43 
 
 		 623 aa  106  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1524  TonB-dependent receptor plug  26.14 
 
 		 605 aa  106  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.76 
 
 		 615 aa  105  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 617 aa  105  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 634 aa  105  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  26.54 
 
 		 696 aa  104  6e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 695 aa  104  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1519  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 657 aa  103  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.148558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.38 
 
 		 631 aa  102  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 657 aa  102  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.24 
 
 		 615 aa  102  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.71 
 
 		 614 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 681 aa  102  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 602 aa  101  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.71 
 
 		 614 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2213  TonB-dependent receptor plug  25.24 
 
 		 621 aa  101  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.61 
 
 		 614 aa  101  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1447  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 632 aa  101  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.52 
 
 		 614 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.66 
 
 		 614 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 614 aa  100  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.52 
 
 		 614 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.61 
 
 		 614 aa  100  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.61 
 
 		 614 aa  100  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 662 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.61 
 
 		 614 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.62 
 
 		 631 aa  100  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.61 
 
 		 614 aa  100  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  25.99 
 
 		 663 aa  99  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.8 
 
 		 614 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  25.99 
 
 		 663 aa  99  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 662 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  26 
 
 		 659 aa  99  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  23.84 
 
 		 633 aa  99.8  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  25.93 
 
 		 647 aa  99.4  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 637 aa  99.4  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  26.22 
 
 		 628 aa  99  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  25.99 
 
 		 663 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  25.99 
 
 		 663 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  25.27 
 
 		 611 aa  98.6  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 682 aa  98.6  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  25.99 
 
 		 663 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  26.01 
 
 		 641 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.9 
 
 		 1023 aa  98.6  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  25.99 
 
 		 663 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  24.27 
 
 		 646 aa  98.2  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  25.38 
 
 		 634 aa  97.8  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 642 aa  97.8  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  23.67 
 
 		 639 aa  97.8  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.19 
 
 		 631 aa  97.8  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 680 aa  97.8  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1262  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 651 aa  97.8  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612585  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.44 
 
 		 656 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 698 aa  97.8  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1228  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 623 aa  97.8  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0002097  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  26.11 
 
 		 655 aa  97.4  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2071  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 629 aa  97.4  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00162344  hitchhiker  0.000156466 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 662 aa  97.1  9e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 626 aa  97.1  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 635 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 626 aa  96.3  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 649 aa  95.9  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  24.43 
 
 		 665 aa  95.5  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  24.29 
 
 		 665 aa  95.1  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 624 aa  95.5  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  24.29 
 
 		 665 aa  95.1  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  31.84 
 
 		 638 aa  94.7  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  24.95 
 
 		 628 aa  94.7  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  27.44 
 
 		 623 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  26 
 
 		 653 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 618 aa  94.7  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 611 aa  94.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1099  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 664 aa  94.4  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.05 
 
 		 616 aa  93.6  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  25.31 
 
 		 627 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  26.95 
 
 		 628 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0028  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 641 aa  93.2  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>