More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0249 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 688 aa  1395    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  41.94 
 
 		 694 aa  503  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1088  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 		 679 aa  412  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7217  TonB-dependent receptor  34.52 
 
 		 707 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 1128 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 613 aa  176  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  23.89 
 
 		 661 aa  156  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  23.72 
 
 		 639 aa  155  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  25.14 
 
 		 647 aa  154  7e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 634 aa  151  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  25.13 
 
 		 681 aa  150  7e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  21.76 
 
 		 633 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  24.18 
 
 		 677 aa  145  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 661 aa  144  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  23.2 
 
 		 640 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1928  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 676 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00435524  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 649 aa  137  5e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 649 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 653 aa  134  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.99 
 
 		 647 aa  131  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 680 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 662 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 699 aa  130  6e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 649 aa  130  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 662 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  26.06 
 
 		 653 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 662 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.79 
 
 		 656 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2172  TonB-dependent receptor, plug  26.14 
 
 		 687 aa  122  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  23.75 
 
 		 663 aa  121  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  23.75 
 
 		 663 aa  121  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  25.38 
 
 		 680 aa  120  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  27.1 
 
 		 638 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2818  TonB-dependent receptor, plug  27.96 
 
 		 691 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  22.63 
 
 		 713 aa  119  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1099  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 664 aa  117  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  23.29 
 
 		 663 aa  117  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001257  TonB-dependent heme receptor HutR  23.39 
 
 		 712 aa  117  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.299412  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0203  TonB-dependent receptor, plug  26.79 
 
 		 700 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.583502  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 740 aa  114  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  27.75 
 
 		 748 aa  114  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  35.2 
 
 		 751 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  23.79 
 
 		 634 aa  112  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0653  TonB-dependent receptor  21.23 
 
 		 675 aa  112  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  24.86 
 
 		 753 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  24.95 
 
 		 618 aa  112  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 763 aa  109  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  21.7 
 
 		 616 aa  110  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  21.67 
 
 		 653 aa  109  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  20.81 
 
 		 614 aa  108  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  24.18 
 
 		 668 aa  108  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.09 
 
 		 623 aa  108  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  22.18 
 
 		 602 aa  108  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  24.64 
 
 		 746 aa  107  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  25.04 
 
 		 746 aa  107  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  25.04 
 
 		 746 aa  107  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  21.85 
 
 		 617 aa  107  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  23.26 
 
 		 666 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  24.64 
 
 		 746 aa  107  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  24.64 
 
 		 746 aa  106  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  23.26 
 
 		 666 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0633  outer membrane receptor FepA  24.72 
 
 		 746 aa  107  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3043  TonB-dependent siderophore receptor  24.88 
 
 		 746 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0305175  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  23.09 
 
 		 666 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  26.35 
 
 		 623 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6730  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 733 aa  106  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.23656 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  23.26 
 
 		 666 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0485  outer membrane receptor FepA  24.64 
 
 		 746 aa  106  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  24.88 
 
 		 746 aa  105  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  37.5 
 
 		 663 aa  104  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  37.5 
 
 		 663 aa  104  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  37.5 
 
 		 663 aa  104  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  24.59 
 
 		 612 aa  105  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  37.5 
 
 		 659 aa  105  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  23.13 
 
 		 700 aa  104  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 641 aa  104  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 714 aa  103  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  21.33 
 
 		 628 aa  103  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  40.56 
 
 		 757 aa  103  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 638 aa  103  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.89 
 
 		 614 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.84 
 
 		 614 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 736 aa  103  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  39.71 
 
 		 656 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 726 aa  102  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.67 
 
 		 614 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  23.5 
 
 		 750 aa  102  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  23.36 
 
 		 686 aa  102  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  20.4 
 
 		 619 aa  102  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.67 
 
 		 614 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  33.7 
 
 		 833 aa  101  4e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  38.24 
 
 		 641 aa  101  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.56 
 
 		 614 aa  101  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  21.75 
 
 		 615 aa  101  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4555  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 734 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000444386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 611 aa  100  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  22.93 
 
 		 646 aa  100  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  37.33 
 
 		 650 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  37.33 
 
 		 650 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  37.33 
 
 		 650 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>