More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1274 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  51.55 
 
 		 769 aa  796    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 861 aa  1764    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5364  TonB-dependent receptor plug  37.21 
 
 		 729 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2744  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 701 aa  196  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1262  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 651 aa  184  6e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612585  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 679 aa  182  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1519  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 657 aa  171  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.148558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 678 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 649 aa  167  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1142  TonB-dependent receptor-related protein  26.47 
 
 		 650 aa  164  7e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.22175  normal  0.0805488 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0448  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  38.4 
 
 		 271 aa  159  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0483  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  38.4 
 
 		 271 aa  159  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00522803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1064  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 661 aa  159  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00188221  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  25.89 
 
 		 647 aa  154  7e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0028  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 641 aa  153  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  23.86 
 
 		 746 aa  132  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 828 aa  131  5.0000000000000004e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  22.95 
 
 		 744 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  22.95 
 
 		 744 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5752  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 746 aa  130  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0523831  hitchhiker  0.0000000000276247 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  22.67 
 
 		 744 aa  127  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.32 
 
 		 623 aa  112  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 		 836 aa  111  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  33.88 
 
 		 1040 aa  110  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.53 
 
 		 615 aa  109  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  33.07 
 
 		 1082 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.11 
 
 		 631 aa  108  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  24.48 
 
 		 712 aa  107  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  23.28 
 
 		 611 aa  106  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 1085 aa  104  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  28.85 
 
 		 776 aa  104  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 611 aa  103  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 653 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  22.32 
 
 		 649 aa  102  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  23.78 
 
 		 616 aa  102  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 893 aa  102  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 653 aa  102  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  23.68 
 
 		 617 aa  101  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4416  TonB-dependent receptor plug  30.89 
 
 		 996 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000494503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  32.38 
 
 		 1010 aa  100  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4224  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 		 1063 aa  99.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 815 aa  99  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  35 
 
 		 1161 aa  98.2  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  32.52 
 
 		 1085 aa  97.8  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.09 
 
 		 653 aa  97.1  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  22.43 
 
 		 694 aa  97.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 759 aa  97.4  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03722  outer membrane hemin receptor signal peptide protein  23.87 
 
 		 741 aa  96.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000281288  normal  0.0836882 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 1066 aa  96.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  33.33 
 
 		 1002 aa  96.3  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 742 aa  96.3  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  31.35 
 
 		 1148 aa  96.3  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  22.75 
 
 		 665 aa  96.7  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  22.41 
 
 		 646 aa  95.9  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  33.73 
 
 		 1102 aa  95.9  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  21.08 
 
 		 615 aa  95.9  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 648 aa  95.5  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  24.58 
 
 		 668 aa  95.5  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  30.57 
 
 		 1062 aa  95.1  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  21.73 
 
 		 614 aa  95.1  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0721  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  22.19 
 
 		 640 aa  95.1  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1321  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 724 aa  95.1  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 		 1019 aa  94.7  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  21.73 
 
 		 614 aa  94.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  21.73 
 
 		 614 aa  94.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 626 aa  94.7  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  21.73 
 
 		 614 aa  94.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  24.68 
 
 		 640 aa  94.4  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 698 aa  94.4  8e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 		 1027 aa  94.4  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  33.19 
 
 		 1004 aa  94.4  8e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 1064 aa  94.4  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 681 aa  93.6  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  33.76 
 
 		 1062 aa  94  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 657 aa  93.2  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  24.13 
 
 		 676 aa  93.2  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  34.03 
 
 		 1047 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 626 aa  93.2  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  31.5 
 
 		 1008 aa  93.2  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  21.36 
 
 		 614 aa  93.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 661 aa  93.2  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  27.37 
 
 		 795 aa  93.2  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  32.27 
 
 		 747 aa  93.2  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 757 aa  92.8  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  32.51 
 
 		 1026 aa  93.2  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  32.7 
 
 		 1101 aa  92.8  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  36.31 
 
 		 647 aa  92.4  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  23.51 
 
 		 634 aa  92.4  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  33.6 
 
 		 1060 aa  92  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  32.24 
 
 		 1033 aa  92  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1438  TonB-dependent receptor plug  32.69 
 
 		 999 aa  91.7  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.226679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  33.08 
 
 		 996 aa  91.7  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  23.16 
 
 		 680 aa  92  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 640 aa  91.7  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  23.55 
 
 		 613 aa  92  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 682 aa  91.7  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  20.83 
 
 		 631 aa  91.7  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001257  TonB-dependent heme receptor HutR  23.31 
 
 		 712 aa  91.7  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.299412  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1050 aa  91.3  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 670 aa  91.3  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>