More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1926 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  100 
 
 
627 aa  1266    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  53.87 
 
 
619 aa  614  9.999999999999999e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  49.29 
 
 
614 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0273  TonB-dependent receptor  43.3 
 
 
602 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0292443  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  41.38 
 
 
616 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  41.22 
 
 
616 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  40.91 
 
 
1023 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  37.06 
 
 
597 aa  361  3e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  39.14 
 
 
619 aa  353  7e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  38.38 
 
 
602 aa  337  5e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  36.6 
 
 
613 aa  328  2.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  37.2 
 
 
613 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  35.19 
 
 
628 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  32.7 
 
 
624 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  34.03 
 
 
628 aa  286  9e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 
638 aa  284  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  33.83 
 
 
612 aa  281  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  31.45 
 
 
617 aa  278  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  32.5 
 
 
628 aa  277  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 
627 aa  273  7e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  33.49 
 
 
623 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  33.44 
 
 
627 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  32.84 
 
 
641 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0521  TonB-dependent receptor  33.67 
 
 
617 aa  263  1e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  33.12 
 
 
631 aa  259  8e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  30.79 
 
 
616 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 
698 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1162  tonB-dependent vitamin B12 receptor  31.38 
 
 
622 aa  250  7e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 
624 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  31.37 
 
 
630 aa  241  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  30.55 
 
 
617 aa  241  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  33.01 
 
 
697 aa  241  4e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  33.01 
 
 
620 aa  240  5.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  29.95 
 
 
680 aa  239  9e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2400  outer membrane receptor protein  30.83 
 
 
621 aa  239  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.901841 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 
626 aa  238  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 
627 aa  237  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 
626 aa  237  6e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  31.04 
 
 
618 aa  236  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3502  putative outer membrane cobalamin receptor, TonB dependent  27.75 
 
 
623 aa  233  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.86203  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  30.29 
 
 
646 aa  232  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 
593 aa  230  6e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.81 
 
 
615 aa  228  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.46 
 
 
615 aa  228  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0995  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 
629 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.864049  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1187  outer membrane receptor for transport of vitamin B  29.07 
 
 
821 aa  226  9e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.096047  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1035  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  29.07 
 
 
685 aa  226  9e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127064  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1639  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  28.9 
 
 
685 aa  226  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1028  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  29.07 
 
 
685 aa  226  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.84 
 
 
623 aa  226  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2959  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  28.9 
 
 
685 aa  226  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2327  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  28.9 
 
 
685 aa  226  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52571  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0685  vitamin B12 receptor BtuB, putative  28.74 
 
 
685 aa  223  7e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174842  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  31.6 
 
 
621 aa  220  7e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 
615 aa  219  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 
624 aa  218  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.59 
 
 
614 aa  217  5e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 
611 aa  217  5.9999999999999996e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.74 
 
 
614 aa  216  9e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  29.58 
 
 
614 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.58 
 
 
614 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.58 
 
 
614 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.65 
 
 
614 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.26 
 
 
631 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.44 
 
 
614 aa  214  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.44 
 
 
614 aa  214  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.44 
 
 
614 aa  214  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.61 
 
 
614 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 
642 aa  213  9e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.28 
 
 
614 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 
637 aa  212  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1447  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 
632 aa  211  3e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.15 
 
 
631 aa  210  8e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.82 
 
 
630 aa  209  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.82 
 
 
630 aa  209  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 
634 aa  206  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.15 
 
 
631 aa  206  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1651  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 
648 aa  205  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.613844 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  28.39 
 
 
614 aa  204  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  26.85 
 
 
645 aa  204  5e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  27.94 
 
 
671 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.67 
 
 
631 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  26.97 
 
 
613 aa  196  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  28.08 
 
 
611 aa  191  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 
673 aa  186  9e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2213  TonB-dependent receptor plug  26.26 
 
 
621 aa  185  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604823  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  30.45 
 
 
623 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  28.38 
 
 
695 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 
692 aa  183  7e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1110  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 
625 aa  182  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000459108  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 
634 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  27.91 
 
 
617 aa  179  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  27.87 
 
 
638 aa  177  5e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  28.92 
 
 
655 aa  172  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 
634 aa  171  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  26.56 
 
 
690 aa  170  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0628  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  26.89 
 
 
638 aa  169  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288278  normal  0.81106 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  26.74 
 
 
662 aa  167  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6077  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 
656 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762724  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  29.39 
 
 
633 aa  159  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>