More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0576 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0576  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 621 aa  1269    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1964  TonB-dependent receptor, plug  49.44 
 
 		 618 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2389  TonB-dependent receptor plug  40.48 
 
 		 615 aa  412  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000607441  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2900  TonB-dependent receptor plug  41.02 
 
 		 609 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1178  TonB-dependent receptor plug  42.71 
 
 		 621 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0883  ferric enterobactin receptor, putative  40.88 
 
 		 627 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.277897  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3117  TonB-dependent receptor plug  42.76 
 
 		 619 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1830  TonB-dependent receptor plug  39.03 
 
 		 616 aa  396  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821839 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2735  TonB-dependent receptor, plug  39.32 
 
 		 650 aa  389  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1445  TonB-dependent receptor, putative  37.69 
 
 		 593 aa  382  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  36.83 
 
 		 636 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1358  TonB-dependent receptor, plug  37.62 
 
 		 626 aa  355  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00131062  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2426  TonB-dependent receptor, plug  35.08 
 
 		 652 aa  339  9e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000164352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 634 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 647 aa  107  5e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  32.55 
 
 		 614 aa  104  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 682 aa  103  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  25.34 
 
 		 639 aa  103  9e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  36.42 
 
 		 637 aa  103  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  34.43 
 
 		 665 aa  103  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  36.28 
 
 		 617 aa  103  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  34.63 
 
 		 656 aa  102  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  24.25 
 
 		 633 aa  100  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  27.79 
 
 		 686 aa  100  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 602 aa  100  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 670 aa  99  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 652 aa  98.6  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  35.38 
 
 		 653 aa  97.8  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  35.38 
 
 		 653 aa  97.1  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  35.38 
 
 		 653 aa  97.1  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  32.17 
 
 		 653 aa  96.3  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 		 653 aa  95.5  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  25.92 
 
 		 646 aa  95.1  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  34.87 
 
 		 659 aa  95.1  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  31.74 
 
 		 653 aa  95.1  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 653 aa  94.4  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  34.09 
 
 		 673 aa  94  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  31.74 
 
 		 653 aa  93.6  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  25.23 
 
 		 618 aa  92.8  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4414  TonB-dependent receptor plug  33.16 
 
 		 639 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  33.91 
 
 		 671 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1110  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 625 aa  92  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000459108  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  24.75 
 
 		 634 aa  91.3  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  33.14 
 
 		 638 aa  90.9  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  31.62 
 
 		 615 aa  90.9  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 618 aa  90.9  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  26.38 
 
 		 623 aa  90.5  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 626 aa  90.5  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  37.34 
 
 		 614 aa  89.7  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  34.27 
 
 		 612 aa  89.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1447  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 632 aa  89.7  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 626 aa  90.1  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  29.47 
 
 		 645 aa  89.4  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  25.38 
 
 		 647 aa  89.7  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  36.2 
 
 		 613 aa  89.7  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  25.88 
 
 		 628 aa  89  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 665 aa  89.7  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.59 
 
 		 728 aa  89.4  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 624 aa  88.6  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 634 aa  88.2  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  34.01 
 
 		 1023 aa  88.2  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  33.16 
 
 		 593 aa  87.8  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  35.6 
 
 		 663 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  35.6 
 
 		 663 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  35.6 
 
 		 663 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  35.6 
 
 		 663 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 697 aa  87.4  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  35.6 
 
 		 659 aa  87.8  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.12 
 
 		 630 aa  87.8  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.12 
 
 		 630 aa  87.8  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  35.6 
 
 		 663 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  32.17 
 
 		 656 aa  87.8  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  35.6 
 
 		 663 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  25.42 
 
 		 620 aa  87  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.98 
 
 		 615 aa  86.7  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  25.5 
 
 		 617 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  22.42 
 
 		 705 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  26.23 
 
 		 628 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.39 
 
 		 623 aa  85.5  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 624 aa  85.1  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  22.08 
 
 		 613 aa  85.1  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  28.89 
 
 		 613 aa  85.1  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  35.75 
 
 		 710 aa  85.1  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 710 aa  84.7  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  21.46 
 
 		 640 aa  84.7  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.08 
 
 		 653 aa  84.7  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  31.79 
 
 		 659 aa  84.3  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 688 aa  83.6  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0995  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 629 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.864049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  40.62 
 
 		 671 aa  83.2  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 627 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  40.62 
 
 		 699 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.7 
 
 		 631 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  28.12 
 
 		 630 aa  82  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  38.64 
 
 		 611 aa  81.6  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  33.14 
 
 		 642 aa  81.3  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  38.52 
 
 		 611 aa  81.6  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  35.38 
 
 		 616 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4681  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 		 704 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0656736  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 641 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>