70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3467 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3467  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 285 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0369  TonB-dependent receptor  52.19 
 
 		 782 aa  259  3e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1198  TonB-dependent receptor  37.4 
 
 		 754 aa  155  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211844 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1483  TonB-dependent receptor  37.4 
 
 		 754 aa  155  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0676  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 756 aa  123  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.102109  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 786 aa  114  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1997  TonB-dependent receptor, putative  29.03 
 
 		 741 aa  112  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0440  TonB-dependent receptor, putative  29.84 
 
 		 734 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0160  outer membrane receptor protein  32.13 
 
 		 740 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 790 aa  106  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1540  TonB-dependent receptor, putative  26.61 
 
 		 730 aa  104  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1253  TonB-dependent receptor, putative  27.27 
 
 		 740 aa  103  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0080071  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2061  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 742 aa  97.8  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.302386  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 729 aa  89  9e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 777 aa  73.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 736 aa  67.8  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 772 aa  59.7  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 828 aa  56.6  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 688 aa  55.8  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 765 aa  55.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 738 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 738 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 737 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 780 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3471  TonB-dependent siderophore receptor  33.81 
 
 		 728 aa  50.8  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 742 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  26.41 
 
 		 768 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1199  hypothetical protein  34.07 
 
 		 398 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052926 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2662  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 781 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  26.01 
 
 		 691 aa  48.9  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1484  hypothetical protein  34.07 
 
 		 398 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 799 aa  47.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  33.33 
 
 		 1023 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 777 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 841 aa  47  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 796 aa  46.6  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 777 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 777 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 762 aa  45.8  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0907  TonB-dependent siderophore receptor  27.04 
 
 		 712 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  27.39 
 
 		 784 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2497  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 873 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.842174 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  35 
 
 		 708 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3417  TonB dependent outer membrane ferrichrome-iron receptor  27.63 
 
 		 715 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3062  TonB-dependent siderophore receptor  27.63 
 
 		 715 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.173013 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2327  TonB-dependent siderophore receptor  26.49 
 
 		 790 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.929044  normal  0.271692 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 768 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  22.16 
 
 		 688 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 798 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 747 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 768 aa  43.9  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4959  TonB-dependent receptor  22.96 
 
 		 706 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 700 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 680 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 766 aa  44.3  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 764 aa  43.9  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4534  putative TonB-dependent receptor protein  23.87 
 
 		 797 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.38874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  31.58 
 
 		 882 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 		 821 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2786  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 644 aa  43.5  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.934768  normal  0.0544871 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 764 aa  43.5  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 762 aa  43.5  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  31.58 
 
 		 881 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0909  TonB-dependent siderophore receptor  26.35 
 
 		 794 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  29.03 
 
 		 708 aa  43.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  31.58 
 
 		 881 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1003  TonB-dependent siderophore receptor  30.34 
 
 		 758 aa  42.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  29.23 
 
 		 863 aa  42.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  30.17 
 
 		 728 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2103  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 873 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210734  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>