More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3471 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3471  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 728 aa  1476    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  38.36 
 
 		 811 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  38.78 
 
 		 811 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  34.33 
 
 		 708 aa  353  5e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  31.96 
 
 		 774 aa  306  7e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  32.82 
 
 		 710 aa  300  5e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  30.84 
 
 		 718 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  29.52 
 
 		 716 aa  276  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  29.85 
 
 		 727 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  31.55 
 
 		 742 aa  268  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  30.04 
 
 		 730 aa  267  5.999999999999999e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  29.06 
 
 		 727 aa  262  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1183  TonB-dependent siderophore receptor  28.39 
 
 		 757 aa  253  7e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  28.78 
 
 		 727 aa  251  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  28.96 
 
 		 728 aa  251  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0366  TonB-dependent siderophore receptor  27.81 
 
 		 750 aa  242  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0174  TonB-dependent siderophore receptor  29.07 
 
 		 772 aa  241  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.191382 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  28.3 
 
 		 726 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  29.25 
 
 		 744 aa  232  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  29 
 
 		 710 aa  224  6e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  30.29 
 
 		 768 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  29.57 
 
 		 743 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  28.67 
 
 		 729 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  29.63 
 
 		 730 aa  220  7e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  30.12 
 
 		 746 aa  220  7.999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  29.92 
 
 		 755 aa  218  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  31.19 
 
 		 729 aa  217  5.9999999999999996e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 743 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  30.35 
 
 		 729 aa  216  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 		 743 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  29.03 
 
 		 804 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 		 743 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 743 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  29.45 
 
 		 743 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  29.27 
 
 		 734 aa  214  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  28.45 
 
 		 751 aa  211  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  29.11 
 
 		 804 aa  211  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1993  TonB-dependent siderophore receptor  27.3 
 
 		 719 aa  210  6e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.811377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  29.11 
 
 		 731 aa  207  6e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 		 710 aa  206  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 		 802 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  29.11 
 
 		 753 aa  206  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  29.22 
 
 		 804 aa  204  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  29.74 
 
 		 722 aa  204  5e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  29.14 
 
 		 754 aa  203  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  29.38 
 
 		 777 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  26.78 
 
 		 705 aa  200  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  30.74 
 
 		 761 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  28.03 
 
 		 737 aa  198  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  27.45 
 
 		 725 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.24 
 
 		 704 aa  195  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  27.9 
 
 		 771 aa  196  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3692  TonB-dependent siderophore receptor  28.13 
 
 		 685 aa  196  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235893  normal  0.294422 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  26.62 
 
 		 706 aa  194  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  27.35 
 
 		 730 aa  193  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0629  putative ferric siderophore receptor protein  28.96 
 
 		 700 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  28.15 
 
 		 800 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  27.93 
 
 		 801 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  26.37 
 
 		 712 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 		 762 aa  191  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  27.82 
 
 		 801 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  26.93 
 
 		 808 aa  190  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6957  TonB-dependent siderophore receptor  27.71 
 
 		 749 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4013  TonB-dependent siderophore receptor  29.09 
 
 		 879 aa  189  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.302904 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 		 726 aa  187  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4052  TonB-dependent siderophore receptor  28.94 
 
 		 839 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  26.83 
 
 		 702 aa  185  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3757  TonB-dependent siderophore receptor  28.94 
 
 		 851 aa  185  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0566087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 708 aa  184  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1625  TonB-dependent siderophore receptor  27.49 
 
 		 746 aa  184  7e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.930758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  27.21 
 
 		 772 aa  184  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  27.21 
 
 		 772 aa  184  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0879  TonB-dependent receptor  33.79 
 
 		 378 aa  182  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.928768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  29.14 
 
 		 737 aa  183  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3719  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 		 753 aa  181  5.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525992  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4406  TonB-dependent siderophore receptor  28.93 
 
 		 709 aa  181  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684267  normal  0.0387925 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  26.66 
 
 		 729 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2858  TonB-dependent siderophore receptor  27.58 
 
 		 756 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  39.6 
 
 		 698 aa  172  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  24.85 
 
 		 742 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2294  TonB-dependent siderophore receptor  27.87 
 
 		 773 aa  171  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 		 823 aa  170  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  26.6 
 
 		 805 aa  170  8e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  25.38 
 
 		 715 aa  170  9e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  26.17 
 
 		 819 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 		 761 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0150  TonB-dependent siderophore receptor  25.56 
 
 		 729 aa  167  9e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2394  TonB-dependent siderophore receptor  24.6 
 
 		 729 aa  166  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  25.34 
 
 		 809 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.81 
 
 		 724 aa  165  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  25.19 
 
 		 724 aa  165  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3800  TonB-dependent siderophore receptor  26.46 
 
 		 712 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4496  ferric siderophore receptor protein  26.07 
 
 		 804 aa  164  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1058  TonB-dependent siderophore receptor  26.23 
 
 		 728 aa  163  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0962342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2049  TonB-dependent siderophore receptor  27.73 
 
 		 764 aa  163  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379645  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2620  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 		 770 aa  161  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526793  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1495  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.52 
 
 		 711 aa  160  8e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.454643 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2469  TonB-dependent siderophore receptor  25.59 
 
 		 768 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000279609  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2373  ferrichrome receptor FcuA  25.59 
 
 		 763 aa  159  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000216306  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  26.93 
 
 		 766 aa  159  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>