More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5451 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
823 aa  1652    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1003  TonB-dependent siderophore receptor  50.9 
 
 
758 aa  635    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  43.77 
 
 
808 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  43.04 
 
 
804 aa  572  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  41.64 
 
 
804 aa  565  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  43.9 
 
 
771 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  44.69 
 
 
722 aa  548  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  43.52 
 
 
746 aa  535  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  44.33 
 
 
725 aa  532  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  43.77 
 
 
744 aa  530  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  42.8 
 
 
754 aa  525  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  41.47 
 
 
804 aa  525  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  43.76 
 
 
722 aa  520  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  40.35 
 
 
802 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  40.26 
 
 
805 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  38.94 
 
 
801 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  38.7 
 
 
801 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  38.42 
 
 
800 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  44.25 
 
 
768 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3719  TonB-dependent siderophore receptor  42.79 
 
 
753 aa  503  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525992  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  39.44 
 
 
819 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2858  TonB-dependent siderophore receptor  42.77 
 
 
756 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578501  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  37.97 
 
 
809 aa  491  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  41.2 
 
 
772 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  41.2 
 
 
772 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  42.27 
 
 
777 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1625  TonB-dependent siderophore receptor  39.33 
 
 
746 aa  480  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.930758  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  40.34 
 
 
726 aa  481  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  41.61 
 
 
761 aa  482  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  40.72 
 
 
737 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2049  TonB-dependent siderophore receptor  42.04 
 
 
764 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379645  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  40.12 
 
 
728 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  40.26 
 
 
728 aa  475  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  41.93 
 
 
762 aa  473  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3800  TonB-dependent siderophore receptor  41.2 
 
 
712 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  40.68 
 
 
734 aa  472  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  40.67 
 
 
730 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  39.64 
 
 
761 aa  469  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  38.66 
 
 
729 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6957  TonB-dependent siderophore receptor  41.26 
 
 
749 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4013  TonB-dependent siderophore receptor  38.05 
 
 
879 aa  443  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.302904 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2620  TonB-dependent siderophore receptor  40.3 
 
 
770 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526793  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0629  putative ferric siderophore receptor protein  40.9 
 
 
700 aa  442  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4406  TonB-dependent siderophore receptor  40.43 
 
 
709 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684267  normal  0.0387925 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  39.08 
 
 
729 aa  438  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4403  TonB-dependent siderophore receptor  40.94 
 
 
773 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.109366 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3084  TonB-dependent siderophore receptor  41 
 
 
764 aa  439  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159276  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4052  TonB-dependent siderophore receptor  37.24 
 
 
839 aa  433  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  39.54 
 
 
731 aa  435  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3757  TonB-dependent siderophore receptor  37.24 
 
 
851 aa  434  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0566087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  40.11 
 
 
753 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  39.47 
 
 
737 aa  431  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  39.61 
 
 
730 aa  426  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2373  ferrichrome receptor FcuA  37.96 
 
 
763 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000216306  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1656  ferrichrome receptor FcuA  37.95 
 
 
720 aa  424  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000210688  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2469  TonB-dependent siderophore receptor  37.96 
 
 
768 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000279609  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4496  ferric siderophore receptor protein  36.42 
 
 
804 aa  423  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2294  TonB-dependent siderophore receptor  39.36 
 
 
773 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2669  putative ferric siderophore receptor protein precursor  39.3 
 
 
742 aa  412  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.765579  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  38.06 
 
 
729 aa  410  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  35.91 
 
 
755 aa  412  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1058  TonB-dependent siderophore receptor  37.13 
 
 
728 aa  399  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0962342  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2266  TonB-dependent siderophore receptor  37.14 
 
 
724 aa  391  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238084  normal  0.145177 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0825  TonB-dependent siderophore receptor  37.41 
 
 
759 aa  389  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000404003  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  30.84 
 
 
743 aa  244  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  30.77 
 
 
751 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  30.46 
 
 
743 aa  235  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  30.46 
 
 
743 aa  235  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  30.31 
 
 
743 aa  234  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  30.71 
 
 
743 aa  234  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  29.96 
 
 
743 aa  227  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  29.72 
 
 
728 aa  225  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  29.35 
 
 
729 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  29.63 
 
 
705 aa  219  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  29.67 
 
 
710 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  27.06 
 
 
811 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  29 
 
 
727 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  29.36 
 
 
726 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  28.79 
 
 
702 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.13 
 
 
724 aa  210  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  28.82 
 
 
710 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  28.83 
 
 
727 aa  209  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 
702 aa  208  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  29.49 
 
 
710 aa  204  7e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  26.5 
 
 
811 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 
724 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1183  TonB-dependent siderophore receptor  28.79 
 
 
757 aa  201  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  28.17 
 
 
712 aa  201  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  28.49 
 
 
698 aa  200  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  30.13 
 
 
707 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  30.13 
 
 
738 aa  192  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  28.37 
 
 
774 aa  192  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  29.99 
 
 
707 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  27.64 
 
 
716 aa  191  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  29.99 
 
 
707 aa  191  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  26.8 
 
 
742 aa  188  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  29.01 
 
 
708 aa  186  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 
742 aa  181  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  26.5 
 
 
755 aa  177  6e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  26.29 
 
 
708 aa  176  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>