More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2781 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  95.4 
 
 		 819 aa  1543    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  62.09 
 
 		 728 aa  853    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  61.49 
 
 		 728 aa  844    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 805 aa  1633    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  64.9 
 
 		 809 aa  1058    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  49.86 
 
 		 726 aa  658    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  48.64 
 
 		 737 aa  644    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  50.71 
 
 		 772 aa  674    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  50.71 
 
 		 772 aa  674    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  53.58 
 
 		 729 aa  750    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  44.35 
 
 		 802 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  47.34 
 
 		 761 aa  611  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  43.27 
 
 		 800 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  45.83 
 
 		 734 aa  586  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  42.39 
 
 		 801 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2373  ferrichrome receptor FcuA  43.6 
 
 		 763 aa  583  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000216306  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  41.9 
 
 		 801 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2469  TonB-dependent siderophore receptor  43.6 
 
 		 768 aa  582  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000279609  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1656  ferrichrome receptor FcuA  43.34 
 
 		 720 aa  578  1.0000000000000001e-163  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000210688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  41 
 
 		 808 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  40.1 
 
 		 804 aa  545  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  40.17 
 
 		 804 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0825  TonB-dependent siderophore receptor  42.94 
 
 		 759 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000404003  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1058  TonB-dependent siderophore receptor  40.41 
 
 		 728 aa  524  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0962342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2266  TonB-dependent siderophore receptor  42.8 
 
 		 724 aa  514  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238084  normal  0.145177 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  41.94 
 
 		 753 aa  511  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  40.26 
 
 		 823 aa  511  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  40.72 
 
 		 737 aa  492  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  37.47 
 
 		 755 aa  486  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  41.67 
 
 		 754 aa  480  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  40.56 
 
 		 729 aa  482  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  40.37 
 
 		 730 aa  474  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  40.23 
 
 		 768 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  40.06 
 
 		 744 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  40.67 
 
 		 746 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  39.74 
 
 		 771 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  37.58 
 
 		 804 aa  458  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2858  TonB-dependent siderophore receptor  38.78 
 
 		 756 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3719  TonB-dependent siderophore receptor  39.18 
 
 		 753 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525992  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2049  TonB-dependent siderophore receptor  39.22 
 
 		 764 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379645  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  39.65 
 
 		 777 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  39.62 
 
 		 762 aa  452  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  40.68 
 
 		 722 aa  451  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  37.99 
 
 		 725 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  38.43 
 
 		 761 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6957  TonB-dependent siderophore receptor  40.55 
 
 		 749 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1003  TonB-dependent siderophore receptor  38.6 
 
 		 758 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  38.97 
 
 		 722 aa  434  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4406  TonB-dependent siderophore receptor  38.2 
 
 		 709 aa  431  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684267  normal  0.0387925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3800  TonB-dependent siderophore receptor  37.89 
 
 		 712 aa  430  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3084  TonB-dependent siderophore receptor  38.48 
 
 		 764 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159276  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4403  TonB-dependent siderophore receptor  38.05 
 
 		 773 aa  415  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.109366 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1625  TonB-dependent siderophore receptor  37.37 
 
 		 746 aa  405  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.930758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3757  TonB-dependent siderophore receptor  35.34 
 
 		 851 aa  399  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0566087 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4052  TonB-dependent siderophore receptor  35.34 
 
 		 839 aa  399  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2294  TonB-dependent siderophore receptor  37.23 
 
 		 773 aa  398  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2620  TonB-dependent siderophore receptor  36.77 
 
 		 770 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526793  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4496  ferric siderophore receptor protein  35.26 
 
 		 804 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  36.74 
 
 		 729 aa  398  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  36.99 
 
 		 731 aa  395  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4013  TonB-dependent siderophore receptor  35.13 
 
 		 879 aa  395  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.302904 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0629  putative ferric siderophore receptor protein  36.34 
 
 		 700 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  33.79 
 
 		 730 aa  385  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2669  putative ferric siderophore receptor protein precursor  35.17 
 
 		 742 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.765579  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  29.37 
 
 		 811 aa  295  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  28.64 
 
 		 811 aa  289  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  30.59 
 
 		 705 aa  241  5e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  30.13 
 
 		 698 aa  234  6e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  29.32 
 
 		 728 aa  231  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1993  TonB-dependent siderophore receptor  28.35 
 
 		 719 aa  226  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.811377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  30.62 
 
 		 706 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  29.45 
 
 		 742 aa  223  8e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  31.02 
 
 		 707 aa  221  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  30.87 
 
 		 707 aa  220  7e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 		 702 aa  220  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  28.67 
 
 		 702 aa  220  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  30.87 
 
 		 707 aa  220  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  29.97 
 
 		 743 aa  219  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  29.17 
 
 		 727 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  31.69 
 
 		 738 aa  217  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  29.67 
 
 		 751 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  29.14 
 
 		 729 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  28.8 
 
 		 710 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  28.81 
 
 		 743 aa  209  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 		 743 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  27.91 
 
 		 727 aa  209  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 		 743 aa  209  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 		 743 aa  209  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  29.04 
 
 		 712 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  29.83 
 
 		 743 aa  207  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 		 742 aa  206  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  28.35 
 
 		 710 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  28.09 
 
 		 726 aa  204  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  27.68 
 
 		 710 aa  203  8e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  28.03 
 
 		 718 aa  203  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  27.79 
 
 		 708 aa  201  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.96 
 
 		 724 aa  201  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  25.28 
 
 		 716 aa  199  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 		 730 aa  197  8.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  28.41 
 
 		 724 aa  193  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>