More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4079 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  76.23 
 
 
726 aa  1154    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  93.95 
 
 
727 aa  1414    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  54.52 
 
 
728 aa  784    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
727 aa  1484    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  39.24 
 
 
707 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  39.53 
 
 
738 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  39.24 
 
 
707 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  39.24 
 
 
707 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  38.74 
 
 
742 aa  444  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  37.54 
 
 
706 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3692  TonB-dependent siderophore receptor  35.72 
 
 
685 aa  370  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235893  normal  0.294422 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  32.32 
 
 
715 aa  333  8e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 
774 aa  265  3e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  31.01 
 
 
744 aa  262  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3471  TonB-dependent siderophore receptor  29.45 
 
 
728 aa  261  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  28.49 
 
 
716 aa  257  6e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1993  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 
719 aa  256  8e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.811377  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 
730 aa  255  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 
729 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  28.64 
 
 
710 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  30.08 
 
 
727 aa  244  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  29.31 
 
 
811 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  28.63 
 
 
712 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 
710 aa  241  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  28.93 
 
 
802 aa  240  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 
811 aa  239  9e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  28.74 
 
 
737 aa  238  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  27.68 
 
 
743 aa  238  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  29.97 
 
 
726 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  29.43 
 
 
809 aa  236  8e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  27.84 
 
 
751 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  29.54 
 
 
772 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  29.54 
 
 
772 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  27.22 
 
 
743 aa  233  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1183  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 
757 aa  232  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  28.7 
 
 
742 aa  231  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  29.26 
 
 
804 aa  231  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  28.45 
 
 
705 aa  229  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  27.5 
 
 
718 aa  229  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 
708 aa  229  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  27.08 
 
 
743 aa  227  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  29.22 
 
 
755 aa  226  9e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  26.8 
 
 
743 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  26.8 
 
 
743 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 
729 aa  226  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  27.84 
 
 
702 aa  225  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  26.94 
 
 
743 aa  224  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  27.99 
 
 
702 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 
800 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  29.22 
 
 
804 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  29.46 
 
 
730 aa  219  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  27.82 
 
 
730 aa  219  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0174  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 
772 aa  219  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.191382 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 
728 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  27.84 
 
 
754 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  27.97 
 
 
808 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  29.32 
 
 
768 aa  217  7e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  27.81 
 
 
729 aa  216  9e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  28.23 
 
 
801 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  28.98 
 
 
722 aa  216  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  27.93 
 
 
801 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.65 
 
 
724 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 
729 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  28.78 
 
 
728 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  29.2 
 
 
710 aa  213  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.52 
 
 
704 aa  211  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  27.24 
 
 
724 aa  211  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  27.2 
 
 
725 aa  210  7e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  29 
 
 
823 aa  210  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  29.13 
 
 
771 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0366  TonB-dependent siderophore receptor  24.69 
 
 
750 aa  209  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167728  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 
805 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 
753 aa  207  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  26.68 
 
 
731 aa  206  9e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  26.97 
 
 
804 aa  206  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1495  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.35 
 
 
711 aa  205  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.454643 
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  27.2 
 
 
746 aa  204  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 
698 aa  202  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  27.79 
 
 
737 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4496  ferric siderophore receptor protein  27.31 
 
 
804 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  27.29 
 
 
819 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  26.97 
 
 
777 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2394  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 
729 aa  194  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 
722 aa  193  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  27.91 
 
 
761 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1625  TonB-dependent siderophore receptor  25.66 
 
 
746 aa  189  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.930758  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6957  TonB-dependent siderophore receptor  27.95 
 
 
749 aa  188  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2049  TonB-dependent siderophore receptor  27.65 
 
 
764 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379645  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  27.57 
 
 
734 aa  187  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0150  TonB-dependent siderophore receptor  26.38 
 
 
729 aa  187  8e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2858  TonB-dependent siderophore receptor  26.87 
 
 
756 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578501  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  26.18 
 
 
708 aa  185  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  28.31 
 
 
762 aa  184  7e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  26.46 
 
 
761 aa  180  9e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3800  TonB-dependent siderophore receptor  26.82 
 
 
712 aa  177  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0879  TonB-dependent receptor  32.17 
 
 
378 aa  177  6e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.928768  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2266  TonB-dependent siderophore receptor  27.19 
 
 
724 aa  172  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238084  normal  0.145177 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1656  ferrichrome receptor FcuA  26.91 
 
 
720 aa  172  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000210688  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2373  ferrichrome receptor FcuA  26.86 
 
 
763 aa  169  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000216306  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4403  TonB-dependent siderophore receptor  27.58 
 
 
773 aa  169  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.109366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>