More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1183 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1183  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 757 aa  1542    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0366  TonB-dependent siderophore receptor  40.83 
 
 		 750 aa  504  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0174  TonB-dependent siderophore receptor  39.97 
 
 		 772 aa  499  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.191382 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  40.4 
 
 		 716 aa  474  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  38.09 
 
 		 742 aa  467  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  37.99 
 
 		 730 aa  464  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  39.53 
 
 		 774 aa  464  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  39.2 
 
 		 727 aa  462  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  37.78 
 
 		 718 aa  448  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1289  TonB-dependent receptor domain-containing protein  32.2 
 
 		 727 aa  330  8e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00967025  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1560  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 		 714 aa  300  6e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.3619  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1610  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 733 aa  291  3e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3471  TonB-dependent siderophore receptor  28.39 
 
 		 728 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0879  TonB-dependent receptor  38.18 
 
 		 378 aa  249  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.928768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 		 727 aa  232  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  28.13 
 
 		 727 aa  230  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  27.45 
 
 		 811 aa  226  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  27.64 
 
 		 726 aa  225  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 728 aa  223  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 811 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1993  TonB-dependent siderophore receptor  26.71 
 
 		 719 aa  208  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.811377  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.46 
 
 		 724 aa  205  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  27.65 
 
 		 710 aa  204  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  27.6 
 
 		 771 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  25.88 
 
 		 751 aa  201  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  28.79 
 
 		 823 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  25.6 
 
 		 743 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  26.36 
 
 		 708 aa  201  6e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  28.82 
 
 		 744 aa  200  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  27.14 
 
 		 724 aa  197  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  27.3 
 
 		 698 aa  196  9e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  26.29 
 
 		 729 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  25.57 
 
 		 743 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  25.18 
 
 		 743 aa  196  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  26.17 
 
 		 710 aa  193  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  25.42 
 
 		 743 aa  193  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  25.42 
 
 		 743 aa  193  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  26.87 
 
 		 742 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 743 aa  191  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  26.53 
 
 		 738 aa  190  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 712 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  27.29 
 
 		 731 aa  187  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 710 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  27.73 
 
 		 706 aa  187  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  27.16 
 
 		 729 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 		 737 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  26.24 
 
 		 707 aa  185  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.15 
 
 		 704 aa  183  8.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 		 707 aa  183  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 		 707 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  26.81 
 
 		 808 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  27.55 
 
 		 746 aa  181  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  25.85 
 
 		 772 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  25.85 
 
 		 772 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  24.69 
 
 		 705 aa  179  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  27.66 
 
 		 804 aa  179  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 725 aa  177  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  25.74 
 
 		 726 aa  177  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  28.09 
 
 		 777 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  27.3 
 
 		 804 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  26.4 
 
 		 753 aa  173  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  25.34 
 
 		 702 aa  172  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  27.33 
 
 		 722 aa  171  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  24.69 
 
 		 702 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  25.1 
 
 		 728 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1656  ferrichrome receptor FcuA  25.85 
 
 		 720 aa  166  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000210688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1003  TonB-dependent siderophore receptor  27.55 
 
 		 758 aa  166  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2469  TonB-dependent siderophore receptor  25.95 
 
 		 768 aa  164  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000279609  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2373  ferrichrome receptor FcuA  25.95 
 
 		 763 aa  164  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000216306  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  25.69 
 
 		 722 aa  163  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  25.55 
 
 		 801 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6957  TonB-dependent siderophore receptor  26.73 
 
 		 749 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3692  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 685 aa  162  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235893  normal  0.294422 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  25.59 
 
 		 754 aa  162  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  27.1 
 
 		 737 aa  162  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  25.36 
 
 		 809 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 		 761 aa  160  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  26.23 
 
 		 715 aa  160  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4406  TonB-dependent siderophore receptor  27.5 
 
 		 709 aa  159  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684267  normal  0.0387925 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1080  TonB dependent receptor  32.84 
 
 		 335 aa  158  4e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  24.8 
 
 		 804 aa  157  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  27.77 
 
 		 729 aa  156  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  25.65 
 
 		 800 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2858  TonB-dependent siderophore receptor  25.85 
 
 		 756 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  25.59 
 
 		 805 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4496  ferric siderophore receptor protein  24.13 
 
 		 804 aa  153  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0150  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 		 729 aa  152  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  25.53 
 
 		 729 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  24.58 
 
 		 728 aa  151  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  27.16 
 
 		 755 aa  148  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  25.95 
 
 		 761 aa  147  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0629  putative ferric siderophore receptor protein  26.04 
 
 		 700 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  25.28 
 
 		 819 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  23.8 
 
 		 708 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1625  TonB-dependent siderophore receptor  24.63 
 
 		 746 aa  142  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.930758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  25.82 
 
 		 734 aa  141  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1058  TonB-dependent siderophore receptor  25.25 
 
 		 728 aa  139  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0962342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3719  TonB-dependent siderophore receptor  24.25 
 
 		 753 aa  138  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525992  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4052  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 839 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  31.76 
 
 		 768 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>