More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4496 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4496  ferric siderophore receptor protein  100 
 
 		 804 aa  1607    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  47.6 
 
 		 754 aa  617  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  44.5 
 
 		 744 aa  605  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  47.16 
 
 		 768 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  47.49 
 
 		 746 aa  589  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  41.21 
 
 		 808 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  39.79 
 
 		 804 aa  545  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  41.58 
 
 		 731 aa  509  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  41.43 
 
 		 729 aa  510  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0629  putative ferric siderophore receptor protein  42.88 
 
 		 700 aa  496  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4406  TonB-dependent siderophore receptor  41.52 
 
 		 709 aa  477  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684267  normal  0.0387925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  37.75 
 
 		 804 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  38.48 
 
 		 804 aa  452  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  36.85 
 
 		 823 aa  415  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 		 800 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  37.27 
 
 		 772 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  37.27 
 
 		 772 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  35.26 
 
 		 805 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  34.96 
 
 		 819 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  33.25 
 
 		 802 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  37.13 
 
 		 734 aa  393  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  37.15 
 
 		 762 aa  393  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  32.99 
 
 		 801 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  35.72 
 
 		 725 aa  394  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  32.39 
 
 		 801 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  36.92 
 
 		 777 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  36.98 
 
 		 726 aa  385  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 809 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  34.82 
 
 		 771 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  36.17 
 
 		 737 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  34.78 
 
 		 722 aa  371  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3719  TonB-dependent siderophore receptor  35.68 
 
 		 753 aa  372  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525992  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2049  TonB-dependent siderophore receptor  34.63 
 
 		 764 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379645  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2858  TonB-dependent siderophore receptor  34.23 
 
 		 756 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1625  TonB-dependent siderophore receptor  32.39 
 
 		 746 aa  364  3e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.930758  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  34.41 
 
 		 728 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  35.72 
 
 		 722 aa  363  6e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  34.88 
 
 		 761 aa  363  8e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6957  TonB-dependent siderophore receptor  35.97 
 
 		 749 aa  361  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1003  TonB-dependent siderophore receptor  35.6 
 
 		 758 aa  359  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3800  TonB-dependent siderophore receptor  36 
 
 		 712 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  32.62 
 
 		 730 aa  357  3.9999999999999996e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  33.87 
 
 		 729 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  34.02 
 
 		 728 aa  353  5e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  34.81 
 
 		 761 aa  349  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2469  TonB-dependent siderophore receptor  33.75 
 
 		 768 aa  348  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000279609  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2373  ferrichrome receptor FcuA  33.75 
 
 		 763 aa  348  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000216306  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3084  TonB-dependent siderophore receptor  34.58 
 
 		 764 aa  346  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159276  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1656  ferrichrome receptor FcuA  33.57 
 
 		 720 aa  345  2e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000210688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  34.06 
 
 		 755 aa  340  7e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3757  TonB-dependent siderophore receptor  32.55 
 
 		 851 aa  335  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0566087 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4013  TonB-dependent siderophore receptor  31.91 
 
 		 879 aa  333  7.000000000000001e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.302904 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  34.94 
 
 		 737 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4052  TonB-dependent siderophore receptor  31.81 
 
 		 839 aa  327  5e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0825  TonB-dependent siderophore receptor  32.54 
 
 		 759 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000404003  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4403  TonB-dependent siderophore receptor  34.82 
 
 		 773 aa  306  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.109366 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2266  TonB-dependent siderophore receptor  33.47 
 
 		 724 aa  306  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238084  normal  0.145177 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2669  putative ferric siderophore receptor protein precursor  33.14 
 
 		 742 aa  303  6.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.765579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2620  TonB-dependent siderophore receptor  33.72 
 
 		 770 aa  301  4e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526793  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 		 730 aa  299  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2294  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 		 773 aa  298  3e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1058  TonB-dependent siderophore receptor  31.51 
 
 		 728 aa  296  7e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0962342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  31.84 
 
 		 753 aa  293  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  32.21 
 
 		 729 aa  286  9e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  30.21 
 
 		 728 aa  243  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 		 727 aa  206  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  29.24 
 
 		 743 aa  205  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  29.88 
 
 		 743 aa  204  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  29.88 
 
 		 743 aa  204  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  29.16 
 
 		 743 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  30.25 
 
 		 743 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 727 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  27.29 
 
 		 726 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  29.47 
 
 		 743 aa  198  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  30.25 
 
 		 751 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  29.17 
 
 		 729 aa  190  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 710 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 707 aa  178  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 		 742 aa  178  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 707 aa  177  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 		 738 aa  177  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 707 aa  177  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  26.42 
 
 		 715 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  28.34 
 
 		 698 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.51 
 
 		 724 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  25.54 
 
 		 716 aa  174  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 		 710 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 		 712 aa  173  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  29.06 
 
 		 702 aa  172  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  28.12 
 
 		 705 aa  171  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  28.8 
 
 		 724 aa  171  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  27.22 
 
 		 774 aa  169  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  28.64 
 
 		 702 aa  167  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  24.85 
 
 		 811 aa  165  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3471  TonB-dependent siderophore receptor  26.07 
 
 		 728 aa  164  6e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  26.17 
 
 		 706 aa  160  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  26.19 
 
 		 718 aa  156  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  26.62 
 
 		 730 aa  155  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  26.56 
 
 		 710 aa  154  8.999999999999999e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1183  TonB-dependent siderophore receptor  24.13 
 
 		 757 aa  153  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>