More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3243 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  60.6 
 
 		 819 aa  833    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  91.07 
 
 		 728 aa  1361    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 728 aa  1489    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  61.49 
 
 		 805 aa  843    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  63.32 
 
 		 809 aa  886    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  49.71 
 
 		 726 aa  661    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  49.41 
 
 		 737 aa  644    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  48.71 
 
 		 772 aa  676    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  60.98 
 
 		 729 aa  917    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  48.71 
 
 		 772 aa  676    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  46.31 
 
 		 761 aa  629  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  44.55 
 
 		 734 aa  585  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1656  ferrichrome receptor FcuA  42.84 
 
 		 720 aa  584  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000210688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2469  TonB-dependent siderophore receptor  42.68 
 
 		 768 aa  581  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000279609  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2373  ferrichrome receptor FcuA  42.68 
 
 		 763 aa  581  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000216306  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1058  TonB-dependent siderophore receptor  40.57 
 
 		 728 aa  546  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0962342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0825  TonB-dependent siderophore receptor  43.71 
 
 		 759 aa  545  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000404003  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  41.98 
 
 		 753 aa  526  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  41.67 
 
 		 737 aa  524  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  40.81 
 
 		 729 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  41.65 
 
 		 802 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2266  TonB-dependent siderophore receptor  40.54 
 
 		 724 aa  506  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238084  normal  0.145177 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  41.56 
 
 		 730 aa  499  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  40.83 
 
 		 800 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  40.62 
 
 		 801 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  39.37 
 
 		 804 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  40.62 
 
 		 801 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  39.26 
 
 		 746 aa  486  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  37.16 
 
 		 755 aa  484  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  38.51 
 
 		 804 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  39.77 
 
 		 768 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  37.48 
 
 		 754 aa  479  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  40.26 
 
 		 823 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  39.75 
 
 		 771 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2858  TonB-dependent siderophore receptor  38.96 
 
 		 756 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  37.5 
 
 		 808 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3719  TonB-dependent siderophore receptor  38.78 
 
 		 753 aa  466  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525992  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  40.46 
 
 		 722 aa  461  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  38.65 
 
 		 744 aa  462  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2049  TonB-dependent siderophore receptor  38.2 
 
 		 764 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379645  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  38.52 
 
 		 761 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  36.83 
 
 		 762 aa  437  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  37.62 
 
 		 725 aa  436  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4406  TonB-dependent siderophore receptor  38.58 
 
 		 709 aa  435  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684267  normal  0.0387925 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1003  TonB-dependent siderophore receptor  38.46 
 
 		 758 aa  430  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6957  TonB-dependent siderophore receptor  37.26 
 
 		 749 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  37.08 
 
 		 777 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4403  TonB-dependent siderophore receptor  38.37 
 
 		 773 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.109366 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  36.8 
 
 		 722 aa  419  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  35.24 
 
 		 804 aa  414  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2620  TonB-dependent siderophore receptor  37.08 
 
 		 770 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526793  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0629  putative ferric siderophore receptor protein  35.59 
 
 		 700 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3084  TonB-dependent siderophore receptor  36.61 
 
 		 764 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159276  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3800  TonB-dependent siderophore receptor  35.39 
 
 		 712 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1625  TonB-dependent siderophore receptor  36.05 
 
 		 746 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.930758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4052  TonB-dependent siderophore receptor  37.27 
 
 		 839 aa  397  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2294  TonB-dependent siderophore receptor  36.55 
 
 		 773 aa  398  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3757  TonB-dependent siderophore receptor  37.27 
 
 		 851 aa  398  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0566087 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4013  TonB-dependent siderophore receptor  37.65 
 
 		 879 aa  395  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.302904 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2669  putative ferric siderophore receptor protein precursor  37.02 
 
 		 742 aa  388  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.765579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  35.32 
 
 		 731 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  34.45 
 
 		 729 aa  383  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  33.48 
 
 		 730 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4496  ferric siderophore receptor protein  34.02 
 
 		 804 aa  354  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  29.84 
 
 		 811 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  29.42 
 
 		 811 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  30.95 
 
 		 738 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  31.16 
 
 		 707 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  31.01 
 
 		 707 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  31.01 
 
 		 707 aa  234  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  28.59 
 
 		 705 aa  219  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  27.97 
 
 		 728 aa  219  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  28.83 
 
 		 727 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  28.78 
 
 		 727 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 		 698 aa  209  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 742 aa  205  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  28.27 
 
 		 726 aa  201  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 		 706 aa  200  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  26.04 
 
 		 702 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 702 aa  198  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.98 
 
 		 724 aa  198  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 751 aa  197  8.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3692  TonB-dependent siderophore receptor  29.32 
 
 		 685 aa  195  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235893  normal  0.294422 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  27.05 
 
 		 743 aa  195  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  27.02 
 
 		 743 aa  194  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 		 742 aa  191  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 729 aa  191  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  27.07 
 
 		 710 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 710 aa  187  8e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 743 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  27 
 
 		 710 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 743 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  27.39 
 
 		 708 aa  185  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  25.79 
 
 		 743 aa  184  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  27.86 
 
 		 718 aa  182  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  24.5 
 
 		 715 aa  182  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  26.86 
 
 		 724 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  27.26 
 
 		 708 aa  180  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  25.41 
 
 		 774 aa  180  9e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  26.16 
 
 		 743 aa  179  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>